Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,125,404 | T→A | 7.0% | D19V (GAC→GTC) | glcF ← | glycolate dehydrogenase, putative iron‑sulfur subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,125,404 | 0 | T | A | 7.0% | 441.8 / 16.6 | 151 | D19V (GAC→GTC) | glcF | glycolate dehydrogenase, putative iron‑sulfur subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (81/57); new base A (2/8); total (84/67) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.20e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.44e-01 |
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
TGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAGCTGCTGGTGATAGCGGAATA > NC_000913/3125256‑3125552 | gtTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCTGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCg < 2:496729/150‑1 (MQ=255) tttAAGCGTGACTTCGTTTACTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATTCGCACGCGCGGCCCTTCCAGTTCATCGCACAGAAGCTGATAGGTTGTTCAGGTTGCTGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGc < 2:2216462/150‑1 (MQ=255) tttAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGc > 1:2091556/1‑150 (MQ=255) aaGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATCCTGTCGGCTTc > 2:1857213/1‑150 (MQ=255) aGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTcc < 2:805399/150‑1 (MQ=255) cGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAg < 2:1589172/150‑1 (MQ=255) aCTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCTGGAAGCCGACAGCATCCTgcgcg < 1:506398/150‑1 (MQ=255) aCTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCTGGAAGCCGACAGCATCCTgcgcg < 2:1661346/150‑1 (MQ=255) aCTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCTGGAAGCCGACAGCATCCTgcgcg < 2:1371120/150‑1 (MQ=255) cTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAgcgcgc > 2:2441773/1‑150 (MQ=255) ttCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCTGGAAGCCGACAGCATCCTgcgcgcc < 1:2402111/150‑2 (MQ=255) cGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAgcgcgcgcg < 2:456073/150‑1 (MQ=255) cGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGGTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCTGGAAGCCGACAGCATCCTgcgcgcctg < 1:563593/150‑4 (MQ=255) gTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAgcgcgcgcgc > 2:1840867/1‑150 (MQ=255) ccTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTc > 2:144951/1‑150 (MQ=255) ccTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTc > 2:28813/1‑150 (MQ=255) ccTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCCGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTc > 2:424244/1‑150 (MQ=255) cTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCt > 2:905859/1‑150 (MQ=255) tCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGc > 2:106268/1‑150 (MQ=255) tCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGAGCAGGTGGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGc < 1:2381539/150‑1 (MQ=255) cAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCg < 2:453686/150‑1 (MQ=255) gCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCa < 1:1367057/150‑1 (MQ=255) aCCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGGCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCAtc < 1:1431268/150‑1 (MQ=255) ccTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCAtct > 2:209538/1‑150 (MQ=255) cTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGTGTTCTGCCGCAtctc > 2:1531344/1‑150 (MQ=255) cTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCAtctc < 2:207618/150‑1 (MQ=255) gTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCA‑‑GCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCa > 2:429647/1‑150 (MQ=255) tttAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTc < 2:144854/150‑1 (MQ=255) tAATCAGATCGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAg < 1:603703/150‑1 (MQ=255) aaTCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGt > 1:275271/1‑150 (MQ=255) aTCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGcgcgcgcgcg > 2:2003798/1‑129 (MQ=255) gatagatGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAAtt > 1:2479647/1‑150 (MQ=255) gatagatGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAAtt > 1:1678439/1‑150 (MQ=255) atagatGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCGGCAGTGAACACAGGCGCGCAGTATGCTTTCGGCTTCTAGCGTGGGGGCGTTCTGGAGGATATATTCTTTTAATTg < 2:1515425/150‑1 (MQ=255) atGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTAGAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGtt < 1:2062650/150‑1 (MQ=255) cgcCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGCCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGc > 1:110256/1‑150 (MQ=255) gcCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCa < 2:1484432/150‑1 (MQ=255) cgcgcgGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAg > 1:1842424/1‑150 (MQ=255) cgcgcgGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAg > 1:265234/1‑150 (MQ=255) cgcgcgGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAg > 1:803898/1‑150 (MQ=255) cgcgGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGcc > 1:13318/1‑150 (MQ=255) cccGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGctc > 1:479445/1‑150 (MQ=255) ccGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGctcc < 1:885598/150‑1 (MQ=255) ccAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCaa < 1:2464662/150‑1 (MQ=255) cAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTACGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCaaa < 1:1667377/150‑1 (MQ=255) aGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAg < 2:27756/150‑1 (MQ=255) tCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTc < 1:1507832/150‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCcg > 1:1198841/1‑150 (MQ=255) cGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCcgcg < 1:1786829/150‑1 (MQ=255) gCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGt > 1:1171614/1‑150 (MQ=255) cAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACa < 1:1943865/150‑1 (MQ=255) cAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACa > 2:1072331/1‑150 (MQ=255) tGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGAcc > 1:42105/1‑150 (MQ=255) tGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGAcc > 1:1883832/1‑150 (MQ=255) gATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCg > 1:1913414/1‑150 (MQ=255) gATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCg > 1:879538/1‑150 (MQ=255) gATAGCTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGAAGGATGCTGTCGGCTTCCCGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGATCCGCCTACATGCGACCg > 2:2394741/1‑150 (MQ=255) aTAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCgg < 2:2153815/150‑1 (MQ=255) aTAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCgg < 2:2225894/150‑1 (MQ=255) tAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGGCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCggg < 1:2291350/150‑1 (MQ=255) ggTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGCCCGGGGt > 1:1025473/1‑150 (MQ=255) ggTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGt > 1:1479567/1‑150 (MQ=255) gTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCTGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGtt > 2:1681466/1‑150 (MQ=255) gTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGtt > 2:1591672/1‑150 (MQ=255) ttGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTa > 1:171042/1‑150 (MQ=255) ttGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTa < 1:458643/150‑1 (MQ=255) tGGGCNGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTaa > 1:933333/1‑150 (MQ=255) tGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTaa > 2:67958/1‑150 (MQ=255) tGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGAGACCGGGGTTaa < 2:2486213/150‑1 (MQ=255) ggCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAac < 1:1857213/150‑1 (MQ=255) ggTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAg < 1:200535/150‑1 (MQ=255) aCAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGt > 1:870883/1‑150 (MQ=255) aaTCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAg < 1:2234165/150‑1 (MQ=255) aTCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAgc < 1:209538/150‑1 (MQ=255) ccGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAgctg > 2:1214511/1‑150 (MQ=255) cGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAgctgc > 1:961698/1‑150 (MQ=255) gCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAgctgct < 1:1623790/150‑1 (MQ=255) gCAGGGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTGCTGCCGCATCTCTTCCGTTACTTGGGGTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGGTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAgctgct < 1:1563307/150‑1 (MQ=255) gTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGtt > 2:2126769/1‑150 (MQ=255) acacAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTTGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAg > 2:503168/1‑150 (MQ=255) acacAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCTACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAg < 2:1679236/150‑1 (MQ=255) acacAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAg > 1:1255500/1‑150 (MQ=255) acacAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAg < 2:1913414/150‑1 (MQ=255) cacaGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAgc < 1:2166300/150‑1 (MQ=255) cacaGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAgc > 1:774038/1‑150 (MQ=255) cacaGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAgc > 2:1360901/1‑150 (MQ=255) gcgcgcgcgcTGGAAGCCGACAGCATCCTGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAgct > 1:177482/5‑150 (MQ=255) caGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAgctg > 1:1830301/1‑150 (MQ=255) aGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAgctgc < 2:1542754/150‑1 (MQ=255) cgcgcgcTGGAAGCAGACAGCATCCTGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAgctgct > 2:1905821/2‑150 (MQ=255) cgcgcAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAGCTGCTgg > 1:850160/1‑150 (MQ=255) gcgcAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAGCTGCTGGt > 2:85832/1‑150 (MQ=255) gcgcAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAGCTGCTGGt < 2:803898/150‑1 (MQ=255) tGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTCATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAGCTGCTGGTGATAGCgg < 2:2008637/150‑1 (MQ=255) tGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAGCAGCTGGTGATAGCgg > 2:1119067/1‑150 (MQ=255) gCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAGCTGCTGGTGATAGCGGa < 2:961698/150‑1 (MQ=255) cTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAGCTGCTGGTGATAGCGGaa > 1:1325896/1‑150 (MQ=255) cTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAGCTGCTGGTGATAGCGGaa < 1:970523/150‑1 (MQ=255) tGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAGCTGCTGGTGATAGCGGAAt > 2:742827/1‑150 (MQ=255) gTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGCCCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAGCTGCTGGTGATAGCGGAATa > 1:1316195/1‑150 (MQ=255) | TGTTTTAAGCGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAGCTGCTGGTGATAGCGGAATA > NC_000913/3125256‑3125552 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |