| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,899,997 | A→G | 5.5% | H524R (CAT→CGT) | pdeD → | putative c‑di‑GMP phosphodiesterase PdeD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,899,997 | 0 | A | G | 5.5% | 394.7 / 9.1 | 129 | H524R (CAT→CGT) | pdeD | putative c‑di‑GMP phosphodiesterase PdeD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (56/65); new base G (3/4); total (59/70) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.46e-01 | |||||||||||
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
GGAAACGCAAGAACAGGCGAAGTATTTGCGCCGTCATGGCGTGCATATTTTGCAAGGGTATTTGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGATCAACACGATAATCATTGGCTTCAATGATGGTGATATGCAGTGGCCCTACATCAATCACATCGCCCAC > NC_000913/1899854‑1900145 | ggAAACGCAAGAACAGGCGAAGTATTTGCGCCGTCATGGCGTGCATATTTTGCAAGGGTATTTGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCAc > 2:1870690/1‑150 (MQ=255) gAAACGCAAGAACAGGCGAAGTATTTGCGCCGTCATGGCGTGCATATTTTGCAAGGGTATTTGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAACTGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACg < 1:2204442/150‑1 (MQ=255) aaaCGCAAGAACAGGCGAAGTATTTGCGCCGTCATGGCGTGCATATTTTGCAAGGGTATTTGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGc > 1:1305744/1‑150 (MQ=255) aaCGCAAGAACAGGCGAAGTATTTGCGCCGTCATGGCGTGCATATTTTGCAAGGGTATTTGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGcc < 1:2457639/150‑1 (MQ=255) aCGCAAGAACAGGCGAAGTATTTGCGCCGTCATGGCGTGCATATTTTGCAAGGGTATTTGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGccc < 2:1627258/150‑1 (MQ=255) cGCAAGAACAGGCGAAGTATTTGCGCCGTCATGGCGTGCATATTTTGCAAGGGTATTTGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCa < 2:1669721/150‑1 (MQ=255) cGCAAGAACAGGCGAAGTATTTGCGCCGTCATGGCGTGCATATTTTGCAAGGGTATTTGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCa > 1:713717/1‑150 (MQ=255) cGCAAGAACAGGCGAAGTATTTGCGCCGTCATGGCGTGCATATTTTGCAAGGGTATTTGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCa > 2:227173/1‑150 (MQ=255) gCAAGAACAGGCGAAGTATTTGCGCCGTCATGGCGTGCATATTTTGCAAGGGTATTTGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCAt > 2:620335/1‑150 (MQ=255) cAAGAACAGGCGAAGTATTTGCGCCGTCATGGCGTGCATATTTTGCAAGGGTATTTGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCAtt > 1:2275370/1‑150 (MQ=255) aGAACAGGCGAAGTATTTGCGCCGTCATGGCGTGCATATTTTGCAAGGGTATTTGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTAt > 1:2038316/1‑150 (MQ=255) gAACAGGCGAAGTATTTGCGCCGTCATGGCGTGCATATTTTGCAAGGGTATTTGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATg > 1:1691464/1‑150 (MQ=255) aaCAGGCGAAGTATTTGCGCCGTCATGGCGTGCATATTTTGCAAGGGTATTTGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGc < 2:1853246/150‑1 (MQ=255) cAGGCGAAGTATTTGCGCCGTCATGGCGTGCATATTTTGCAAGGGTATTTGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGGCGTGATATGTCCATTATGCcg < 1:2479410/150‑1 (MQ=255) cAGGCGAAGTATTTGCGCCGTCATGGCGTGCATATTTTGCAAGGGTATTTGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGGCGTGATATGTCCATTATGCcg < 1:1225529/150‑1 (MQ=255) cAGGCGAAGTATTTGCGCCGTCATGGCGTGCATATTTTGCAAGGGTATTTGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCcg < 1:1750023/150‑1 (MQ=255) aGGCGAAGTATTTGCGCCGTCATGGCGTGCATATTTTGCAAGGGTATTTGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCcgt < 1:2316621/150‑1 (MQ=255) ggCGAAGTATTTGCGCCGTCATGGCGTGCATATTTTGCAAGGGTATTTGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGGCGTGATATGTCCATTATGCcggg < 1:1414277/150‑3 (MQ=255) ggCGAAGTATTTGCGCCGTCATGGCGTGCATATTTTGCAAGGGTATTTGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTAAGCcgtt > 2:1466001/1‑150 (MQ=255) ggCGAAGTATTTGCGCCGTCATGGCGTGCATATTTTGCAAGGGTATTTGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGCCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCcgtt > 2:2451854/1‑150 (MQ=255) gTATTTGCGCCGTCATGGCGTGCATATTTTGCAAGGGTATTTGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCcgttacgtta < 1:522656/150‑1 (MQ=255) cgcCGTCATGGCGTGCATATTTTGCAAGGGTATTTGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTa > 2:2409850/1‑150 (MQ=255) cgcCGTCATGGCGTGCATATTTTGCAAGGGTATTTGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTa > 2:2418245/1‑150 (MQ=255) gcCGTCATGGCGTGCATATTTTGCAAGGGTATTTGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTAc > 1:2350140/1‑150 (MQ=255) ccGTCATGGCGTGCATATTTTGCAAGGGTATTTGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGGCGTGATATGTCCATTATGCcg > 2:591621/1‑133 (MQ=38) gTCATGGCGTGCATATTTTGCAAGGGTATTTGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTTCTCa < 2:1481845/150‑1 (MQ=255) tCATGGCGTGCATATTTTGCAAGGGTATTTGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCAt > 1:42204/1‑150 (MQ=255) tGGCGTGCATATTTTGCAAGGGTATTTGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCtt > 2:1468501/1‑150 (MQ=255) tGCATATTTTGCAAGGGTATTTGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCg < 1:922546/150‑1 (MQ=255) gCATATTTTGCAAGGGTATTTGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGt < 1:1475605/150‑1 (MQ=255) gCATATTTTGCAAGGGTATTTGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGt > 1:862361/1‑150 (MQ=255) atatTTTGCAAGGGTATTTGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTgc < 1:620335/150‑1 (MQ=255) tatTTTGCAAGGGTATTTGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTgcg < 1:77099/150‑1 (MQ=255) ttttGCAAGGGTATTTGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGcc < 1:231508/150‑1 (MQ=255) gCAAGGGTATTTGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGtt < 2:786859/150‑1 (MQ=255) gCAAGGGTATTTGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGtt > 1:2330517/1‑150 (MQ=255) gCAAGGGTATTTGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGtt < 1:1619311/150‑1 (MQ=255) cAAGGGTATTTGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCTCCGCCCGCCCGGCATAATTGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTg < 1:2197768/150‑1 (MQ=255) aaGGGTATTTGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGc < 1:1714189/150‑1 (MQ=255) aaGGGTATTTGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGc < 1:2259176/150‑1 (MQ=255) aGGGTATTTGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGct > 1:1131975/1‑150 (MQ=255) tttGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTaa < 2:1800661/150‑1 (MQ=255) ttGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGTATTTATTTTTATGATTATGCGTTTACGTTTATGTTTACTGATCTTCATTGTTTGCCTTTTGGTCTTTatc < 2:721556/150‑3 (MQ=255) ttGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAAc < 2:950582/150‑1 (MQ=255) tGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACa < 1:420891/150‑1 (MQ=255) tGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACa > 2:1013902/1‑150 (MQ=255) gtcctcacaTCCGATGCCGGTACTTGATTTTCCC‑ACTGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGGATTATGGACATATGACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGGTTACTCATGTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAAt < 1:2415941/145‑1 (MQ=255) cGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGc > 2:2324330/1‑150 (MQ=255) cGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGc < 2:2038316/150‑1 (MQ=255) gCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGACATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCg > 1:2110729/1‑150 (MQ=255) cacaGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGa > 1:1742085/1‑150 (MQ=255) cacaGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGa < 1:2061564/150‑1 (MQ=255) aGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAAcc < 1:1870690/150‑1 (MQ=255) aGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGCCGGGCAGCCAACCGCCGGCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAAcc < 2:1324597/150‑1 (MQ=255) ccGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAg < 1:2426244/150‑1 (MQ=255) cGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGa > 1:2460746/1‑150 (MQ=255) cGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGa < 1:1752639/150‑1 (MQ=255) gATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGAt > 1:1540337/1‑150 (MQ=255) aTGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGATc < 2:713717/150‑1 (MQ=255) gCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGATCaa > 2:991570/1‑150 (MQ=255) gCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGATCaa > 2:1245607/1‑150 (MQ=255) cGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGATCAaca < 2:770881/150‑1 (MQ=255) cGCTACGTGATTATCCCAAATGGCTGCCCGGCAGCCAACCGCCGCCCGACCGCAATAATGCACATATCACGCCCATTATGCCCTTACCTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCCCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGATCAaca > 1:1070314/1‑150 (MQ=255) gCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGATCAacac < 1:470664/150‑1 (MQ=255) cGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGATCAACACGATa > 1:997854/1‑150 (MQ=255) gTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGATCAACACGATaa > 1:1795226/1‑150 (MQ=255) tGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCAGCCCGGCATAATGGACATATCCCGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTAACTCATCTTCATAGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGATCAACACGATaaa > 1:1555672/1‑149 (MQ=255) aTTTTCCCAAATGGCTTGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTTTTTTTTTTTATTTTTAAGTATTCGAACGAGATCTACACGATAATCa < 2:1608345/150‑1 (MQ=255) aTTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCTCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGCTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGGGCCGGTTTCTCTTTAACAATTCGAACGAGATCAACACGATAATCa < 2:1244136/150‑1 (MQ=255) aTTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGATCAACACGATAGTCa > 2:2443593/1‑150 (MQ=255) ttCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATTGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGATCAACACGATAATCATTg < 1:1090784/150‑1 (MQ=255) cAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCGCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGATCAACACGATAATCATTGGCtt > 1:824785/1‑150 (MQ=255) ctggcGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGATCAACACGATAATCATTGGCTTCAatgat > 2:268235/1‑150 (MQ=255) ctggcGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTAAGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGATCAACACGATAATCATTGGCTTCAatgat < 1:1466001/150‑1 (MQ=255) tggcGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTATAACAATGCGAACCAGATCAACACGATAATCATTGGCTTCAatgatg > 2:1402703/1‑150 (MQ=255) cGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGATCAACACGATAATCATTGGCTTCAATGATGGTg > 1:1097869/1‑150 (MQ=255) gCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGATCAACACGATAATCATTGGCTTCAATGATGGTGata < 1:313961/150‑1 (MQ=255) gCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGATCAACACGATAATCATTGGCTTCAATGATGGTGata > 1:865466/1‑150 (MQ=255) aGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGATCAACACGATAATCATTGGCTTCAATGATGGTGATATg < 1:1249247/150‑1 (MQ=255) gCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGATCAACACGATAATCATTGGCTTCAATGATGGTGATATGc > 2:602547/1‑150 (MQ=255) gCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGATCAACACGATAATCATTGGCTTCAATGATGGTGATATGc > 1:1433188/1‑150 (MQ=255) gCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGATCAACACGATAATCATTGGCTTCAATGATGGTGATATGc > 2:971015/1‑150 (MQ=255) ccAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGATCAACACGATAATCATTGGCTTCAATGATGGTGATATGCa > 1:659807/1‑150 (MQ=255) aaCCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGATCAACACGATAATCATTGGCTTCAATGATGGTGATATGCAGt < 1:1387093/150‑1 (MQ=255) aaCCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGATCAACACGATAATCATTGGCTTCAATGATGGTGATATGCAGt < 1:57705/150‑1 (MQ=255) aCCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGCTCAACACGATAATCATTGGGTTCAAAGAAGGTGATATGCAGTg > 2:2351994/1‑150 (MQ=255) ccgccgCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTAATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGATCAACACGATAATCATTGGCTTCAATGATGGTGATATGCAGTgg > 2:2449564/1‑150 (MQ=255) ccgcccgcCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGATCAACACGATAATCATTGGCTTCAATGATGGTGATATGCAGTGGccc < 1:519300/150‑1 (MQ=255) ccgcccgGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGATCAACACGATAATCATTGGCTTCAATGATGGTGATATGCAGTGGCCCTACa < 2:2017325/150‑1 (MQ=255) cgcccgGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGATCTTTAACAATGCGAACCAGATCAACACGATAATCATTGGCTTCAATGATGGTGATATGCAGTGGCCCTACat < 2:1515430/150‑1 (MQ=255) taacgGCATAATGGGCGTGATATGTCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGATCAACACGATAATCATTGGCTTCAATGATGGTGATATGCAGTGGCCCTACatc > 1:288155/4‑150 (MQ=38) gcccgGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGATCAACACGATAATCATTGGCTTCAATGATGGTGATATGCAGTGGCCCTACatc < 2:2350140/150‑1 (MQ=255) gcccgGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAAAGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGATCAACACGATAATCATTGGCTTCAATGATGGTGATATGCAGTGGCCCTACatc > 2:1957297/1‑150 (MQ=255) ccgGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCTGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGATCAACACGATAATCATTGGCTTCAATGATGGTGATATGCAGTGGCCCTACatcaa < 1:1464612/150‑1 (MQ=255) ccgGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGATCAACACGATAATCATTGGCTTCAATGATGGTGATATGCAGTGGCCCTACatcaa < 1:1324512/150‑1 (MQ=255) cgGCATAATGGGCGTGATATGTCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGATCAACAAGATAATCATTGGCTTCAATGATGGTGATATGCAGTGGCCCTACatcaat > 2:2238536/1‑150 (MQ=255) aTAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGATCAACACGATAATCATTGGCTTCAATGATGGTGATATGCAGTGGCCCTACATCAATcaca < 1:1009083/150‑1 (MQ=255) tGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTTCTCTTTAACAATGCGAACCAGATCAACACGATAATCATTGGCTTCAATGATGGTGATATGCAGTGGCCCTACATCAATCACATCGc < 2:1417671/150‑1 (MQ=255) gACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGATCAACACGATAATCATTGGCTTCAATGATGGTGATATGCAGTGGCCCTACATCAATCACATCGccc > 2:463432/1‑150 (MQ=255) cATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGATCAACACGATAATCATTGGCTTCAATGATGGTGATATGCAGTGGCCCTACATCAATCACATCGCCcac < 2:1691464/150‑1 (MQ=255) | GGAAACGCAAGAACAGGCGAAGTATTTGCGCCGTCATGGCGTGCATATTTTGCAAGGGTATTTGTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGATCAACACGATAATCATTGGCTTCAATGATGGTGATATGCAGTGGCCCTACATCAATCACATCGCCCAC > NC_000913/1899854‑1900145 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |