| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,068,927 | 0 | T | C | 7.0% | 465.9 / 18.4 | 157 | intergenic (‑119/+20) | argO/mscS | L‑arginine exporter/small conductance mechanosensitive channel MscS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (63/83); new base C (7/4); total (70/87) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.20e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 163 total aligned reads displayed.
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gagagGCCAGAGAGTATTATCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCTTAAAGTTCACATCCATTTGCGGGTACGGGAAGCTGATACCGGCGGCATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTa < 1:2046215/150‑1 (MQ=255) ctgagGCCAGATAATACTCTCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCTTAAAGTTCACATCCATTTTCGGGTACGGGAAGCTGATACCGGCGGCATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTa > 2:1775139/3‑150 (MQ=255) gagGCCAGATAATACTCTCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCTTAAAGTTCACATCCATTTGCGGGTACGGGAAGCTGATACCGGCGGCATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCGAGTacc > 1:1653562/1‑149 (MQ=255) gagGCCAGATAATACTCTCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCTTAAAGTTCACATCCATTTGCGGGTACGGGAAGCTGATACCGGCGGCATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTaca < 2:434864/150‑1 (MQ=255) gagGCCAGAGAGTATTATCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCTTAAAGTTCACATCCATTTGCGGGTACGGGAAGCTGATACCGGCGGCATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTaca < 2:787923/150‑1 (MQ=255) agGCCAGAGAGTATTATCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCTTAAAGTTCACATCCATTTGCGGGTACGGGAAGCTGATACCGGCGGCATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTacac < 1:1663385/150‑1 (MQ=255) ccAGAGAGTATTATCTGGGCTCAGCGTTGATGACGCCGCTTTGTGTTCTTTCAAGAGCTTAAAGTTCAAATCCAATTGCGGGTACGGGAAGCTGATACCGGCGGCAACAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGtt > 2:1082424/1‑150 (MQ=255) ccAGAGAGTATTATCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCTTAAAGTTCACATCCATTTGCGGGTACGGGAAGCTGATACCGGCGGCATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGtt > 2:2447473/1‑150 (MQ=255) agagagTATTATCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCTTAAAGTTCACATCCATTTGCGGGTACGGGAAGCTGATACCGGCGGCATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGtttt < 1:755959/150‑1 (MQ=255) gagagTATTATCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCTTAAAGTTCACATCCATTTGCGGGTACGGGAAGCTGATACCGGCGGCATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTg > 1:2151646/1‑150 (MQ=255) cgTATTATCTGGCCTCAGCGTTCATTACGCAGCTTTTTCTTCTTTCACCCGCTTAAAGTTCACATCCATTTGCGGTTACGGTAAGCTTATACCGGCGGCATAAAATTCACGTTTAATACGCTCCCCCACAACCCAGTACACGTTTTGCAg < 2:1463468/149‑1 (MQ=255) attatCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCTTAAAGTTCACATCCATTTGCGGGTACGGGAAGCTGATACCGGCGGCATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATc < 1:733832/150‑1 (MQ=255) | GTGCAAGACCTTGAAAGTAATAAGAAAACACGTTGGATATTCCGAATTAAGTATCTGATGCAGAGACTATATCGCGGGATTGTTATTAGCGGAAATTGATAATATTAATTGGCAATCAGAAAAACTAATAAGAGAGAGGCCAGAGAGTATTATCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCTTAAAGTTCACATCCATTTGCGGGTACGGGAAGCTGATACCGGCGGCATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATC > NC_000913/3068778‑3069075 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |