Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 2,181,284 | A→T | 5.7% | L63F (TTA→TTT) ‡ | yegV → | putative sugar kinase YegV |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,181,284 | 0 | A | T | 5.7% | 584.6 / 16.1 | 184 | L63F (TTA→TTT) ‡ | yegV | putative sugar kinase YegV |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (83/90); new base T (4/7); total (87/97) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.43e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 185 total aligned reads displayed.
CACGCGTCAGTCGGTGATGGTCGTCGGCGCGGCGGTCATTGACGTGATCGCCGACGCTTATGCCCTCCCCTGGCGTGGGTGCGATATCGAACTGAAACAGCAGAGCGTTAACGTTGGCGGCTGCGCACTGAATATTGCCGTGGCGTTAAAGCGCCTCGGCATCGAAGCGGGTAATGCCTTGCCGCTCGGTCAGGGCGTGTGGGCGGAGATGATTCGCAACCGGATGGCAAAAGAGGGCTTAATCAGCCTGATCGATAACGCCGAAGGTGATAACGGCTGGTGTCTGGCGCTGGTT > NC_000913/2181137‑2181431 | cACGCGTCAGTCGGTGATGGTCGTCGGCGCGGCGGTCATTGACGTGATCGCCGACGCTTATGCCCTCCCCTGGCGTGGGTGCGATATCGAACTGAAACAGCAGAGCGTTAACGTTGGCGGCTGCGCACTGAATATTGCCGTGGCGTTaaa < 2:908789/150‑1 (MQ=255) aCGCGTCAGTCGGTGATGGTCGTCGGCGCGGCGGTCATTGACGTGATCGCCGACGCTTATGCCCTCCCCTGGCGTGGGTGCGATATCGAACTGAAACAGCAGAGCGTTAACGTTGGCGGCTGCGCACTGAATATTGCCGTGGCGTTAAAg < 2:2028658/150‑1 (MQ=255) gcgTCAGTCGGTGATGGTCGTCGGCGCGGCGGTCATTGACGTGATCGCCGACGCTTATGCCCTCCCCTGGCGTGGGTGCGATATCGAACTGAAACAGCAGAGCGTTAACGTTGGCGGCTGCGCACTGAATATTGCCGTGGCGTTAAAgcg < 2:140668/150‑1 (MQ=255) cgTCAGTCGGTGATGGTCGTCGGCGCGGCGGTCATTGACGTGATCGCCGACGCTTATGCCCTCCCCTGGCGTGGGTGCGATATCGAACTGAAACAGCAGAGCGTTAACGTTGGCGGCTGCGCACTGAATATTGCCGTGGCGTTAAAgcgc > 1:897120/1‑150 (MQ=255) cgTCAGTCGGTGATGGTCGTCGGCGCGGCGGTCATTGACGTGATCGCCGACGCTTATGCCCTCCCCTGGCGTGGGTGCGATATCGAACTGAAACAGCAGAGCGTTAACGTTGGCGGCTGCGCACTGAATATTGCCGTGGCGTTAAAgcgc > 1:1672512/1‑150 (MQ=255) gTCAGTCGGTGATGGTCGTCGGCGCGGCGGTCATTGACGTGATCGCCGACGCTTATGCCCTCCCCTGGCGTGGGTGCGATATCGAACTGAAACAGCAGAGCGTTAACGTTGGCGGCTGCGCACTGAATATTGCCGTGGCGTTAAAGCGcc > 1:1604557/1‑150 (MQ=255) cAGTCGGTGATGGTCGTCGGCGCGGCGGTCATTGACGTGATCGCCGACGCTTATGCCCTCCCCTGGCGTGGGTGCGATATCGAACTGAAACAGCAGAGCGTTAACGTTGGCGGCTGCGCACTGAATATTGCCGTGGCGTTAAAGCGCCTc < 2:1589893/150‑1 (MQ=255) cAGTCGGTGATGGTCGTCGGCGCGGCGGTCATTGACGTGATCGCCGACGCTTATGCCCTCCCCTGGCGTGGGTGCGATATCGAACTGAAACAGCAGAGCGTTAACGTTGGCGGCTGCGCACTGAATATTGCCGTGGCGTTAAAGCGCCTc > 1:1933128/1‑150 (MQ=255) aGTCGGTGATGGTCGTCGGCGCGGCGGTCATTGACGTGATCGCCGACGCTTATGCCCTCCCCTGGCGTGGGTGCGATATCGAACTGAAACAGCAGAGCGTTAACGTTGGCGGCTGCGCACTGAATATTGCCGTGGCGTTAAAGCGCCTCg < 1:915051/150‑1 (MQ=255) aGTCGGTGATGGTCGTCGGCGCGGCGGTCATTGACGTGATCGCCGACGCTTATGCCCTCCCCTGGCGTGGGTGCGATATCGAACTGAAACAGCAGAGCGTTAACGTTGGCGGCTGCGCACTGAATATTGCCGTGGCGTTAAAGCGCCTCg > 2:2089345/1‑150 (MQ=255) gTCGGTGATGGTCGTCGGCGCGGCGGTCATTGACGTGATCGCCGACGCTTATGCCCTCCCCTGGCGTGGGTGCGATATCGAACTGAAACAGCAGAGCGTTAACGTTGGCGGCTGCGCACTGAATATTGCCGTGGCGTTAAAGCGCCTCgg > 1:2030512/1‑150 (MQ=255) gTCGGTGATGGTCGTCGGCGCGGCGGTCATTGACGTGATCGCCGACGCTTATGCCCTCCCCTGGCGTGGGTGCGATATCGAACTGAAACAGCAGAGCGTTAACGTTGGCGGCTGCGCACTGAATATTGCCGTGGCGTTAAAGCGCCTCgg < 2:1960266/150‑1 (MQ=255) tCGGTGATGGTCGTCGGCGCGGCGGTCATTGACGTGATCGCCGACGCTTATGCCCTCCCCTGGCGTGGGTGCGATATCGAACTGAAACAGCAGAGCGTTAACGTTGGCGGTTGCGCACTGAATATTGCCGAGGCGCTTTAACGCCACGGc < 2:1089991/150‑1 (MQ=255) tCGGTGATGGTCGTCGGCGCGGCGGTCATTGACGTGATCGCCGACGCTTATGCCCTCCCCTGGCGTGGGTGCGATATCGAACTGAAACAGCAGAGCGTTAACGTTGGCGGCTGCGCACTGAATATTGCCGAGGCGCTTTAACGCCACGGc < 1:1041736/150‑1 (MQ=255) ggTGATGGTCGTCGGCGCGGCGGTCATTGACGTGATCGCCGACGCTTATGCCCTCCCCTGGCGTGGGTGCGATATCGAACTGAAACAGCAGAGCGTTAACGTTGGCGGCTGCGCACTGAATATTGCCGTGGCGTTAAAGCGCCTCGGCAt > 2:1218090/1‑150 (MQ=255) gTGATGGTCGTCGGCGCGGCGGTCATTGACGTGATCGCCGACGCTTATGCCCTCCCCTGGCGTGGGTGCGATATCGAACTGAAACAGCAGAGCGTTAACGTTGGCGGCTGCGCACTGAATATTGCCGTGGCGTTAAAGCGCCTCGGCATc > 1:1390631/1‑150 (MQ=255) tGATGGTCGTCGGCGCGGCGGTCATTGACGTGATCGCCGACGCTTATGCCCTCCCCTGGCGTGGGTGCGATATCGAACTGAAACAGCAGAGCGTTAACGTTGGCGGCTGCGCACTGAATATTGCCGTGGCGTTAAAGCGCCTCGGCATCg < 1:1876309/150‑1 (MQ=255) tGATGGTCGTCGGCGCGGCGGTCATTGACGTGATCGCCGACGCTTATGCCCTCCCCTGGCGTGGGTGCGATATCGAACTGAAACAGCAGAGCGTTAACGTTGGCGGCTGCGCACTGAATATTGCCGTGGCGTTAAAGCGCCTCGGCATCg > 1:609666/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |