Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,336,002 | 0 | C | G | 5.8% | 402.2 / 11.8 | 120 | A165P (GCA→CCA) | murA | UDP‑N‑acetylglucosamine 1‑carboxyvinyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (55/58); new base G (5/2); total (60/60) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.39e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.20e-01 |
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
CGATACGATCGGTGCCCTGACCGCTAATTTTCGCACCCAGCGTAATCAGGAAGTTCGCGGTATCGACGATTTCCGGTTCACGCGCTGCGTTTTCAATAATCGTGGTGCCTTCCGCCAGGGTTGCAGCACACATGATGGTCACCGTTGCGCCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCGGACGCGCACCGATCGTAC > NC_000913/3335855‑3336151 | cgatacgatCGGTGCCCTGACCGCTAATTTTCGCACCCAGCGTAATCAGGAAGTTCGCGGTATCGACGATTTCCGGTTCACGCGCTGCGTTTTCAATAATCGTGGTGCCTTCCGCCAGGGTTGCAGCACACATGATGGTCACCGTTgcgc > 1:2258281/1‑150 (MQ=255) gatacgatCGGTGCCCTGACCGCTAATTTTCGCACCCAGCGTAATCAGGAAGTTCGCGGTATCGACGATTTCCGGTTCACGCGCTGCGTTTTCAATAATCGTGGTGCCTTCCGCCAGGGTTGCAGCACACATGATGGTCACCGTTGCGcc < 2:2331827/150‑1 (MQ=255) tacgatCGGTGCCCTGACCGCTAATTTTCGCACCCAGCGTAATCAGGAAGTTCGCGGTATCGACGATTTCCGGTTCACGCGCTGCGTTTTCAATAATCGTGGTGCCTTCCGCCAGGGTTGCAGCACACATGATGGTCACCGTTGCGCCaa > 2:1291362/1‑150 (MQ=255) 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aagTCAGCGTTGGCGCAACGGTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCATAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCGGaaccc > 2:310102/3‑146 (MQ=255) ggTCACCGTTGCGCCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCGGACgcgc > 2:564882/1‑150 (MQ=255) gTCAGCGTTGGCGCAACGGTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCGGACGCGCa > 2:2133800/1‑150 (MQ=255) gTCACCGTTGCGCCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCGGACGCGCa < 1:1947152/150‑1 (MQ=255) gTCACCGTTGCGCCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCGGACGCGCa < 2:579136/150‑1 (MQ=255) 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gcgcCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCGGACGCGCACCGATCGTa < 1:2466905/150‑1 (MQ=255) cgcCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCGGACGCGCACCGATCGTAc > 2:1055022/1‑150 (MQ=255) | CGATACGATCGGTGCCCTGACCGCTAATTTTCGCACCCAGCGTAATCAGGAAGTTCGCGGTATCGACGATTTCCGGTTCACGCGCTGCGTTTTCAATAATCGTGGTGCCTTCCGCCAGGGTTGCAGCACACATGATGGTCACCGTTGCGCCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCGGACGCGCACCGATCGTAC > NC_000913/3335855‑3336151 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |