| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,455,457 | T→A | 5.7% | intergenic (‑59/‑121) | gspA ← / → gspC | Type II secretion system protein GspA/Type II secretion system protein GspC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,455,457 | 0 | T | A | 5.7% | 450.5 / 11.6 | 140 | intergenic (‑59/‑121) | gspA/gspC | Type II secretion system protein GspA/Type II secretion system protein GspC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (62/70); new base A (2/6); total (64/76) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.90e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.79e-01 | |||||||||||
Only 100 of 150 total aligned reads displayed.
CACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCAATATACAACCCACCCAATCTATTTTATTAGAACATACATCGTGCCCACACTACGTTTCCCCTTCCATCT > NC_000913/3455308‑3455606 | cACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGtatttat > 1:1100698/1‑150 (MQ=255) aCTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGtatttatt > 1:1336407/1‑150 (MQ=255) gCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTaaa < 1:573032/150‑1 (MQ=255) gCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTaaa > 1:1010750/1‑150 (MQ=255) gCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTaaa > 2:829885/1‑150 (MQ=255) ccTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAAt < 2:1681038/150‑1 (MQ=255) cTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATa < 1:1081850/150‑1 (MQ=255) cACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACa > 2:1579087/1‑150 (MQ=255) cACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTAATTAATAAATACa < 1:1812121/150‑1 (MQ=255) cccAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACata < 2:2006837/150‑1 (MQ=255) cccAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACata > 2:1015364/1‑150 (MQ=255) cccAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTAATTAATAAATACata < 2:298845/150‑1 (MQ=255) cccAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTAATTAATAAATACata < 1:1460438/150‑1 (MQ=255) caacaaATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATAtt > 2:1541021/1‑150 (MQ=255) caacaaATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTATAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATAtt < 2:1678366/150‑1 (MQ=255) acaaATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTAATTAATAAATACatacatt < 1:1208998/150‑5 (MQ=255) caaATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACt > 2:60171/1‑150 (MQ=255) caaATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACt > 1:705951/1‑150 (MQ=255) gCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGTAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATCAAATACATATTACTAAtata < 1:539957/150‑1 (MQ=255) cATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACACCCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATataa > 1:806983/1‑150 (MQ=255) aTAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATataaa > 2:974298/1‑150 (MQ=255) gACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATataaataa > 1:1027425/1‑150 (MQ=255) cGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATaaataaat > 1:2376561/1‑150 (MQ=255) ccAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTATACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAAttt < 1:2419028/150‑1 (MQ=255) ccAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAAttt > 1:956546/1‑150 (MQ=255) ggTTTGACGTTTCTCACACTACCAGGAAAGTATAACTTCTCTTCTCTTATACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATATAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGc < 1:548570/150‑1 (MQ=255) ggTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGc > 2:1656317/1‑150 (MQ=255) gTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCt < 1:1011351/150‑1 (MQ=255) tttGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCtt < 2:454590/150‑1 (MQ=255) ttGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTg < 1:1042648/150‑1 (MQ=255) ttGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTg < 2:2189213/150‑1 (MQ=255) ttGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTg > 1:1658598/1‑150 (MQ=255) cGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTc < 1:750395/150‑1 (MQ=255) tttCTCACACAACCATGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCAt < 1:1334142/150‑1 (MQ=255) tttCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCAt > 2:298597/1‑150 (MQ=255) tttCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCAt < 2:1795354/150‑1 (MQ=255) tttCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCAt < 2:1795348/150‑1 (MQ=255) ttCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATg > 2:822481/1‑150 (MQ=255) ttCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATg < 2:1524502/150‑1 (MQ=255) ctcACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCa > 1:193676/1‑150 (MQ=255) cacacaACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAg > 1:1135988/1‑150 (MQ=255) caACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATTTTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGc > 2:1860244/1‑150 (MQ=255) caACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGc < 2:671719/150‑1 (MQ=255) caACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGc < 1:1843582/150‑1 (MQ=255) aCCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCAt > 1:980043/1‑150 (MQ=255) aCCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCAt > 2:551759/1‑150 (MQ=255) ggAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAAt > 1:749147/1‑150 (MQ=255) gAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATa < 1:1192445/150‑1 (MQ=255) tAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTta < 2:1315732/150‑1 (MQ=255) tAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTta < 2:2068556/150‑1 (MQ=255) aaCTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTtat < 2:1936331/150‑1 (MQ=255) cttctcttctCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATAc < 1:1642209/150‑1 (MQ=255) cttctcttctCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGAATTAATACTATTtataa > 1:2040792/1‑149 (MQ=255) cttctcGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACg > 1:715533/1‑150 (MQ=255) cttctcGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACg < 2:2101603/150‑1 (MQ=255) ctcGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCa < 1:298597/150‑1 (MQ=255) ctcGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCa > 1:11195/1‑150 (MQ=255) tcGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCaa < 1:1788137/150‑1 (MQ=255) cGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCAat < 2:2388824/150‑1 (MQ=255) gTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCAata < 2:1135988/150‑1 (MQ=255) tAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCAatat < 1:274382/150‑1 (MQ=255) aCATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCAATATACa < 2:1100698/150‑1 (MQ=255) aTAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCAATATACAac < 1:1406721/150‑1 (MQ=255) gAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCAATATACAaccca > 2:1874547/1‑150 (MQ=255) aCTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCAATATACAacccacc > 2:2445186/1‑150 (MQ=255) aCTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGATTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCAATATACAacccacc < 2:749079/150‑1 (MQ=255) ttCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCAATATACAAcccaccca < 2:2159313/150‑1 (MQ=255) gTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCAATATACAACCCACCCAATCTa > 1:1069764/1‑150 (MQ=255) ttttAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCAATATACAACCCACCCAATCTAt > 1:879988/1‑150 (MQ=255) tttAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCAATATACAACCCACCCAATCTAtt < 1:1579087/150‑1 (MQ=255) attGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCAATATACAACCCACCCAATCTATTTTATTAg < 2:821820/150‑1 (MQ=255) taTTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCAATATACAACCCACCCAATCTATTTTATTAGAac < 2:780395/149‑1 (MQ=255) taTTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCAATATACAACCCACCCAATCTATTTTATTAGAac < 1:2250154/149‑1 (MQ=255) gATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCAATATACAACCCACCCAATCTATTTTATTAGAac > 1:1591343/1‑150 (MQ=255) aTTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCAATATACAACCCACCCAATCTATTTTATTAGAaca > 2:930174/1‑150 (MQ=255) ccTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCAATATACAACCCACCCAATCTATTTTATTAGAacatacat > 2:2021897/1‑150 (MQ=255) cTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCAATATACAACCCACCCAATCTATTTTATTAGAACATACATc > 2:2304371/1‑150 (MQ=255) aaTCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCAATATACAACCCACCCAATCTATTTTATTAGAACATACATCGTg > 2:437061/1‑150 (MQ=255) tCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACTTCAATATACAACCCACCCATTCTATTTTATTAGAACATACATCGTGcc < 2:1087360/150‑1 (MQ=255) aTAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCAATATACAACCCACCCAATCTATTTTATTAGAACATACATCGTGCCca < 1:2460949/150‑1 (MQ=255) aTAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCAATATACAACAGACCCAATCTATTTTATTAGAACATACATCGTGCCca > 1:328660/1‑150 (MQ=255) aTAAAAATAATGTATGTATTTAATAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCAATATACAACCCACCCAATCTATTTTATTAGAACATACATCGTGCCca < 2:2018097/150‑1 (MQ=255) tAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCAATATACAACCCACCCAATGTATTTTATTAGACCTTTCATCGTGCCcac > 2:2319862/1‑150 (MQ=255) tAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCAATATACAACCCACCCAATCTATTTTATTAGAACATACATCGTGCCcac > 1:291006/1‑150 (MQ=255) tAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCAATATACAACCCACCCAATCTATTTTATTAGAACATACATCGTGCCcac < 2:697690/150‑1 (MQ=255) aaaaaTAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCAATATACAACCCACCCAATCTATTTTATTAGAACATACATCGTGCCcaca > 1:1496831/1‑150 (MQ=255) aaaTAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCAATATACAACCCACCCAATCTATTTTATTAGAACATACATCGTGCCCACACt < 1:411808/150‑1 (MQ=255) ataatGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCAATATACAACCCACCCAATCTATTTTATTAGAACATACATCGTGCCCACACTAc < 1:2067289/150‑1 (MQ=255) aatGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCAATATACAACCCACCCAATCTATTTTATTAGAACATACATCGTGCCCACACTACGt < 2:1054492/150‑1 (MQ=255) tgtatgtaTTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCAATATACAACCCACCCAATCTATTTTATTAGAACATACATCGTGCCCACACTACGttt > 2:850610/1‑150 (MQ=255) gtatgtatTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCAATATACAACCCACCCAATCTATTTTATTAGAACATACATCGTGCCCACACTACGTTTc < 1:2007139/150‑1 (MQ=255) gtatgtatTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATATTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCAATATACAACCAACCCAATCTATTTTATTAGAACATACATCGTGCCCACACTAAGTTTc > 2:1127801/1‑150 (MQ=255) tatgtatTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCAATATACAACCCACCCAATCTATTTTATTAGAACATACATCGTGCCCACACTACGTTTcc < 1:184458/150‑1 (MQ=255) tatgtatTTAATTAATAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCAATATACAACCCACCCAATCTATTTTATTAGAACATACATCGTGCCCACACTACGTTTcc > 1:1129236/1‑150 (MQ=255) tgtatTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAACTTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACAAACGTCAATATACAACCCACCCAATCTATTTTATTAGAACATACATCGTGCCCACACTACGTTTcccc < 2:1569207/150‑1 (MQ=255) tgtatTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCAATATACAACCCACCCAATCTATTTTATTAGAACATACATCGTGCCCACACTACGTTTcccc < 1:1656317/150‑1 (MQ=255) tatttattAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATACATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCAATATACAACCCACCCAATCTATTTTATTAGAACATACATCGTGCCCACACTACGTTTCCCCtt > 1:2291759/1‑150 (MQ=255) tttattAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCAATATACAACCCACCCAATCTATTTTATTAGAACATACATCGTGCCCACACTACGTTTCCCCTTcc < 1:60171/150‑1 (MQ=255) tttattAATTAAATACATATTACAAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCAATATACAACCCACCCAATCTATTTTATTAGAACATACATCGTGCCCACACTACGTTTCCCCTTcc < 2:1170841/150‑1 (MQ=255) ttaattaaATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCAATATACAACCCACCCAATCTATTTTATTAGAACATACATCGTGCCCACACTACGTTTCCCCTTCCATCt > 2:1655031/1‑150 (MQ=255) | CACTTCCAGCCTCACCCAACAAATAGCATAGACGCCAGGTTTGACGTTTCTCACACAACCAGGAAAGAATAACTTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATATAAATAAATTTTGCTTGATTCATGCAAGCGGCATTAATACTATTTATACTAACGTCAATATACAACCCACCCAATCTATTTTATTAGAACATACATCGTGCCCACACTACGTTTCCCCTTCCATCT > NC_000913/3455308‑3455606 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |