Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,119,574 | 0 | A | T | 8.6% | 451.0 / 24.6 | 151 | intergenic (‑462/+23) | yghJ/glcA | putative lipoprotein YghJ/glycolate/lactate:H(+) symporter GlcA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (70/68); new base T (5/8); total (75/76) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.64e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.96e-01 |
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
TGCGTGATAAAAAAATAGATGTTCTCACGCTCTTAATTATTTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGATAACGCTGGCAAAAATCAGACTGTGCTTCACGGTGTAGCGGAACAGTTCAGATTCTCGGCCCACCATGCCC > NC_000913/3119428‑3119723 | tGCGTGATAAAAAAATAGATGTTCTCACGCTCTTAATTATTTAGCATGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACg < 2:1463248/150‑1 (MQ=255) tGATAAAAAAATAGATGTTCTCACGCTCTTAATTATTTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGatca > 2:244482/1‑150 (MQ=255) aTAAAAAAATAGATGTTCTCACGCTCTTAATTATTTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGatcatc < 2:2189/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |