Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,931,830 | C→T | 5.3% | intergenic (+20/+35) | ygdG → / ← fucO | flap endonuclease/L‑1,2‑propanediol oxidoreductase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,931,830 | 0 | C | T | 5.3% | 483.2 / 9.0 | 151 | intergenic (+20/+35) | ygdG/fucO | flap endonuclease/L‑1,2‑propanediol oxidoreductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (67/76); new base T (3/5); total (70/81) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.25e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.84e-01 |
Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
GGTTGCCGAAAAGTGGCGCAAAAAATTAGAAACCCATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGTGCCGCCTGCGCCAGTGCCGGAATGTCTTCCTTG > NC_000913/2931681‑2931979 | ggTTGCCGAAAAGTGGCGCAAAAAATTAGAAACCCATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATAcgccgc > 1:764509/1‑150 (MQ=255) ggTTGCCGAAAAGTGGCGCAAAAAATTAGAAACCCATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATAcgccgc < 2:938828/150‑1 (MQ=255) ggTTGCCGAAAAGTGGCGCAAAAAATTAGAAACCCATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATAcgccgc < 1:376598/150‑1 (MQ=255) gTTGCCGAAAAGTGGCGCAAAAAATTAGAAACCCATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCa > 2:2044603/1‑150 (MQ=255) ccGAAAAGTGGCGCAAAAAATTAGAAACCCATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAAcc > 1:647497/1‑149 (MQ=255) cGAAAAGTGGCGCAAAAAATTAGAAACCCATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGCCGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAAcgt > 1:1749623/1‑150 (MQ=255) aaaaGTGGCGCAAAAAATTAGAAACCCATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCGATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAAcgtcg < 1:495715/150‑1 (MQ=255) ggCGCAAAAAATTAGAAACCCATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCg < 1:812936/150‑1 (MQ=255) gcgcAAAAAATTAGAAACCCATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGACGTTTGCGGCGTATCCgg < 2:504580/150‑1 (MQ=255) gcgcAAAAAATTAGAAACCCATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGACGTTTGCGGCGTATCCgg < 1:210650/150‑1 (MQ=255) cggaaaaaaTTAGAAACCCATAATGAGATGGGGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTAGAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGTTAACGGCGAGCCGGATACGACGTTTGCGGCGTATCCGGc < 2:1784933/147‑1 (MQ=255) cgcAAAAAATTAGAAACCCATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGc > 1:1183443/1‑150 (MQ=255) cgcAAAAAATTAGAAACCCATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGACGTTTGCGGCGTATCCGGc < 2:2487965/150‑1 (MQ=255) gcAAAAAATTAGAAACCCATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGGTAACCCGCAAACCGCGGATACGGcc > 1:232140/1‑149 (MQ=255) gcAAAAAATTAGAAACCCATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCa > 1:1466042/1‑150 (MQ=255) cAAAAAATTAGAAACCCATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCAt < 2:772182/150‑1 (MQ=255) aaaaaaTTAGAAACCCATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCAtt > 2:960478/1‑150 (MQ=255) aaTTAGATACCCATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGAATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATca < 1:1669659/150‑1 (MQ=255) aaTTAGAAACCCATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATca < 1:555143/150‑1 (MQ=255) aTTAGAAACCCATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATcac > 1:2070389/1‑150 (MQ=255) ttAGAAACCCATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACTCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATcaca > 2:2134425/1‑150 (MQ=255) ttAGAAACCCATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATcaca < 2:1466042/150‑1 (MQ=255) tAGAAACCCATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACAt < 1:2010051/150‑1 (MQ=255) gAAACCCATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCa > 1:349469/1‑150 (MQ=255) aaaCCCATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAg > 2:2004789/1‑150 (MQ=255) aaCCCATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAgc > 2:1838356/1‑150 (MQ=255) cccATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAgcgc > 1:789706/1‑150 (MQ=255) cATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGCTACGCCGCAAACGTCGTATCCGACATTATCACATCAGCGCAt > 1:1245006/1‑150 (MQ=255) cATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAAGGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCAt < 2:425706/150‑1 (MQ=255) cATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATAAGCCGCAAACGTCGTATACGGCATTATCACATAAGCGCAt > 2:1973689/1‑150 (MQ=255) cATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCCGATACGCCGCAAACGTCGTATACGGCCTTATCACATCAGCGCAt > 1:539576/1‑150 (MQ=255) tAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACTGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCACAttt < 2:366544/150‑1 (MQ=255) aaaGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTa < 1:1121713/150‑1 (MQ=255) aaGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCCGATAAGCCCCAAACCGAGTATACCGCAATATAAAAACAGCCCAATTaa > 1:585693/1‑149 (MQ=255) agaTGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCCGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAg > 2:2134137/1‑150 (MQ=255) ggCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCgg < 2:2375303/150‑1 (MQ=255) ggCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCgg < 1:2257903/150‑1 (MQ=255) cGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTa > 2:1374495/1‑150 (MQ=255) ttCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATgg < 1:1376574/150‑1 (MQ=255) ttCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATgg < 1:337706/150‑1 (MQ=255) cTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATAcgccgc < 2:706580/98‑1 (MQ=255) cTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGCCggatctcat < 1:1459417/150‑8 (MQ=255) tgtgCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTaa < 1:843148/150‑1 (MQ=255) gtgCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTaaa > 2:2198281/1‑150 (MQ=255) tgCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAACGCATTTACCAGGCCGTATGGTAAAg < 2:817118/150‑1 (MQ=255) gCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGc < 1:1214541/150‑1 (MQ=255) gCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCAGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGc < 1:72992/150‑1 (MQ=255) cgATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTa < 2:387490/150‑1 (MQ=255) cgATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTa < 2:1348656/150‑1 (MQ=255) gATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACTTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTAc < 2:1896146/150‑1 (MQ=255) atatTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACa < 1:409182/150‑1 (MQ=255) tGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAatat > 2:872255/1‑150 (MQ=255) gCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATc > 1:1724764/1‑150 (MQ=255) cccGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATcc < 1:1335171/150‑1 (MQ=255) gCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCa < 1:2170731/150‑1 (MQ=255) aCAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCg < 1:1973689/150‑1 (MQ=255) aCAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCg > 1:68266/1‑150 (MQ=255) aCAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCg < 1:1593709/150‑1 (MQ=255) cAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCCCATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTGTACAAAATCCTCAAGCGt > 2:1878456/1‑150 (MQ=255) aaaCCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGtt < 1:413927/150‑1 (MQ=255) aaCCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTg > 2:2364593/1‑150 (MQ=255) aCCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGc < 2:1183443/150‑1 (MQ=255) ccGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCt > 1:1590571/1‑150 (MQ=255) cGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCtt < 2:1945597/150‑1 (MQ=255) gATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCCCATCCGCGCATTTACCAGGCGGTATGGGAAAGCTCTACCATATCCTACAGCGTTGCGTc > 2:2274564/1‑150 (MQ=255) aTTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCa < 1:2004789/150‑1 (MQ=255) tGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCAcgc > 1:1855542/1‑150 (MQ=255) gCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCAcgcg < 2:1775266/150‑1 (MQ=255) cATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCgg > 2:339869/1‑150 (MQ=255) atatCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTTTACGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCggg > 2:1612864/1‑150 (MQ=255) tCGACGGCAATTTACAGCAATTGCTGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTg < 1:936103/150‑1 (MQ=255) tCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTg < 2:1673409/150‑1 (MQ=255) cGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGc > 1:1701858/1‑150 (MQ=255) cGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCAc < 1:2044603/150‑1 (MQ=255) cGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATAAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATACTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCAc > 1:1145844/1‑150 (MQ=255) cAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCAGGCATTATCACATCAGCGCATTTACGAGGCGGTATGGTAAAGCTCGACAATATCGTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGACACCgg > 2:821609/1‑150 (MQ=255) aaTTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGt < 1:1785205/150‑1 (MQ=255) gCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAAcat < 1:136971/150‑1 (MQ=255) gCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAAcat > 2:1079939/1‑150 (MQ=255) aaTTGCTGTTGGTACGGTAACGGTGAGGCGGATTCGGGGCAAAGGTGGTATGCGGCATTATCACATCAGCGGTTTTTCCTGGGTGTATGGTATATGTCTACGTTTTCCTGAAGAGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAAcatct < 2:1592157/150‑2 (MQ=255) tGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATcc > 1:1366082/1‑150 (MQ=255) ggTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGt < 2:764509/150‑1 (MQ=255) tGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATGCGGCATTATCACCTCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGGTCTACAATATGCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGTgcc > 1:1794344/1‑150 (MQ=255) ggTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGTGCCGCCTgc > 1:1507745/1‑150 (MQ=255) aaCGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGTGCCGCCTGCGcc > 1:137702/1‑150 (MQ=255) gCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGTGCCGCCTGTGCCAGTg < 1:1599962/150‑1 (MQ=255) aGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGTGCCGCCTGCGCCAGTGCCg < 1:960478/150‑1 (MQ=255) aGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGTGCCGCCTGCGCCAGTGCCg < 1:1211215/150‑1 (MQ=255) aGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGTGCCGCCTGCGCCAGTGCCg > 2:766729/1‑150 (MQ=255) ccGGATACGACGTTTGCGGCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGTGCCGCCTGCGCCAGTGCCGGa > 1:1815393/1‑150 (MQ=255) ccGGATACGACGTTTGCGGCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGCTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGTGCCGCCTGCGCCAGTGCAGGa > 2:1134830/1‑150 (MQ=255) gATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATGTCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGTGCCGCCTGCGCCAGTGCCGGAATg < 2:2424278/150‑1 (MQ=255) gATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGTGCCGCCTGCGCCAGTGCCGGAATg < 2:580965/150‑1 (MQ=255) gATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGTGCCGCCTGCGCCAGTGCCGGAATg < 2:899989/150‑1 (MQ=255) gccgcAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGTGCCGCCTGCGCCAGTGCCGGAATGTCTTc > 1:2369828/1‑150 (MQ=255) ccgcAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGTGCCGCCTGCGCCAGTGCCGGAATGTCTTcc > 2:1145072/1‑150 (MQ=255) ccgcAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGTGCCGCCTGCGCCAGTGCCGGAATGTCTTcc < 2:2302949/150‑1 (MQ=255) ccgcAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGTGCCGCCTGCGCCAGTGCCGGAATGTCTTcc > 1:1130164/1‑150 (MQ=255) cgcAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACCCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGTGCCGCCTGCGCCAGTGCCGGAATGTCTTCCt > 2:2481087/1‑150 (MQ=255) cAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGTGCCGCCTGCGCCAGTGCCGGAATGTCTTCCTTg < 1:1119875/150‑1 (MQ=255) | GGTTGCCGAAAAGTGGCGCAAAAAATTAGAAACCCATAAAGAGATGGCGTTTCTGTGCCGCGATATTGCCCGCTTACAAACCGATTTGCATATCGACGGCAATTTACAGCAATTGCGGTTGGTACGGTAACGGCGAGCCGGATACGCCGCAAACGTCGTATCCGGCATTATCACATCAGCGCATTTACCAGGCGGTATGGTAAAGCTCTACAATATCCTCAAGCGTTGCTTCACGCGGGTTGCCACCGGTACAAACATCATCCAGTGCCGCCTGCGCCAGTGCCGGAATGTCTTCCTTG > NC_000913/2931681‑2931979 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |