| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,387,553 | 0 | T | A | 7.6% | 439.5 / 15.6 | 150 | R212R (CGA→CGT) | aaeB | aromatic carboxylic acid efflux pump subunit AaeB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (57/81); new base A (7/5); total (64/86) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.62e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 151 total aligned reads displayed.
GCGTATTCTGAATAAGATAAGTTTCGCAGGATTGGGTAATCAGCGTCAGCGATAGCGTATTGATCGCTTTTAAACGTCGATTGGCCCGCGCCCAGCGGGAAGATTCCATATTCAGGTTGCTGCGCATGCCTTGTAGCGCCGTGGTGCGTCGCACCAGGTCGC‑CCCAGGCTTTATCGACAACTTCACCATCGCCATGCTTGATACAGAGTTGCATTAATTGATATTGCGCGACCAGCAAACTTTCCAGCTCTCGATCCACTTCTTGTTTGATCGATCGCGGAGAAAAGAGCAAATCCGC > NC_000913/3387405‑3387702 | gcgTATTCTGAATAAGATAAGTTTCGCAGGATTGGGTAATCAGCGTCAGCGATAGCGTATTGATCGCTTTTAAACGTCGATTGGCCCGCGCCCAGCGGGAAGATTCCATATTCAGGTTGCTGCGCATTCCTTGTAGCGCCGTGGTGCGTc < 2:1289347/150‑1 (MQ=255) cgTATTCTGAATAAGATAAGTTTCGCAGGATTGGGTAATCAGCGTCAGCGATAGCGTATTGATCGCTTTTAAACGTCGATTGGCCCGCGCCCAGCGGGAAGATTCCATATTCAGGTTGCTGCGCATGCCTTGTAGCGCCGTGGTGCGTCg > 2:183851/1‑150 (MQ=255) cgTATTCTGAATAAGATAAGTTTCGCAGGATTGGGTAATCAGCGTCAGCGATAGCGTATTGATCGCTTTTAAACGTCGATTGGCCCGCGCCCAGCGGGAAGATTCCATATTCAGGTTGCTGCGCATGCCTTGTAGCGCCGTGGTGCGTCg > 2:1164229/1‑150 (MQ=255) 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gcgcCGTGGTGCGTCGCACCAGGTCGC‑CCCAGGCTTTATCGACAACTTCACCATCGCCATGCTTGATACAGAGTTGCATTAATTGATATTGCGCGACCAGCAAACTTTCCAGCTCTCGATCCACTTCTTGTTTGATCGATCGCGGAGaaa > 1:623653/1‑150 (MQ=255) cgcCGTGGTGCGTCGCACCAGGTCGC‑CCCAGGCTTTATCGACAACTTCACCATCGCCATGCTTGATACAGAGTTGCATTAATTGATATTGCGCGACCAGCAAACTTTCCAGCTCTCGATCCACTTCTTGTTTGATCGATCGCGGAGaaaa > 1:2417703/1‑150 (MQ=255) cgacctggtgCGACGCACCAGGTCGC‑CCCAGGCTTTATCGACAACTTCACCATCGCCATGCTTGATACAGAGTTGCATTAATTGATATTGCGCGACCAGCAAACTTTCCAGCTCTCGATCCACTTCTTGTTTGATCGATCGCGGAGaaaa > 1:676836/6‑150 (MQ=255) gacctggtgCGACGCACCAGGTCGC‑CCCAGGCTTTATCGACAACTTCACCATCGCCATGCTTGATACAGAGTTGCATTAATTGATATTGCGCGACCAGCAAACTTTCCAGCTCTCGATCCACTTCTTGTTTGATCGATCGCGGAGAAAag > 1:2113548/5‑150 (MQ=255) gacctggtgCGACGCACCAGGTCGC‑CCCAGGCTTTATCGACAACTTCACCATCGCCATGCTTGATACAGAGTTGCATTAATTGATATTGCGCGACCACCAAACTTTCCAGCTCTCGATCCACTTCTTGTTTGATCGATCGCGGAGAAAag > 2:2402403/5‑150 (MQ=255) 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gtgCGTCGCACCAGGTCGC‑CCCAGGCTTTATCGACAACTTCACCATCGCCATGCTTGATACAGAGTTGCATTAATTGATATTGCGCGACCAGCAAACTTTCCAGCTCTCGATCCACTTCTTGTTTGATCGATCGCGGAGAAAAGAGCaaa > 1:1111956/1‑150 (MQ=255) tCGCACCAGGGCGC‑CCCAGGCTTTATCGACAACTTCACCATCGCCATGCTTGATACAGAGTTGCATTAATTGATATTGCGCGACCAGCAAACTTTCCAGCTCTCGATCCACTTCTTGTTTGAGCGATCGCGGAGAAAAGAGCAAATCCGc < 1:64440/150‑1 (MQ=255) | GCGTATTCTGAATAAGATAAGTTTCGCAGGATTGGGTAATCAGCGTCAGCGATAGCGTATTGATCGCTTTTAAACGTCGATTGGCCCGCGCCCAGCGGGAAGATTCCATATTCAGGTTGCTGCGCATGCCTTGTAGCGCCGTGGTGCGTCGCACCAGGTCGC‑CCCAGGCTTTATCGACAACTTCACCATCGCCATGCTTGATACAGAGTTGCATTAATTGATATTGCGCGACCAGCAAACTTTCCAGCTCTCGATCCACTTCTTGTTTGATCGATCGCGGAGAAAAGAGCAAATCCGC > NC_000913/3387405‑3387702 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |