| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 3,335,996 | C→G | 5.7% | V167L (GTG→CTG) | murA ← | UDP‑N‑acetylglucosamine 1‑carboxyvinyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,335,996 | 0 | C | G | 5.7% | 414.7 / 11.7 | 123 | V167L (GTG→CTG) | murA | UDP‑N‑acetylglucosamine 1‑carboxyvinyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (57/59); new base G (5/2); total (62/61) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.39e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.47e-01 | |||||||||||
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
TCGATGACGATACGATCGGTGCCCTGACCGCTAATTTTCGCACCCAGCGTAATCAGGAAGTTCGCGGTATCGACGATTTCCGGTTCACGCGCTGCGTTTTCAATAATCGTGGTGCCTTCCGCCAGGGTTGCAGCACACATGATGGTCACCGTTGCGCCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCGGACGCGCACCGA > NC_000913/3335848‑3336145 | tCGATGACGATACGATCGGTGCCCTGACCGCTAATTTTCGCACCCAGCGTAATCAGGAAGTTCGCGGTATCGACGATTTCCGGTTCACGCGCTGCGTTTTCAATAATCGTGGTGCCTTCCGCCAGGGTTGCAGCACACATGATGGTCAcc < 1:1236666/150‑1 (MQ=255) cGATGACGATACGATCGGTGCCCTGACCGCTAATTTTCGCCCCCAGCGTAATCAGGAAGTTCGCGGTATCGACGATTTCCGGTTCACGCGCTGCGTTTTCAATAATCGTGGTGCCTTCCGCCAGGGTTGCAGCACACATGATGGTCACCg > 2:1805239/1‑150 (MQ=255) gATGACGATACGATCGGTGCCCTGACCGCTAATTTTCGCACCCAGCGTAATCAGGAAGTTCGCGGTATCGACGATTTCCGGTTCACGCGCTGCGTTTTCAATAATCGTGGTGCCTTCCGCCAGGGTTGCAGCACACATGATGGTCACCGt < 1:1359973/150‑1 (MQ=255) 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caTGATGGTCACCGTTGCGCCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCgg > 1:2006513/1‑150 (MQ=255) caTGATGGTCACCGTTGCGCCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCgg > 1:1338742/1‑150 (MQ=255) ataaagTCAGCGTTGGCGCAACGGTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCGGAc > 1:603825/6‑150 (MQ=255) aagTCAGCGTTGGCGCAACGGTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTTACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCGGAcgcg > 1:822002/3‑150 (MQ=255) aagTCAGCGTTGGCGCAACGGTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCATAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCGGaaccc > 2:310102/3‑146 (MQ=255) 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aCCGTTGCGCCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCGGACGCGCACCg < 1:1595135/150‑1 (MQ=255) ccGTTGCGCCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCCCCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCGGACGCGCACCGa > 1:1719878/1‑150 (MQ=255) | TCGATGACGATACGATCGGTGCCCTGACCGCTAATTTTCGCACCCAGCGTAATCAGGAAGTTCGCGGTATCGACGATTTCCGGTTCACGCGCTGCGTTTTCAATAATCGTGGTGCCTTCCGCCAGGGTTGCAGCACACATGATGGTCACCGTTGCGCCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCGGACGCGCACCGA > NC_000913/3335848‑3336145 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |