Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 312,306 | A→T | 5.7% | I65I (ATA→ATT) ‡ | ykgL → | uncharacterized protein YkgL |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 312,306 | 0 | A | T | 5.7% | 506.6 / 11.8 | 157 | I65I (ATA→ATT) ‡ | ykgL | uncharacterized protein YkgL |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (75/73); new base T (5/4); total (80/77) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.63e-01 |
Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
TCTAAAAGAGGGTTGATGCCAGCATACAGGGGCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTACAAATCACATATAGCCGTCCTTTTCGCTTC > NC_000913/312157‑312455 | tCTAAAAGAGGGTTGATGCCAGCATACAGGGGCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTtata < 1:797822/150‑1 (MQ=255) cTAAAAGAGGGTTGATGCCAGCATACAGGGGCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATaa > 1:560768/1‑150 (MQ=255) aaaaGAGGGTTGATGCCAGCATACAGGGGCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATaaaa > 1:2275112/1‑149 (MQ=255) aaaaGAGGGTTGATGCCAGCATACAGGGGCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAac > 1:1250675/1‑150 (MQ=255) aaaaGAGGGTTGATGCCAGCATACAGGGGCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAac < 1:8567/150‑1 (MQ=255) gagGGTTGATGCCAGCATACAGGGGCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAacacac < 1:481942/150‑1 (MQ=255) gggTTGATGCCAGCATACAGGGGCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCa < 2:813730/150‑1 (MQ=255) ggTTGATGCCAGCATACAGGGGCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCaa > 1:547256/1‑150 (MQ=255) ggTTGATGCCAGCATACAGGGGCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCaa > 2:602807/1‑150 (MQ=255) gTTGATGCCAGCATACAGGGGCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAAc > 2:198386/1‑150 (MQ=255) tGATGCCAGCATACAGGGGCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACAt < 1:1038194/150‑1 (MQ=255) tGATGCCAGCATACAGGGGCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTGTTTATAACACCAACAt < 2:1581342/150‑1 (MQ=255) gATGCCAGCATACAGGGGCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACAtt > 2:1530025/1‑150 (MQ=255) aTGCCAGCATACAGGGGCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTa > 2:548571/1‑150 (MQ=255) aTGCCAGCATACAGGGGCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTGTTTATAACACCAACATTa < 1:2191529/150‑1 (MQ=255) tGCCAGCATACAGGGGCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTaa > 1:1787282/1‑150 (MQ=255) gCCAGCATACAGGGGCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTGTTTATAACACCAACATTAAt < 2:385606/150‑1 (MQ=255) ccAGCATACAGGGGCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATc > 1:1909496/1‑150 (MQ=255) ccAGCATACAGGGGCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATc > 1:435378/1‑150 (MQ=255) tACAGGGGCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTGTTTATAACACCAACATTAAttttcctg < 1:663712/150‑8 (MQ=38) gCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATAACCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCAGATCTGattatt > 2:666368/1‑150 (MQ=255) gAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTaa < 2:274942/150‑1 (MQ=255) aGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATc < 2:1843831/150‑1 (MQ=255) tGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAAGACACCAACATTAATCCGATCAGATTATTAATCata > 1:1385389/1‑148 (MQ=255) tGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGa > 1:1958754/1‑150 (MQ=255) ggTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGAc > 1:2094374/1‑150 (MQ=255) ggTCAACAAGTCAACAATAAGATAATGGAATATACGGAGAGAAAAGTCAGGCACTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATAAATACGATCTGATTATTAATCAGaa > 2:2469659/1‑149 (MQ=255) gTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGTAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTAATAATCAGatc < 2:681256/150‑3 (MQ=255) gTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTTGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACa < 2:1642435/150‑1 (MQ=255) tCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTAATAATCAGatcg < 1:349173/150‑4 (MQ=255) caacaaGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTAATAATCAGatcgg < 1:885104/150‑5 (MQ=255) aacaaGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTAATAATCAGatcgga < 2:1116038/150‑6 (MQ=255) aGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCg < 1:1161071/150‑1 (MQ=255) cAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTa > 1:2056144/1‑150 (MQ=255) cAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTa > 1:914/1‑150 (MQ=255) aaCATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGGACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAAAATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTaa > 1:1555549/1‑150 (MQ=255) aaCATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAg < 1:2345947/136‑1 (MQ=255) aaCATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAg > 2:2345947/1‑136 (MQ=255) aaCATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTaa > 2:216924/1‑150 (MQ=255) aTTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATcc > 2:1000482/1‑150 (MQ=255) ttAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCg < 2:1764456/150‑1 (MQ=255) tAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGt < 1:368470/150‑1 (MQ=255) aaGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTc < 1:585585/150‑1 (MQ=255) aGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCg > 1:1747997/1‑150 (MQ=255) aTGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGTAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAAttt > 1:1192111/1‑150 (MQ=255) aTGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAAttt > 1:1149804/1‑150 (MQ=255) aTGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAAttt < 1:1939711/150‑1 (MQ=255) ggAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTg < 2:458957/150‑1 (MQ=255) agagaAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGttt > 2:865361/1‑150 (MQ=255) gagaAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGtttt > 1:539517/1‑150 (MQ=255) gagaAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAAAATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGtttt > 2:15242/1‑150 (MQ=255) aaCGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACATGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCt < 2:2482714/150‑1 (MQ=255) aCGTCAGGGAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCtt > 1:1684915/1‑150 (MQ=255) aCGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCtt < 2:244173/150‑1 (MQ=255) cGTCAGGCAGGTGGCCTCAAATGAACACGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTa < 2:1286248/150‑1 (MQ=255) tCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACg < 1:2141659/150‑1 (MQ=255) cAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGa < 1:1479275/150‑1 (MQ=255) ttGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGaa < 1:2207212/150‑1 (MQ=255) ggCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACg < 2:610006/150‑1 (MQ=255) ccTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGc < 2:506667/150‑1 (MQ=255) cTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGcc > 2:1874541/1‑150 (MQ=255) cTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGcc < 1:189451/150‑1 (MQ=255) tCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCt < 1:56806/150‑1 (MQ=255) cAAATGTACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCtt < 2:1555549/150‑1 (MQ=255) cAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAAACCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTTCGACCCTGAACCGCCtt > 2:2219447/1‑150 (MQ=255) aTGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTaaa > 1:713697/1‑150 (MQ=255) tGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTaaaa > 2:1301831/1‑150 (MQ=255) aaCATGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACg < 1:1040558/150‑1 (MQ=255) cAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTg < 1:1163004/150‑1 (MQ=255) cAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTg > 1:179106/1‑150 (MQ=255) aGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTgg > 2:2150923/1‑150 (MQ=255) ggAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACCCCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGa > 1:2293110/1‑150 (MQ=255) ggAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTgg < 2:1227587/149‑1 (MQ=255) ggAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTgg > 1:1227587/1‑149 (MQ=255) ggAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGa > 1:1477207/1‑150 (MQ=255) atatatCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGAt < 2:929808/150‑1 (MQ=255) atatCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGAttt < 2:900398/150‑1 (MQ=255) aatCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTTATTATTAATCAGACAAATATCTTTAATCCTTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTa < 2:1099564/149‑1 (MQ=255) cAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTACAAATc < 2:319792/150‑1 (MQ=255) cAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTACAAATc < 2:1271136/150‑1 (MQ=255) ggAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTACAAATcac < 1:15242/150‑1 (MQ=255) gaTTAATGTTGGTGTGTTTATAACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTACAAATCACatat > 2:108392/2‑150 (MQ=39) ttAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTACAAATCACATATAg < 1:999066/150‑1 (MQ=255) ttAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTACAAATCACATATAg > 2:1430027/1‑150 (MQ=255) tAATGTTGGTGTGTTTATAACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTACAAATCACATATAGc > 1:1804825/1‑150 (MQ=255) aTGTTGGTGTGTTTATAACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTACAAATCACATATAGCCg > 1:2479830/1‑150 (MQ=255) tGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTACAAATCACATATAGCCGt > 2:718923/1‑150 (MQ=255) tGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTACAAATCACATATAGCCGt < 2:1787282/150‑1 (MQ=255) ggTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTACAAATCACATATAGCCGTCCtt > 2:158838/1‑150 (MQ=255) tgtTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTACAAATCACATATAGCCGTCCtttt < 1:707658/150‑1 (MQ=255) gtTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGAtt < 2:334036/118‑1 (MQ=255) gtTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGAtt > 1:334036/1‑118 (MQ=255) gtTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTACAAATCACATATAGCCGTCCTTTTc < 1:42629/150‑1 (MQ=255) gtTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTACAAATCACATATAGCCGTCCTTTTc < 2:1192111/150‑1 (MQ=255) tataAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTACAAATCACATATAGCCGTCCTTTTCGc > 2:2369691/1‑150 (MQ=255) ataAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTACAAATCACATATAGCCGTCCTTTTCGCt < 2:189115/150‑1 (MQ=255) taAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTACAAATCACATATAGCCGTCCTTTTCGCtt > 1:1823873/1‑150 (MQ=255) aaaCACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTACAAATCACATATAGCCGTCCTTTTCGCTTc < 1:1862047/150‑1 (MQ=255) aaaCACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTACAAATCACATATAGCCGTCCTTTTCGCTTc < 2:1168036/150‑1 (MQ=255) aaaCACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTACAAATCACATATAGCCGTCCTTTTCGCTTc > 2:625072/1‑150 (MQ=255) | TCTAAAAGAGGGTTGATGCCAGCATACAGGGGCGAAGCTGGTCAACAAGTCAACATTAAGATAATGGAATATTCGGAGAGAAACGTCAGGCAGTTGGCCTCAAATGAACAGGAAGAATATATCCCCAGGAAAATTAATGTTGGTGTTATAAACACACCAACATTAATCCGATCTGATTATTAATCAGACAAATATCGTTAATCCGTCGAATTTTGAATCAACGTTTTTTCTTACGACCCTGAACGGCCTTAAAACGTGGATTAGATTTACAAATCACATATAGCCGTCCTTTTCGCTTC > NC_000913/312157‑312455 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |