Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,125,413 | A→T | 6.5% | L16Q (CTG→CAG) | glcF ← | glycolate dehydrogenase, putative iron‑sulfur subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,125,413 | 0 | A | T | 6.5% | 424.0 / 16.9 | 155 | L16Q (CTG→CAG) | glcF | glycolate dehydrogenase, putative iron‑sulfur subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (81/62); new base T (2/8); total (85/70) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.42e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.46e-02 |
Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
CGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAGCTGCTGGTGATAGCGGAATAAAGGAGCCG > NC_000913/3125265‑3125561 | cGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAg < 2:1589172/150‑1 (MQ=255) gTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAgc > 2:1266686/1‑150 (MQ=255) aCTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCTGGAAGCCGACAGCATCCTgcgcg < 2:1371120/150‑1 (MQ=255) aCTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCTGGAAGCCGACAGCATCCTgcgcg < 1:506398/150‑1 (MQ=255) aCTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCTGGAAGCCGACAGCATCCTgcgcg < 2:1661346/150‑1 (MQ=255) cTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAgcgcgc > 2:2441773/1‑150 (MQ=255) ttCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCTGGAAGCCGACAGCATCCTgcgcgcc < 1:1850828/150‑2 (MQ=255) ttCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAgcgcgcg < 1:2396056/150‑1 (MQ=255) cGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAgcgcgcgcg < 2:456073/150‑1 (MQ=255) gTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCTGGAAGCCGACAGCATCCTgcgcgcctgt < 1:34930/150‑5 (MQ=255) gTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAgcgcgcgcgc > 2:1840867/1‑150 (MQ=255) ccTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTc > 2:28813/1‑150 (MQ=255) ccTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCCGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTc > 2:424244/1‑150 (MQ=255) cTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCt > 2:905859/1‑150 (MQ=255) ttCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGCTGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTGCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTg < 2:590960/150‑1 (MQ=255) tCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGAGCAGGTGGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGc < 1:2381539/150‑1 (MQ=255) gCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCa > 1:2486213/1‑150 (MQ=255) aCCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCAtc < 1:1895063/150‑1 (MQ=255) aCCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGGCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCAtc < 1:1431268/150‑1 (MQ=255) cTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGTGTTCTGCCGCAtctc > 2:1531344/1‑150 (MQ=255) cTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCAtctc < 2:207618/150‑1 (MQ=255) tttAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTc < 2:144854/150‑1 (MQ=255) tAATCAGATCGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAg < 1:603703/150‑1 (MQ=255) tAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAg > 2:1522669/1‑150 (MQ=255) aTCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGcgcgcgcgcg > 2:2003798/1‑129 (MQ=255) aTCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGtt > 2:2197861/1‑150 (MQ=255) gatagatGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAAtt > 1:1678439/1‑150 (MQ=255) gatGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGt > 1:1679236/1‑150 (MQ=255) atGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTAGAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGtt < 1:2062650/150‑1 (MQ=255) gcCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCa < 2:1484432/150‑1 (MQ=255) cccGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCAt > 2:1480377/1‑150 (MQ=255) cgcgcgGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAg > 1:803898/1‑150 (MQ=255) cgcgcgGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAg > 1:1842424/1‑150 (MQ=255) cgcgcgGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAg > 1:265234/1‑150 (MQ=255) cgcgGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGcc > 1:13318/1‑150 (MQ=255) gcgGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCt < 2:1989398/150‑1 (MQ=255) ccGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGctcc < 1:885598/150‑1 (MQ=255) ccAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCaa > 1:1245076/1‑150 (MQ=255) ccAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCaa < 1:2464662/150‑1 (MQ=255) gTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGt < 1:1345380/150‑1 (MQ=255) tCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTc < 1:1507832/150‑1 (MQ=255) cGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCcgcg < 1:1643871/150‑1 (MQ=255) cGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCcgcg > 1:953683/1‑150 (MQ=255) gCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGTGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGt < 1:1531344/150‑1 (MQ=255) gCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGt > 1:1171614/1‑150 (MQ=255) cccAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTa > 1:209886/1‑150 (MQ=255) cAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACa < 1:1943865/150‑1 (MQ=255) cAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACa > 2:1072331/1‑150 (MQ=255) tGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGAcc > 1:1883832/1‑150 (MQ=255) tGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGAcc > 1:42105/1‑150 (MQ=255) tGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTATTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGAcc > 1:1723481/1‑150 (MQ=255) gATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCg > 1:879538/1‑150 (MQ=255) gATAGCTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGAAGGATGCTGTCGGCTTCCCGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGATCCGCCTACATGCGACCg > 2:2394741/1‑150 (MQ=255) 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ggCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAac > 1:1827820/1‑150 (MQ=255) gtGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGTGGTTTAACAcgccg < 2:1640913/149‑1 (MQ=255) ggTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAg > 2:1005910/1‑150 (MQ=255) ggTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAg < 1:200535/150‑1 (MQ=255) ggTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAg < 2:479445/150‑1 (MQ=255) gTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAgg > 1:2252704/1‑150 (MQ=255) gTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAgg > 2:453650/1‑150 (MQ=255) tACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAggg > 2:1546984/1‑150 (MQ=255) aCAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGt > 1:870883/1‑150 (MQ=255) cAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTc > 1:466762/1‑150 (MQ=255) 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cacaGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAgc < 1:2166300/150‑1 (MQ=255) cacaGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAgc > 1:774038/1‑150 (MQ=255) cacaGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAgc > 2:1360901/1‑150 (MQ=255) gcgcgcgcgcTGGAAGCCGACAGCATCCTGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAgct > 1:177482/5‑150 (MQ=255) ggCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAgctgct > 1:506591/1‑150 (MQ=255) cgcgcgcTGGAAGCAGACAGCATCCTGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAgctgct > 2:1905821/2‑150 (MQ=255) cgcgcAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAGCTGCTgg > 1:850160/1‑150 (MQ=255) gcgcAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAGCTGCTGGt < 2:803898/150‑1 (MQ=255) gcgcAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAGCTGCTGGt > 2:85832/1‑150 (MQ=255) tGCTGTCGGGTTCCAGCGCGCGAGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTGCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAGCGGCTGGTGATAGCgg < 2:759450/150‑1 (MQ=255) gCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAGCTGCTGGTGATAGCGGa < 2:961698/150‑1 (MQ=255) cTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAGCTGCTGGTGATAGCGGaa < 1:970523/150‑1 (MQ=255) gTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGCCCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAGCTGCTGGTGATAGCGGAATa > 1:1316195/1‑150 (MQ=255) tCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTaa < 2:1117353/98‑1 (MQ=255) tCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTaa > 1:1117353/1‑98 (MQ=255) ggCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAGCTGCTGGTGATAGCGGAATAAAg < 2:42105/150‑1 (MQ=255) ggCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAGCTGCTGGTGATAGCGGAATAAAg > 1:1994844/1‑150 (MQ=255) gCTTCCAGCTCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTGCTCAAAGTTCCTCTTTGATGCGACCGGGTTTTAACACGCCGCTAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAGCTGCTGGTTATAGCGGAATAAAgg < 2:334746/150‑1 (MQ=255) cTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAGCTGCTGGTGATAGCGGAATAAAggc > 2:2241386/1‑149 (MQ=255) tCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAGCTGCTGGTGATAGCGGAATAAAGGAGc < 1:106268/150‑1 (MQ=255) tCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAGCTGCTGGTGATAGCCGAATAAAGGAGc > 2:2257939/1‑150 (MQ=255) cAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGATGCTGTTTAAGCTGCTGGTGATAGCGGAATAAAGTAGCCg > 1:57253/1‑150 (MQ=255) | CGTGACTTCGTTGCCTTCCAGCACCTGTTTAATCAGATAGATGCGCCCGCGCGGCCCGTCCAGTTCATCGCCCAGAAGCTGATAGGTTGGGCAGGTTGCGGTACAAAATCCGCAGTGAACACAGGCGCGCAGGATGCTGTCGGCTTCCAGCGCGCGCGCGTTCTGCCGCATCTCTTCAGTTAATTGGGTTTGCATAGCCTGCTCCTCAAAGTTCCGCGTACATGCGACCGGGGTTAAACACGCCGCAAGGGTCGAGCTGCTGTTTAAGCTGCTGGTGATAGCGGAATAAAGGAGCCG > NC_000913/3125265‑3125561 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |