Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 2,581,765 | T→C | 6.1% | D338G (GAC→GGC) | ypfG ← | DUF1176 domain‑containing protein YpfG |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 2,581,765 | 0 | T | C | 6.1% | 540.5 / 16.4 | 180 | D338G (GAC→GGC) | ypfG | DUF1176 domain‑containing protein YpfG |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (98/70); new base C (5/6); total (104/76) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.32e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.37e-01 |
Only 100 of 180 total aligned reads displayed.
TGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCTGACCGTCAAAGCGCCAGCGCGCCTGAATGCCACAATCGCTTAATCCGCGCCCTTTCGCTAAGGTCACCAGTTCACGCGATTTCTCATC > NC_000913/2581620‑2581913 | gAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGccc > 2:1392149/1‑150 (MQ=255) aGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGACGCCTGGCCCa < 1:1595539/150‑1 (MQ=255) gTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGACGCCTGGCCCac < 1:1408772/150‑2 (MQ=255) tGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGACGCCTGGCCCacg < 2:1115076/150‑3 (MQ=255) gAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGACGCCTGGCCCacgt < 1:1039301/150‑4 (MQ=255) gAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCACATTGCCGGATGCGCCGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACATCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATga > 2:862682/1‑149 (MQ=255) aGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAg < 1:268639/150‑1 (MQ=255) aGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAg < 1:2298894/150‑1 (MQ=255) 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ggTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGt > 1:697455/1‑150 (MQ=255) gTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTg > 1:1863169/1‑150 (MQ=255) taggccggataagacgctgtaggccggataagacgcgtcagcgtcgcatccggcaatcagcatccggcCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGt > 2:1015798‑M2/69‑150 (MQ=255) attgccggatgctgattgccggatgcGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGt < 2:722517/150‑1 (MQ=255) attgcaggatgctgattgccggatgcGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGt > 1:994729/1‑150 (MQ=255) 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ttGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCTGACCGTCAAAGCGCCAGCGCGCCTGAATGCCACAATCGCTTAATCCGCGCCCtt > 1:1818922/1‑150 (MQ=255) gTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCTGACCGTCAAAGCGCCAGCGCGCCTGAATGCCACAAACGCTTAATCCGCGCCCTTTc > 2:1300405/1‑150 (MQ=255) tttAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCTGACCGTCAAAGCGCCAGCGCGCCTGAATGcc > 1:2418759/1‑124 (MQ=255) aaCGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCTGACCGTCAAAGCGCCAGCGCGCCTGAATGCCACAATCGCTTAATCCGCGCCCTTTCGCTa > 1:783327/1‑150 (MQ=255) cGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCTGACCGTCAAAGCGCCAGCGCGCCTGAATGCCACAATCGCTTAATCCGCGCCCTTTCGCTAAg < 1:1232869/150‑1 (MQ=255) 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caACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCTGACCGTCAAAGCGCCAGCGCGCCTGAATGCTACAATCGCTTAATCCGCGCCCTTTCGCTAAGGTCACCAGTTc > 1:1453926/1‑150 (MQ=255) caACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCTGACCGTCAAAGCGCCAGCGCGCCTGAATGCCACAATCGCTTAATCCGCGCCCTTTCGCTAAGGTCACCAGTTc > 1:1347849/1‑150 (MQ=255) caACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCTGACCGTCAAAGCGCCAGCGCGCCTGAATGCCACAATCGCTTAATCCGCGCCCTTTCGCTAAGGTCACCAGTTc > 2:335955/1‑150 (MQ=255) gcatGGGCCAGACGCCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCTGACCGTCAAAGCGCCAGCGCGCCTGAATGCCACAATCGCTTAATCCGCGCCCTTTCGCTAAGGTCACCAGTTCAc > 2:1540104/4‑150 (MQ=255) catGGGCCAGACGCCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCTGACCGTCAAAGCGCCCGCGCGCCTGAATGCCACAATCGCTTAATCCGCGCGCTTTCGCTAAGGTCACCAGTTCAcg > 2:815174/3‑150 (MQ=255) cGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCTGACCGTCAAAGCGCCAGCGCGCCTGAATGCCACAATCGCTTAATCCGCGCCCTTTCGCTAAGGTCACCAGTTCAcg < 2:1874296/150‑1 (MQ=255) gTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCTGACCGTCAAAGCGCCAGCGCGCCTGAATGCCACAATCGCTTAATCCGCGCCCTTTCGCTAAGGTCACCAGTTCAcgc > 2:1888111/1‑150 (MQ=255) tGGGCCAGACGCCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCTGACCGTCAAAGCGCCAGCGCGCCTGAATGCCACAATCGCTTAATCCGCGCCCTTTCGCTAAGGTCACCAGTTCAcgcg > 1:395005/1‑150 (MQ=255) gggCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCTGACCGTCAAAGCGCCAGCGCGCCTGAATGCCACAATCGCTTAATCCGCGCCCTTTCGCTAAGGTCACCAGTTCACGCGa > 1:567597/1‑150 (MQ=255) gCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCTGACCGTCAAAGCGCCAGCGCGCCTGAATGCCACAATCGCTTAATCCGCGCCCTTTCGCTAAGGTCACCAGTTCACGCGAtt > 2:634597/1‑150 (MQ=255) aGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCTGACCGTCAAAGCGCCAGCGCGCCTGAATGCCACAATCGCTTAATCCGCGCCCTTTCGCTAAGGTCACCAGTTCACGCGATTtct < 1:146759/150‑1 (MQ=255) aGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCTGACCGTCAAAGCGCCAGCGCGCCTGAATGCCACAATCGCTTAATCCGCGCCCTTTCGCTAAGGTCACCAGTTCACGCGATTtct < 2:2202813/150‑1 (MQ=255) ggCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCTGACCGTCAAAGCGCCAGCGCGCCTGAATGCCACAATCGCTTAATCCGCGCCCTTTCGCTAAGGTCACCAGTTCACGCGATTtctc > 2:1298957/1‑150 (MQ=255) ggCGTCTGGACCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGAGAAAACGCTGACCGTCAAAGCGACAGCGCGCCTGAATGCCACAATCGCTTAATCCGCGCCATTTCGCTAAGGTCACCAGTTCACGAGATTtcta > 2:532906/1‑149 (MQ=255) gCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCTGACCGTCAAAGCGCCAGCGCGCCTGAATGCCACAATCGCTTAATCCGCGCCCTTTCGCTAAGGTCACCAGTTCACGCGATTTCtca < 1:820721/150‑1 (MQ=255) cGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCTGACCGTCAAAGCGCCAGCGCGCCTGAATGCCACAATCGCTTAATCCGCGCCCTTTCGCTAAGGTCACCAGTTCACGCGATTTCtcat < 1:1033690/150‑1 (MQ=255) gTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCTGACCGTCAAAGCGCCAGCGCGCCTGAATGCCACAATCGCTTAATCCGCGCCCTTTCGCTAAGGTCACCAGTTCACGCGATTTCtcatc < 1:2176699/150‑1 (MQ=255) | TGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCTGACCGTCAAAGCGCCAGCGCGCCTGAATGCCACAATCGCTTAATCCGCGCCCTTTCGCTAAGGTCACCAGTTCACGCGATTTCTCATC > NC_000913/2581620‑2581913 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |