Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,363,452 | G→A | 6.0% | A61V (GCC→GTC) ‡ | yfaY ← | IPR008135 CinA family protein YfaY |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,363,452 | 0 | G | A | 6.0% | 524.6 / 14.0 | 165 | A61V (GCC→GTC) ‡ | yfaY | IPR008135 CinA family protein YfaY |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (74/81); new base A (4/6); total (78/87) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.50e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.72e-01 |
Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
CGTCCACGTTCGTGGAAATAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAGTGTCAACGATTTGCCCGTGTAACACTTCA > NC_000913/2363308‑2363601 | cGTCCACGTTCGTGGAAATAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGc < 2:1494550/150‑1 (MQ=255) cGTCCACGTTCGTGGAAATAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGc > 2:1795097/1‑150 (MQ=255) gTCCACGTTCGTGGAAATAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCt > 1:648512/1‑150 (MQ=255) tCCACGTTCGTGGAAATAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTg < 1:1832698/150‑1 (MQ=255) aCGTTCGTGGAAATAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACGCCGATGTGCTGatc < 2:317411/150‑3 (MQ=255) cGTTCGTGGAAATAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTa < 1:1956102/150‑1 (MQ=255) gTTCGTGGAAATAGCGTTCCATCTTTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACGCCGATGTGCTGatcgt < 1:1212350/150‑5 (MQ=255) gTTCGTGGAAATAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACGCCGATGTGCTGatcgt < 2:363083/150‑5 (MQ=255) gTTCGTGGAAATAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACGCCGATGTGCTGatcgt < 1:1435968/150‑5 (MQ=255) ttCGTGGAAATAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACg < 1:2372323/150‑1 (MQ=255) gTGGAAATAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTc < 1:757235/150‑1 (MQ=255) tGGAAATAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTcg < 2:907600/150‑1 (MQ=255) ggAAATAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTcgc < 1:640345/150‑1 (MQ=255) gAAATAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTcgcg < 2:274639/150‑1 (MQ=255) aaTAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCgaa > 1:1890777/1‑150 (MQ=255) aaTAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCgaa < 1:190085/150‑1 (MQ=255) aTAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCgaag < 1:2138828/150‑1 (MQ=255) aTAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCgaag < 1:2052873/150‑1 (MQ=255) cGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATg < 2:963969/150‑1 (MQ=255) tCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTg < 1:1942085/150‑1 (MQ=255) tCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTg < 2:1068719/150‑1 (MQ=255) ccATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGa < 1:1712676/150‑1 (MQ=255) cATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCGGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGAc > 1:1031388/1‑150 (MQ=255) cATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGAc > 2:356926/1‑150 (MQ=255) aTCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACt < 1:1924668/150‑1 (MQ=255) tctTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTAGGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAg < 2:568094/150‑1 (MQ=255) tctTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAg < 2:975049/150‑1 (MQ=255) ctTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGt < 1:2149911/150‑1 (MQ=255) tttGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGtc < 1:1358997/150‑1 (MQ=255) tGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGtcat > 2:415720/1‑150 (MQ=255) gCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCaa > 2:294079/1‑150 (MQ=255) gCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCaa > 1:1224704/1‑150 (MQ=255) cAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAgg < 1:2274328/150‑1 (MQ=255) cAGGCTTCATGCAGCACCACGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTCGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAgg > 2:468897/1‑150 (MQ=255) aGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGt < 1:2021181/150‑1 (MQ=255) gcagcaCCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCGCATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATcccccc > 2:373383/1‑149 (MQ=255) gcaCCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCg < 2:873976/150‑1 (MQ=255) gcaCCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCAGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCg > 2:1970134/1‑150 (MQ=255) aCCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTa > 2:746776/1‑150 (MQ=255) ccAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTAt > 2:1430159/1‑150 (MQ=255) aGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTg > 2:2225407/1‑150 (MQ=255) aGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTg < 2:1868478/150‑1 (MQ=255) ggCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTgc < 2:1530701/150‑1 (MQ=255) gCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGGCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAATGTTATCCCCCACCGTATTgcg < 2:662086/150‑1 (MQ=255) ccTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTgcgg > 2:1216554/1‑150 (MQ=255) cTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTgcggc < 2:1387129/150‑1 (MQ=255) cACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACCTCGGCGTGCTGCCTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCgag > 1:2355738/1‑150 (MQ=255) cACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCgag < 1:1429631/150‑1 (MQ=255) cTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATa > 2:1328566/1‑150 (MQ=255) ttttGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATaa > 2:2098366/1‑150 (MQ=255) gCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGc > 2:1400890/1‑150 (MQ=255) gTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAAc < 1:8365/150‑1 (MQ=255) gTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAAc > 2:1066174/1‑150 (MQ=255) aGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCtg < 1:217812/150‑1 (MQ=255) gcggcgAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCtga < 2:1224704/150‑1 (MQ=255) cggcgAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCtgat < 1:2284987/150‑1 (MQ=255) gcgAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCtgatga < 1:294079/150‑1 (MQ=255) cgAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATgaa < 1:122104/150‑1 (MQ=255) aGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATgaaag < 1:445975/150‑1 (MQ=255) cgcTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGaaaa > 1:939948/1‑150 (MQ=255) cgcTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGaaaa > 2:1247573/1‑150 (MQ=255) cTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGaaaaaa > 1:513935/1‑150 (MQ=255) tAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATc > 1:2007037/1‑150 (MQ=255) tAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCAAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCTTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATc < 2:309426/150‑1 (MQ=255) aaaTCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCg < 2:781716/150‑1 (MQ=255) aaTCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCgg < 1:474647/150‑1 (MQ=255) aaTCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCgg < 1:993016/150‑1 (MQ=255) aaTCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCgg > 2:1571439/1‑150 (MQ=255) catcGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGgcca > 2:1649546/1‑150 (MQ=255) gCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGgccagcca > 2:1490357/1‑150 (MQ=255) ggtcggtcCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGc < 1:415720/150‑1 (MQ=255) tcggtcCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAg > 2:1586190/1‑150 (MQ=255) ggtcCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCg < 1:1351632/150‑1 (MQ=255) gtcCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGt > 1:716648/1‑150 (MQ=255) gtcCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGt < 2:1180452/150‑1 (MQ=255) cccAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAATGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTa < 2:494651/150‑1 (MQ=255) cAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAgt < 1:2375766/150‑1 (MQ=255) aGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAgtg < 1:1970134/150‑1 (MQ=255) aGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAgtg < 1:2176477/150‑1 (MQ=255) gCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAgtgt > 1:1060194/1‑150 (MQ=255) gccgTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAGTGTCAAc < 1:1938418/150‑1 (MQ=255) cgTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAGTGTCAACGa > 2:2303122/1‑150 (MQ=255) gTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAGTGTCAACGAt > 1:903032/1‑150 (MQ=255) gTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAGTGTCAACGAt > 1:1338476/1‑150 (MQ=255) aCGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCCACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAGTGTCAACGATTTGc > 1:1585111/1‑150 (MQ=255) aCGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAGTGTCAACGATTTGc > 1:2217870/1‑150 (MQ=255) aCGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAGTGTCAACGATTTGc > 1:1267582/1‑150 (MQ=255) cGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAGTGTCAACGATTTGcc > 1:2403775/1‑150 (MQ=255) cGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAGTGTCAACGATTTGcc > 2:2122898/1‑150 (MQ=255) cGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAGTGTCAACGATTTGcc > 1:807934/1‑150 (MQ=255) cGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAGTGTCAACGATTTGcc < 2:1123901/150‑1 (MQ=255) cGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAGTGTCAACGATTTGcc > 2:1092946/1‑150 (MQ=255) cGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAGTGTCAACGATTTGcc < 2:2425613/150‑1 (MQ=255) cAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAGTGTCAACGATTTGCCCgtg < 1:2296507/150‑1 (MQ=255) cAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAGTGTCAACGATTTGCCCgtg < 1:1490357/150‑1 (MQ=255) gCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAGTGTCAACGATTTGCCCGTGTa > 1:2102808/1‑150 (MQ=255) acaTCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAGTGTCAACGATTTGCCCGTGTAac < 1:2073065/150‑1 (MQ=255) caTCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAGTGTCAACGATTTGCCCGTGTAaca < 2:1971609/150‑1 (MQ=255) ggCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAGTGTCAACGATTTGCCCGTGTAACACTTc > 1:307144/1‑150 (MQ=255) gCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAGTGTCAACGATTTGCCCGTGTAACACTTCa < 2:1890777/150‑1 (MQ=255) | CGTCCACGTTCGTGGAAATAGCGTTCCATCTCTTTGAGCCAGGCTTCATGCAGCACCAGGCCTTCACCTTTTGCTGTCGCAGCGGCGAGTGCGCTTAAATCATCGCTGGTCGGTCCCAGCCCGCCGTTAACGATCAGCACATCGGCGTGCTGACTACGTTCGCGAAGAATGGTGACTAAGTCATCAAGGTTATCCCCCACCGTATTGCGGCGAGATAATGGCAACCCCTGATGAAAGAAAAAATCGGCCAGCCAGGCAGCGTTAGTGTCAACGATTTGCCCGTGTAACACTTCA > NC_000913/2363308‑2363601 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |