| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,060,271 | C→G | 7.3% | G215A (GGT→GCT) ‡ | cbl ← | DNA‑binding transcriptional activator Cbl |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,060,271 | 0 | C | G | 7.3% | 477.5 / 20.5 | 146 | G215A (GGT→GCT) ‡ | cbl | DNA‑binding transcriptional activator Cbl |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (68/67); new base G (2/9); total (70/76) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.80e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.58e-01 | |||||||||||
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
AAAGATGCCGCGTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTAAGTGATTAACGGCCACTTCGCTATTGATTCCAGCGTCAATGGTGAAATTTGCGTCAAGGGATGATCGTGTGGAACAAGCAAACTATGGTGCCAA > NC_000913/2060122‑2060420 | aaaGATGCCGCGTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAAc < 1:905833/150‑1 (MQ=255)aaaGATGCCGCGTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAAc < 1:400103/150‑1 (MQ=255) aaGATGCCGCGTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAAcc < 2:614961/150‑1 (MQ=255) aGATGCCGCGTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCt < 2:1745990/150‑1 (MQ=255) gCCGCGTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGc > 1:1579018/1‑150 (MQ=255) cgcgTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCgg < 2:923969/150‑1 (MQ=255) ttATCCTGGCGTATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTAGCCACTGGATTGCTCGGAAACTTATCCGATCACAAGCGCAAGATGTACATAGGTTTTAATGACATCAGAATTCTGCGCACTTAATACAATATCTTCCTGCAAACCTTTGCGGGCa < 2:2087775/149‑1 (MQ=255) gTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCCGCAAAGGTTTGCTGGCa < 1:1124289/150‑1 (MQ=255) gTATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCCGCAAAGGTTTGCTGGCa < 2:1972564/150‑1 (MQ=255) tATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCCGCAAAGGTTTGCTGGCag < 1:1561102/150‑2 (MQ=255) tATCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCaa > 2:330952/1‑150 (MQ=255) aTCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCCGCAAAGGTTTGCTGGCaga < 1:514432/150‑3 (MQ=255) tCCAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCCGCAAAGGTTTGCTGGCAGAt < 1:2412441/150‑1 (MQ=255) cAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCCGCAAAGGTTTGCTGGCAGAtat < 2:611762/150‑3 (MQ=255) cAGGCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCCGCAAAGGTTTGCTGGCAGAtat < 2:1861376/150‑3 (MQ=255) ggCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGt > 1:727570/1‑150 (MQ=255) gCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGtc < 2:1304388/150‑1 (MQ=255) gCGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGtc > 1:2257679/1‑150 (MQ=255) cGGATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGtca < 2:229531/150‑1 (MQ=255) gATTAAATTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACTTCAGAATCCTGCGCACTTAATAGAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGtcatc < 2:1665322/150‑1 (MQ=255) aaaTTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATa < 2:564656/150‑1 (MQ=255) aaTTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATAc < 2:2152964/150‑1 (MQ=255) aTTCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACg < 1:1375547/150‑1 (MQ=255) ttCTCTTCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGt < 2:508725/150‑1 (MQ=255) ttCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAgcg < 1:1569346/150‑1 (MQ=255) ttCCTCTTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAgcg < 2:811890/150‑1 (MQ=255) ctctTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGccc < 1:1258716/150‑1 (MQ=255) tttGTTCTCAACTTGATTTATAGGAAACTAATACGATCGCAAGCCCAAGATCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCATTTAATACAATATCTGCCATCAAACCTTTGCGGGAAAATGTGTCATCAATAAGTGAGCGCCCCg < 2:1040124/149‑1 (MQ=255) ctTGTTCGCCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCg < 1:13411/150‑1 (MQ=255) gTTCGGCACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGtga > 1:1657559/1‑148 (MQ=255) ccACTGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATcccc > 1:1852423/1‑150 (MQ=255) aCTGGATTGCTCGGCAACTAATCGGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTg < 1:1595611/150‑1 (MQ=255) tGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTc < 2:1444298/150‑1 (MQ=255) tGGATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTc < 1:2305316/150‑1 (MQ=255) ggATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCg < 2:1434693/150‑1 (MQ=255) ggATTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCg > 2:387294/1‑150 (MQ=255) aTTGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGt < 1:1971372/150‑1 (MQ=255) ttGCTCGGCAACTAATCCGATCCCAAGCCCAAGAGCAACATAGGTTTTAATGACATCAGAATCCTGCGCACTTAATACAATATCTGCCAGCAAACCTTTGCGGGCAAATGCGTCATCAATACGTGAGCGCCCCGTAATCCCCTGTCGGTa < 2:752054/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |