| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,100,876 | 0 | A | C | 8.3% | 483.7 / 30.7 | 167 | intergenic (‑148/+28) | ansB/yggN | L‑asparaginase 2/putative EcfF |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (76/77); new base C (5/9); total (81/86) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.06e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.29e-01 | |||||||||||
Only 100 of 176 total aligned reads displayed.
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TTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGG > NC_000913/3100729‑3101025 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |