Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 2,993,889 | T→A | 8.4% | intergenic (+33/‑50) | ygeI → / → pbl | protein YgeI/transglycosylase domain‑containing protein Pbl |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 2,993,889 | 0 | T | A | 8.4% | 452.2 / 20.8 | 150 | intergenic (+33/‑50) | ygeI/pbl | protein YgeI/transglycosylase domain‑containing protein Pbl |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (73/64); new base A (9/4); total (82/68) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.84e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 160 total aligned reads displayed.
GCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTGTATATTTATTACAAAAATGTCTTTCGCCAGCAACTCTTGCTCTAATGAAGCAGGAA > NC_000913/2993740‑2994038 | gCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACtt > 2:1846600/1‑150 (MQ=255) aCTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTta < 2:1302786/150‑1 (MQ=255) cTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTtat > 1:136175/1‑150 (MQ=255) 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tttATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTGTATATTTATTACAAAAATGTCTTTCGCCAGCAACTCTTGCTCTAATGAAGCAGGaa < 2:1920523/150‑1 (MQ=255) tttATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTGTATATTTATTACAAAAATGTCTTTCGCCAGCAACTCTTGCTCTAATGAAGCAGGaa > 1:2475517/1‑150 (MQ=255) | GCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTGTATATTTATTACAAAAATGTCTTTCGCCAGCAACTCTTGCTCTAATGAAGCAGGAA > NC_000913/2993740‑2994038 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |