| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,100,878 | G→T | 8.1% | intergenic (‑150/+26) | ansB ← / ← yggN | L‑asparaginase 2/putative EcfF |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,100,878 | 0 | G | T | 8.1% | 576.8 / 24.1 | 173 | intergenic (‑150/+26) | ansB/yggN | L‑asparaginase 2/putative EcfF |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (79/80); new base T (5/9); total (84/89) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.07e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.75e-01 | |||||||||||
Only 100 of 175 total aligned reads displayed.
TTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGG > NC_000913/3100729‑3101025 | ttCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTAGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAg < 1:2310375/150‑1 (MQ=255) cATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGta > 1:667445/1‑150 (MQ=255) cATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGta > 2:1136684/1‑150 (MQ=255) cATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGta < 2:1072727/150‑1 (MQ=255) cATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGta < 2:606333/150‑1 (MQ=255) cATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGta < 1:2473940/150‑1 (MQ=255) tcctccAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGtatta < 2:495285/150‑1 (MQ=255) ctccAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATg > 1:1528864/1‑150 (MQ=255) aGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGCGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAATACTTTTTTATGCCGt < 1:2337596/150‑1 (MQ=255) ttACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAATACTTTTTTATGCCGttt < 1:148143/150‑3 (MQ=255) ttACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCt < 1:790200/150‑1 (MQ=255) ttACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCt > 2:1693107/1‑150 (MQ=255) tACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCtt < 2:1293874/150‑1 (MQ=255) cGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAATACTTTTTTATGCCGtttaat < 1:2124137/150‑6 (MQ=255) gTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTaaa < 2:1037060/150‑1 (MQ=255) tGAACGCTCCGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCGGTCTTaaaa > 1:2090188/1‑150 (MQ=255) tGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTaaaa > 1:2228917/1‑150 (MQ=255) tGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTaaaa < 2:1636405/150‑1 (MQ=255) gAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAAt > 2:2320945/1‑150 (MQ=255) gAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAAt < 2:1463121/150‑1 (MQ=255) aaCGCTACGCATTATCCATTATCTCTGTTTTGGAAATTTGACGTTAAAGAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGATTCAGTTAACAAAACGAATAATTAAACGTCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATa < 2:46103/150‑1 (MQ=255) cTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAgg > 1:136039/1‑150 (MQ=255) cATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGattat < 1:100010/150‑1 (MQ=255) aTTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGattatt < 2:646078/150‑1 (MQ=255) ccTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAAt > 1:913258/1‑150 (MQ=255) ccTTAGCTAAGTAAGGGAAATTTGAAGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGACTTAAAATAGAGGATTATTTTAAAt > 2:2280163/1‑150 (MQ=255) cTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAAtt > 2:857300/1‑150 (MQ=255) cTTAGCTCTGTATCGGAAATATGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGACGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGCCATAAAAAAGTATTATGACGTCTTAAAATAGAGGATTATTAAAAAtt > 2:940509/1‑150 (MQ=255) aGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTccc < 2:21011/150‑1 (MQ=255) gCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCg > 2:364164/1‑150 (MQ=255) ctGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAATCGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGAcc > 1:2243917/1‑150 (MQ=255) gTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAg < 2:1528864/150‑1 (MQ=255) tATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAgg < 2:1078725/150‑1 (MQ=255) tATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAgg > 2:1725202/1‑150 (MQ=255) ggAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCtt > 2:1486652/1‑150 (MQ=255) gAAATTCGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCttt > 1:2436205/1‑150 (MQ=255) aTTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCg > 2:1606979/1‑150 (MQ=255) tttGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCgg < 1:604772/150‑1 (MQ=255) ttGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGc > 2:1296138/1‑150 (MQ=255) ttGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGc < 1:1125006/150‑1 (MQ=255) ttGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGc < 2:1703116/150‑1 (MQ=255) gTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCt < 1:940370/150‑1 (MQ=255) aaCAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCa > 1:1686620/1‑150 (MQ=255) aCAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCag < 1:2210524/150‑1 (MQ=255) aaTTTAAAACTTTAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCagag < 2:1233231/150‑1 (MQ=255) aCAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTcaca < 1:1849078/150‑1 (MQ=255) cAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACaa < 1:1463660/150‑1 (MQ=255) aaCGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAAc < 1:1606979/150‑1 (MQ=255) tGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCgg > 1:297914/1‑150 (MQ=255) gAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGc < 2:2260355/150‑1 (MQ=255) atatatTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTa > 2:2456788/1‑150 (MQ=255) atatatTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTa < 1:783484/150‑1 (MQ=255) atTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACaaa < 2:1326225/150‑1 (MQ=255) ttGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGATTTGCGGATATATTCAAGATTCACAACGCGGATAAAAACAt > 2:676455/1‑150 (MQ=255) ggAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCt > 1:1442308/1‑150 (MQ=255) agaTCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTT‑CAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTg < 1:189824/150‑1 (MQ=255) gaTCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTg < 2:842057/150‑1 (MQ=255) aTCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGTGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGc < 2:2415099/150‑1 (MQ=255) tACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTCCGGCTATCTTCAAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCaa > 1:1070793/1‑150 (MQ=255) aaaGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAAct < 2:268845/150‑1 (MQ=255) aGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAActgg > 1:644248/1‑149 (MQ=255) ttAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAActgctg < 1:765702/150‑1 (MQ=255) tAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTgg < 1:808190/150‑1 (MQ=255) ggCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAAt > 1:1858414/1‑150 (MQ=255) gCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATc < 1:2407467/150‑1 (MQ=255) aaCAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGAGCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTc < 1:475659/150‑1 (MQ=255) aaCAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTc > 2:2278225/1‑150 (MQ=255) aaCAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTc > 2:1008659/1‑150 (MQ=255) aaCAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCAGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTAACGACCAGGGATTTGAGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTAAAAACATCTTTGCAAAACTGCTGGAAATCtttata > 1:279958/1‑147 (MQ=255) aCAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTcc > 2:903091/1‑150 (MQ=255) aCAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTcc > 1:1182969/1‑150 (MQ=255) aCAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTcc > 1:2194779/1‑150 (MQ=255) aCAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTcc > 2:727376/1‑150 (MQ=255) aaaCGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGc < 2:1707502/150‑1 (MQ=255) aaaCGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGc > 2:2358425/1‑150 (MQ=255) cGAACAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCttt < 1:1741946/150‑1 (MQ=255) agaaTTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTc < 2:1443435/150‑1 (MQ=255) agaaTTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTc < 2:2228917/150‑1 (MQ=255) gaaTTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATATAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGATTTGCGGCTATCTTACAGAGTCACAACGCGGATACAAACATATTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCATGCTTTTTcc > 2:1558861/1‑150 (MQ=255) gaaTTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTcc < 1:857300/150‑1 (MQ=255) tttaagaCGGCATAATACTTTTTTAAGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCa > 2:1760415/7‑150 (MQ=255) tAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTc < 2:1572295/150‑1 (MQ=255) tAAAAGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTc < 2:658041/150‑1 (MQ=255) agaCGGCATAATACTTTTTTATGCGGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCTACCAGGGCTTTGAGGCTATCTTACAGAGTCACAACGCGGCTACAAACAACTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCATGATTTTTCAAATCg > 2:1366241/3‑150 (MQ=255) agaCGGCATAATACTTTTTTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCg > 1:1222929/3‑150 (MQ=255) agaCGGCATAATACTTTTTTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCg > 1:2022457/3‑150 (MQ=255) aaaCGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGTGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCg < 1:1715381/150‑1 (MQ=255) cGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGtt > 1:1461518/1‑150 (MQ=255) cGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGtt > 1:1024873/1‑150 (MQ=255) cGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGtt > 2:2242089/1‑150 (MQ=255) gCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTg > 1:1764458/1‑150 (MQ=255) gCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTg < 2:459964/150‑1 (MQ=255) gCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTg < 1:1956276/150‑1 (MQ=255) gCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTg < 2:1918894/150‑1 (MQ=255) cATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTgg < 1:2093594/150‑1 (MQ=255) aTAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACAGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGa > 1:1598552/1‑150 (MQ=255) aaaaGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGa < 2:1849670/150‑1 (MQ=255) aaaGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGGTTGAg > 2:1688015/1‑150 (MQ=255) aaaGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAg > 1:679038/1‑150 (MQ=255) aaGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAgg < 1:1868796/150‑1 (MQ=255) | TTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGG > NC_000913/3100729‑3101025 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |