Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,267,748 | G→A | 5.8% | intergenic (+37/‑81) | yeiQ → / → yeiR | putative dehydrogenase, NAD‑dependent/zinc‑binding GTPase YeiR |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,267,748 | 0 | G | A | 5.8% | 541.1 / 12.3 | 170 | intergenic (+37/‑81) | yeiQ/yeiR | putative dehydrogenase, NAD‑dependent/zinc‑binding GTPase YeiR |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (85/74); new base A (3/7); total (88/82) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.98e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.79e-01 |
Only 100 of 170 total aligned reads displayed.
CGGTGATGATCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTT > NC_000913/2267600‑2267896 | nnnnatgatCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCCTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTc > 2:2317595/5‑150 (MQ=255) ggTGATGATCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTc > 1:1521771/1‑150 (MQ=255) ggTGATGATCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTc < 1:2275612/150‑1 (MQ=255) tgatgaTCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCg > 1:1729463/1‑150 (MQ=255) ggatgatCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCg < 1:1886315/149‑1 (MQ=255) gatgatCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGACGAAGGTGAGCTTCATCCGc < 1:1518767/150‑1 (MQ=255) tgatCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGctc > 2:1946018/1‑150 (MQ=255) tgatCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGACGAAGGTGAGCTTCATCCGctt < 1:2221785/150‑2 (MQ=255) gatCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGACGAAGGTGAGCTTCATCCGcttt < 2:2039594/150‑3 (MQ=255) atCTGCCAGATATCCCGCATTTTGTGCAGGCCATCTAACAATCGTGGTAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGATATTAAACACCCTCAAAA‑ATTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGACGAAGGTGAGATTCATCCGcttta < 2:409819/150‑4 (MQ=255) gCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTcccc < 1:148310/150‑1 (MQ=255) ccAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCtt > 1:2229939/1‑150 (MQ=255) ccAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCtt > 1:344036/1‑150 (MQ=255) 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cGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTg < 2:2439065/150‑1 (MQ=255) aTTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGTGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGcca > 2:1311366/1‑149 (MQ=255) tcttGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACAGCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTGCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCtt < 2:2185550/148‑1 (MQ=255) tgCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTa > 1:416723/1‑150 (MQ=255) tgCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTa < 1:1042809/150‑1 (MQ=255) aGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGcc < 1:1637028/150‑1 (MQ=255) aGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGcc < 1:466891/150‑1 (MQ=255) aGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGcc < 1:1964684/150‑1 (MQ=255) ggCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCa > 1:2042604/1‑150 (MQ=255) ggCAATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTACGTCCGCTCTCCCAGTCTCATTTAAGCCTTTTTTAGCCa > 2:1049500/1‑150 (MQ=255) 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ccTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCATGATTAACGCTCAg < 1:1093441/150‑1 (MQ=255) ggCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTa > 1:359066/1‑150 (MQ=255) aacaaATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACt > 2:1035209/1‑150 (MQ=255) aaaTCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTAc > 2:963007/1‑150 (MQ=255) tCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCag < 1:1723301/150‑1 (MQ=255) 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ccTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTATTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCtcat < 1:229093/150‑1 (MQ=255) cTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCtcata > 1:1737853/1‑149 (MQ=255) cTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCACTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCtcata > 1:763110/1‑149 (MQ=255) aaaa‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCTCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCAcc < 2:1654511/150‑1 (MQ=255) aa‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCgg < 2:1027365/150‑1 (MQ=255) aa‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCgg < 1:613278/150‑1 (MQ=255) ttAACGCTTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCAAATTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGGGGAGCCGTTGTGCCCAGGACCAGCCTCATCACCGGttt > 1:1867585/1‑150 (MQ=255) ttAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGttt < 2:1137821/150‑1 (MQ=255) gATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCg > 1:2368667/1‑150 (MQ=255) gCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCgg > 2:582816/1‑150 (MQ=255) 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aaaGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAAc < 2:2181936/150‑1 (MQ=255) aaGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGTGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAAcc > 1:2431574/1‑150 (MQ=255) aaGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACAGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAAcc > 2:1059104/1‑150 (MQ=255) aGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCa < 1:68369/150‑1 (MQ=255) cGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACg > 1:397676/1‑150 (MQ=255) cGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACg < 1:963007/150‑1 (MQ=255) ggATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGt > 2:749600/1‑150 (MQ=255) tCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGAttcttc < 1:1830695/150‑1 (MQ=255) cACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCa > 1:1335953/1‑150 (MQ=255) ccTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATc < 1:800331/150‑1 (MQ=255) ccTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATc > 1:50297/1‑150 (MQ=255) cGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGtt < 2:482822/150‑1 (MQ=255) | CGGTGATGATCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAA‑TTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTT > NC_000913/2267600‑2267896 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |