| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,544,689 | 0 | A | T | 7.6% | 439.2 / 17.8 | 143 | R52R (CGT→CGA) | bioH | pimeloyl‑acyl carrier protein methyl ester esterase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (70/62); new base T (5/6); total (75/68) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.57e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.90e-01 | |||||||||||
Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
AGCGCCTGAACACGCTCGGGATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTGGTCTGCCACCAGATGT > NC_000913/3544540‑3544837 | aGCGCCTGAACACGCTCGGGATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTa < 1:110538/150‑1 (MQ=255) gcCTGAACACGCTCGGGATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGc > 2:279421/1‑150 (MQ=255) ccTGAACACGCTCGGGATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGcc > 1:2297041/1‑150 (MQ=255) 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cgcACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCttt < 2:1456085/150‑1 (MQ=255) cACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTgg > 1:595640/1‑150 (MQ=255) cACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTgg > 1:1175183/1‑150 (MQ=255) ccAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGGACATTCCCCTGACCTTTGGTc > 1:299179/1‑150 (MQ=255) ccAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGGCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTGGTc < 2:1277244/150‑1 (MQ=255) cAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTGGTCt < 1:559136/150‑1 (MQ=255) acctgcccGGCTTCGGGCGTAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTGGTCTg > 2:2125693/6‑150 (MQ=255) aaaTCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTGGTCTg > 2:665730/1‑150 (MQ=255) cctgcccGGCTTCGGGCGTAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTGGTCTGc > 2:179055/5‑150 (MQ=255) cctgcccGGCTTCGGGCGTAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTGGTCTGc > 1:195880/5‑150 (MQ=255) aaTCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTGGTCTGc < 1:308487/150‑1 (MQ=255) aTCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTGGTCTGcc < 2:847010/150‑1 (MQ=255) cccGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTGGTCTGccacc > 1:2289048/1‑150 (MQ=255) cccGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTGGTCTGccacc < 2:2133602/150‑1 (MQ=255) ccGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTGGTCTGccacca > 2:1529505/1‑150 (MQ=255) cGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGACATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTGGTCTGCCACCAg > 1:1451183/1‑150 (MQ=255) gCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTGGTCTGCCACCAGAt < 1:1587842/150‑1 (MQ=255) | AGCGCCTGAACACGCTCGGGATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTGGTCTGCCACCAGATGT > NC_000913/3544540‑3544837 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |