Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,119,576 | 0 | C | A | 8.4% | 509.9 / 21.6 | 154 | intergenic (‑464/+21) | yghJ/glcA | putative lipoprotein YghJ/glycolate/lactate:H(+) symporter GlcA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (71/70); new base A (5/8); total (76/78) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.64e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.58e-01 |
Only 100 of 154 total aligned reads displayed.
TGCGTGATAAAAAAATAGATGTTCTCACGCTCTTAATTATTTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGATAACGCTGGCAAAAATCAGACTGTGCTTCACGGTGTAGCGGAACAGTTCAGATTCTCGGCCCACCATGCCCG > NC_000913/3119428‑3119724 | tGCGTGATAAAAAAATAGATGTTCTCACGCTCTTAATTATTTAGCATGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACg < 2:1463248/150‑1 (MQ=255) tGATAAAAAAATAGATGTTCTCACGCTCTTAATTATTTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGatca > 2:244482/1‑150 (MQ=255) aTAAAAAAATAGATGTTCTCACGCTCTTAATTATTTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGatcatc > 2:1979168/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |