Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 2,630,920 | T→C | 9.1% | intergenic (+55/+38) | yfgI → / ← guaA | nalidixic acid resistance protein YfgI/GMP synthetase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 2,630,920 | 0 | T | C | 9.1% | 433.5 / 26.0 | 153 | intergenic (+55/+38) | yfgI/guaA | nalidixic acid resistance protein YfgI/GMP synthetase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (73/66); new base C (7/7); total (80/73) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.19e-01 |
Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
GACGCCAACAGAAATATGACTGAAGGCGGTCGCGATCTGATGAAAAGCGTGGGCAAAGCAGAAGAGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGTTCATTCATAGTGCAGGGTCAAATCATTCCCACTCAATGGTAGCTGGCGGCTTGCCGCTGATGTCATACACCACGCGGGAAATACCGTTCACTTCATTGATAATGCGGTTGGAAACGCGACCGAGGAAATCGTAC > NC_000913/2630773‑2631069 | cGCCAACAGAAATATGACTGAAGGCGGTCGCGATCTGATGAAAAGCGTGGGCAAAGCAGAAGAGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACa > 1:1138084/1‑150 (MQ=255) cGCCAACAGAAATATGACTGAAGGCGGTCGCGATCTGATGAAAAGCGTGGGCAAAGCAGAAGAGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACa > 1:2421238/1‑150 (MQ=255) cGCCAACAGAAATATGACTGAAGGCGGTCGCGATCAGAAGAAAAGCGTGGGCAAAGCAGAACAGAACAAATCGGAAAGCTGCTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTaaaa > 1:376112/1‑148 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |