Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,267,743 | C→G | 6.0% | intergenic (+32/‑86) | yeiQ → / → yeiR | putative dehydrogenase, NAD‑dependent/zinc‑binding GTPase YeiR |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,267,743 | 0 | C | G | 6.0% | 566.4 / 19.4 | 167 | intergenic (+32/‑86) | yeiQ/yeiR | putative dehydrogenase, NAD‑dependent/zinc‑binding GTPase YeiR |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (83/73); new base G (3/7); total (87/80) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.99e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.21e-01 |
Only 100 of 173 total aligned reads displayed.
GTTTTCGGTGATGATCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATC > NC_000913/2267595‑2267892 | gTTTTCGGTGATGATCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCAcc < 1:1114152/150‑1 (MQ=255) tttCGGTGATGATCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCtt < 1:1118978/150‑1 (MQ=255) tttCGGTGATGATCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCtt < 1:579571/150‑1 (MQ=255) nnnnatgatCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCCTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTc > 2:2317595/5‑150 (MQ=255) ggTGATGATCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTc > 1:44587/1‑150 (MQ=255) ggTGATGATCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTc > 1:1521771/1‑150 (MQ=255) tgatgaTCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCg > 1:1729463/1‑150 (MQ=255) gatgatCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGACGAAGGTGAGCTTCATCCGc < 1:1518767/150‑1 (MQ=255) atgatCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGACGAAGGTGAGCTTCATCCGct < 1:2321170/150‑1 (MQ=255) tgatCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGctc > 2:1946018/1‑150 (MQ=255) gatCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGctct < 2:264791/150‑1 (MQ=255) gatCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGACGAAGGTGAGCTTCATCCGcttt < 2:2039594/150‑3 (MQ=255) atCTGCCAGATATCCCGCATTTTGTGCAGGCCATCTAACAATCGTGGTAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGATATTAAACACCCTCAAAA‑ATTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGACGAAGGTGAGATTCATCCGcttta < 2:409819/150‑4 (MQ=255) 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ccGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTTACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCt > 2:2286012/1‑150 (MQ=255) cGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTg < 2:2439065/150‑1 (MQ=255) tcttGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACAGCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTGCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCtt < 2:2185550/148‑1 (MQ=255) tgCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTa > 1:416723/1‑150 (MQ=255) tgCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTa < 1:1042809/150‑1 (MQ=255) 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agaGCGGACGAAGGTGAGCTTCATCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGTCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAAc > 1:2389513/3‑150 (MQ=255) aaaGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAAc < 2:2181936/150‑1 (MQ=255) aaGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACAGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAAcc > 2:1059104/1‑150 (MQ=255) aGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCa < 1:68369/150‑1 (MQ=255) cGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACg < 1:963007/150‑1 (MQ=255) ggATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGTTTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGt > 1:478250/1‑150 (MQ=255) ggATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGt > 2:749600/1‑150 (MQ=255) gATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTc > 1:1916624/1‑150 (MQ=255) aGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGAttc < 2:728519/150‑1 (MQ=255) tCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGAttcttc < 1:1830695/150‑1 (MQ=255) cACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCa > 1:1335953/1‑150 (MQ=255) ccTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATc > 1:50297/1‑150 (MQ=255) | GTTTTCGGTGATGATCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATC > NC_000913/2267595‑2267892 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |