Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,044,327 | 0 | C | G | 5.7% | 518.4 / 14.0 | 153 | S222R (AGC→AGG) | bglA | 6‑phospho‑beta‑glucosidase A |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (66/77); new base G (4/5); total (71/82) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.46e-01 |
Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
AAATACTGGATGACCTTCAACGAAATTAACAACCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATGCGCGAACGCTACGTCTTTACCGA > NC_000913/3044178‑3044476 | aaaTACTGGATGACCTTCAACGAAATTAACAACCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAgc > 2:396672/1‑150 (MQ=255) ggATGACCTTCAACGAAATTAACAACCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTgg > 1:1432805/1‑150 (MQ=255) gATGACCTTCAACGAAATTAACAACCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGc < 2:1432805/150‑1 (MQ=255) aTGACCTTCAACGAAATTAACACCCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGGGCGCTGGCg < 1:1162984/150‑1 (MQ=255) gACCTTCAACGAAATTAACAACCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGGGCGCTGGCgac < 1:1694161/150‑3 (MQ=255) aCCTTCAACGAAATTAACAACCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGGGCGCTGGCgaca < 1:161506/150‑4 (MQ=255) aCCTTCAACGAAATTAACAACCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTg < 1:1141776/150‑1 (MQ=255) ccTTCAACGAAATTAACAACCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAGGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGa < 1:1726835/150‑1 (MQ=255) 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ccAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATGCGCGAACg < 2:2121855/150‑1 (MQ=255) ccAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATGCGCGAACg > 2:1527467/1‑150 (MQ=255) tttcaccGCCAGGGCGCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATGCGCGAACGCTa > 2:612219/7‑150 (MQ=255) ttcaccGCCAGGGCGCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATGCGCGAACGCTAc > 2:114341/6‑150 (MQ=255) ttGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATGCGCGAACGCTACg < 1:1548446/150‑1 (MQ=255) tcaccGCCAGGGCGCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATGCGCGAACGCTACg > 1:1244166/5‑150 (MQ=255) tGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGt < 1:1257178/131‑1 (MQ=255) tGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGt > 2:1257178/1‑131 (MQ=255) tGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATGCGCGAACGCTACGt < 2:222667/150‑1 (MQ=255) gTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATGCGCGAACGCTACGTc > 1:2004074/1‑150 (MQ=255) gTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATGCGCGAACGCTACGTc < 1:309478/150‑1 (MQ=255) cGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATGCGCGAACGCTACGTCtt > 2:655811/1‑150 (MQ=255) gCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATGCGCGAACGCTACGTCttt > 2:1338070/1‑150 (MQ=255) gCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGATGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCAGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATGCGCGAACGCTACGTCttt > 2:1677971/1‑150 (MQ=255) cAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATGCGCGAACGCTACGTCTTTAc < 1:1994433/150‑1 (MQ=255) cgcCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGGCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCGCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATGCGCGAACGCTACGTCTTTACCGa < 2:2402090/150‑1 (MQ=255) | AAATACTGGATGACCTTCAACGAAATTAACAACCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATGCGCGAACGCTACGTCTTTACCGA > NC_000913/3044178‑3044476 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |