| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,758,927 | A→G | 7.6% | intergenic (+71/‑58) | alpA → / → yfjI | CP4‑57 prophage; DNA‑binding transcriptional activator AlpA/CP4‑57 prophage; protein YfjI |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,758,927 | 0 | A | G | 7.6% | 464.4 / 18.8 | 156 | intergenic (+71/‑58) | alpA/yfjI | CP4‑57 prophage; DNA‑binding transcriptional activator AlpA/CP4‑57 prophage; protein YfjI |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (76/68); new base G (7/5); total (83/73) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.71e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 161 total aligned reads displayed.
AATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTC > NC_000913/2758778‑2759075 | aaTGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATa < 1:462261/150‑1 (MQ=255) gCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCg > 1:1666363/1‑150 (MQ=255) cTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCgg < 1:333172/150‑1 (MQ=255) cGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCgg > 1:1042517/1‑148 (MQ=255) cGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCgg < 2:1042517/148‑1 (MQ=255) gCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATa < 2:700724/150‑1 (MQ=255) gAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCa > 1:1252278/1‑150 (MQ=255) gAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTA‑TTCCGCTATTAATGGCGGaaatagcag < 1:839285/150‑8 (MQ=255) gAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTAAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCa > 2:71657/1‑150 (MQ=255) aaaTCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCat > 2:124361/1‑150 (MQ=255) aaaTCTCTCGGATGGATTGCGGCCGAGATTTATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTAATACTCAAATGCTGTCATCTGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCTATTAATGGCGGaaatagcag < 2:2137344/150‑8 (MQ=255) cTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATAttt < 1:1305084/150‑1 (MQ=255) gatggatTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGATTTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTaaa < 1:743960/150‑1 (MQ=255) gatggatTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTaaa < 2:1800443/150‑1 (MQ=255) tggatTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACa > 2:1928457/1‑150 (MQ=255) gatTGAGGCCGAGACTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAAt > 1:2200150/1‑150 (MQ=255) gAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCt < 1:1236516/150‑1 (MQ=255) ggCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCtta > 2:1181470/1‑150 (MQ=255) gCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaa < 2:1775543/150‑1 (MQ=255) gCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaa < 2:1367915/150‑1 (MQ=255) ccGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTCCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaat > 2:1628950/1‑150 (MQ=255) gagaTTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaattt < 2:1497273/150‑1 (MQ=255) aTTGATGAGTGTTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTTAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaatttaat < 1:784733/150‑1 (MQ=255) aTTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCttaatttaat < 2:333348/150‑1 (MQ=255) ttGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTtaatttaatt > 1:2165912/1‑150 (MQ=255) ttGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTAAATTGCTGTCATCTGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCTCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTtaatttaatt < 1:107969/150‑1 (MQ=255) gatgaGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATttaattaa > 1:2120660/1‑150 (MQ=255) atgaGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTaaa < 2:1597589/150‑1 (MQ=255) atgaGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTaaa > 1:260593/1‑150 (MQ=255) tgaGTGGTTATTACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATa < 1:1839538/105‑1 (MQ=255) tgaGTGGTTATTACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATa > 2:1830797/1‑105 (MQ=255) tgaGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAAt < 2:55715/150‑1 (MQ=255) tgaGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAAt > 1:1871890/1‑150 (MQ=255) gaGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATa > 1:593138/1‑150 (MQ=255) aGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGTTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATaa > 1:908953/1‑150 (MQ=255) tGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAaga < 2:1097346/150‑1 (MQ=255) gTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAgg > 1:353455/1‑150 (MQ=255) gTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAAATCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTTCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAgg < 1:223820/150‑1 (MQ=255) ttATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGc > 2:2349797/1‑150 (MQ=255) tCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCAtt > 2:690210/1‑150 (MQ=255) tCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCACACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCAtt < 1:1965958/150‑1 (MQ=255) tacaAAGATGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATTAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTg < 2:2196888/149‑1 (MQ=255) gCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGtt < 2:2193189/150‑1 (MQ=255) tGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCa > 2:1122444/1‑150 (MQ=255) tGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCa > 2:1586418/1‑150 (MQ=255) tGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCa > 2:821261/1‑150 (MQ=255) gTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCaa > 1:2425231/1‑150 (MQ=255) tAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAAt < 1:102060/150‑1 (MQ=255) aaaCTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATg > 1:206076/1‑150 (MQ=255) aaCTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATgg < 2:2125365/150‑1 (MQ=255) aCTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGgt < 2:593138/150‑1 (MQ=255) cTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGgtc > 2:437367/1‑150 (MQ=255) ttGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCt > 2:2090162/1‑150 (MQ=255) tGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCtt > 2:1280873/1‑150 (MQ=255) tGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCtt > 2:2451924/1‑150 (MQ=255) aGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTc < 1:1020745/150‑1 (MQ=255) ggTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTccc < 1:2349797/150‑1 (MQ=255) gtgtTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCt > 1:2174313/1‑150 (MQ=255) gtTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGt < 1:1833933/150‑1 (MQ=255) ttACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTa < 1:1129640/150‑1 (MQ=255) cATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTATTAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGAt > 1:1286838/1‑150 (MQ=255) gAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCa > 1:1985296/1‑150 (MQ=255) aaTTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCAt < 1:1907452/150‑1 (MQ=255) aCTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTaa > 2:781909/1‑150 (MQ=255) cAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAAt < 1:677018/150‑1 (MQ=255) cAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAAt > 1:115664/1‑150 (MQ=255) aaTTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAAtt > 1:1530073/1‑150 (MQ=255) ttGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTAt > 1:1033730/1‑150 (MQ=255) gCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCa < 1:1358471/150‑1 (MQ=255) gTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGa > 1:2275758/1‑150 (MQ=255) gTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGa > 2:1678124/1‑150 (MQ=255) ggAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCaa > 1:1353653/1‑150 (MQ=255) aGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCTGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAAtt < 1:1941174/150‑1 (MQ=255) gtgtAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAAttt > 1:2116244/1‑150 (MQ=255) tgtAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTa < 1:714240/150‑1 (MQ=255) gtAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTAt > 2:1450213/1‑150 (MQ=255) gtAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTAt < 1:361352/150‑1 (MQ=255) aaaCATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGa > 1:349826/1‑150 (MQ=255) aTCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTg < 1:2411864/150‑1 (MQ=255) tCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTgg > 1:200450/1‑150 (MQ=255) tCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTgg < 2:2468020/150‑1 (MQ=255) ccTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGa < 1:2123633/150‑1 (MQ=255) ccTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGa > 2:1832144/1‑150 (MQ=255) ccTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGa < 1:637886/150‑1 (MQ=255) cTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGaa > 1:1728657/1‑150 (MQ=255) tggctattCCGCTATTAATGGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAAc > 2:1635122/7‑150 (MQ=255) tGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCAAAACAATTTCTTAAATAAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAAc > 2:2215488/1‑150 (MQ=255) gCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTCCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACa > 2:1999310/1‑150 (MQ=255) tATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGc < 1:1181470/150‑1 (MQ=255) aTTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCATGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCa < 2:1985296/150‑1 (MQ=255) aTTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCa > 1:1554900/1‑150 (MQ=255) ttCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATa < 1:1485180/150‑1 (MQ=255) ttCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATa > 1:869834/1‑150 (MQ=255) cGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGTAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGc > 1:614308/1‑150 (MQ=255) cGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGc < 1:1628950/150‑1 (MQ=255) ctaTTAATGGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAg > 2:1222658/3‑150 (MQ=255) aTTAATGGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGc < 2:865012/150‑1 (MQ=255) tAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGccc < 1:71601/150‑1 (MQ=255) tAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGccc < 2:1025793/150‑1 (MQ=255) tAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTc > 1:633227/1‑150 (MQ=255) | AATGCTCGGCGTGAAATCTGTCGGATGGATTGAGGCCGAGATTGATGAGTGGTTATCACAACGCTGTAAACTTATTTGAGGGTGTTACATGAATTCATACTCAATTGCTGTCATCGGAGTGTAAACATCCTGCTATTTCCGCCATTAATAGCGGAATAGCCATATTTGCTAAACAATTTCTTAATTTAATTAAATAAGAGGCATTGCATGTTCAATGGTCGTCCTTTCCCTGTAGATGCATTTCCTAAAATTATCAGGAATGCAATTTATGAAGTGGAACAGCATACGCAGGCCCCTC > NC_000913/2758778‑2759075 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |