| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 3,084,169 | A→G | 5.4% | D581D (GAT→GAC) ‡ | speA ← | arginine decarboxylase, biosynthetic |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,084,169 | 0 | A | G | 5.4% | 464.1 / 10.9 | 148 | D581D (GAT→GAC) ‡ | speA | arginine decarboxylase, biosynthetic |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (56/84); new base G (4/4); total (60/88) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.15e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 151 total aligned reads displayed.
GTTTTCTTCACTTGATCGCGGAACTGGGTTAACAGCGTTTTCGGATCGAGCTGTACATATTGCAGCATGTCCGCCACGGTATCGCCTTCGTCAGACAGTTCTACTTCTACGCTACCGTCAGGGAAGACGAACACGTCAACCGCTTCGGTATCACCGAACAGGTTGTGCATGTTGCCGAGGATCTCCTGATATGCGCCGACCATAAAGAAACCGAGCATCGGCGGATTCTCTGGATCGTACTCCGGCATTGGCATTGTCGTGGCAATACCGTCACCATCAATATAGTGGTCGATAGC > NC_000913/3084020‑3084315 | gTTTTCTTCACTTGATCGCGGAACTGGGTTAACAGCGTTTTCGGATCGAGCTGTACATATTGCAGCATGTCCGCCACGGTATCGCCTTCGTCAGACAGTTCTACTTCTACGCTACCGTCAGGGAAGACGAACACGTCAACCGCTTCGGTa > 2:337099/1‑150 (MQ=255)gTTTTCTTCACTTGATCGCGGAACTGGGTTAACAGCGTTTTCGGATCGAGCTGTACATATTGCAGCATGTCCGCCACGGTATCGCCTTCGTCAGACAGTTCTACTTCTACGCTACCGTCAGGGAAGACGAACACGTCAACCGCTTCGGTa < 1:1900384/150‑1 (MQ=255)gTTTTCTTCACTTGATCGCGGAACTGGGTTAACAGCGTTTTCGGATCGAGCTGTACATATTGCAGCATGTCCGCCACGGTATCGCCTTCGTCAGACAGTTCTACTTCTACGCTACCGTCAGGGAAGACGAACACGTCAACCGCTTCGGTa < 2:172089/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |