Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,100,874 | 0 | A | T | 8.3% | 493.5 / 25.0 | 167 | intergenic (‑146/+30) | ansB/yggN | L‑asparaginase 2/putative EcfF |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (76/77); new base T (5/9); total (81/86) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.06e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 |
Only 100 of 173 total aligned reads displayed.
CCATTTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGA > NC_000913/3100725‑3101023 | ccATTTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATaaa > 2:1463660/1‑150 (MQ=255) ccATTTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATaaa > 1:805586/1‑150 (MQ=255) cATTTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGCAAATTTTACGTTAAACAATTTACAACGAGAATATTTTTTGGAGATCTAGAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAACCGGCATaaaa > 2:639310/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |