| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,638,818 | G→T | 6.8% | A393S (GCG→TCG) | pitA → | metal phosphate:H(+) symporter PitA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,638,818 | 0 | G | T | 6.8% | 412.4 / 4.5 | 128 | A393S (GCG→TCG) | pitA | metal phosphate:H(+) symporter PitA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (50/67); new base T (9/2); total (59/69) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.30e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
ATGCTGTGCGTTTCTGACACTATCGACAAAGTGGTGAAGATGCCTGGCGTGAGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCGGGA > NC_000913/3638671‑3638965 | aTGCTGTGCGTTTCTGACACTATCGACAAAGTGGTGAAGATGCCTGGCGTGAGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCg < 2:580947/150‑1 (MQ=255) tGCTGTCCGTTTCTGACACTATCGACAAAGTGGTGAAGATGCCTGGCGTGAGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCTCTGGCGt > 2:1343408/1‑150 (MQ=255) gCTGTGCGTTTCTGACACTATCGACAAAGTGGTGAAGATGCCTGGCGTGAGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGtt < 1:518661/150‑1 (MQ=255) cTGTGCGTTTCTGACACTATCGACAAAGTGGTGAAGATGCCTGGCGTGAGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTa > 2:1628486/1‑150 (MQ=255) gtgCGTTTCTGACACTATCGACAAAGTGGTGAAGATGCCTGGCGTGAGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAgg < 1:101375/150‑1 (MQ=255) gCGTTTCTGACACTATCGACAAAGTGGTGAAGATGCCTGGCGTGAGTGCTGACGATCAGCGCCGGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTa < 1:1652542/150‑1 (MQ=255) gTTTCTGACACTATCGACAAAGTGGTGAAGATGCCTGGCGTGAGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATc < 2:1477000/150‑1 (MQ=255) ttCTGACACTATCGACAAAGTGGTGAAGATGCCTGGCGTGAGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCgg < 1:1361480/150‑1 (MQ=255) ttCTGACACTATCGACAAAGTGGTGAAGATGCCTGGCGTGAGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCgg < 2:29630/150‑1 (MQ=255) ttCTGACACTATCGACAAAGTGGTGAAGATGCCTGGCGTGAGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCgg < 1:1932040/150‑1 (MQ=255) gACACTATCGACAAAGTGGTGAAGATGCCTGGCGTGAGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACg > 1:493068/1‑150 (MQ=255) gACACTATCGACAAAGTGGTGAAGATGCCTGGCGTGAGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACg < 1:1674227/150‑1 (MQ=255) cTATCGACAAAGTGGTGAAGATGCCTGGCGTGAGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTAGATCAACATGGAGGACGAACTCTAGTTAGGTATAGGTACgatga > 2:2420218/1‑150 (MQ=255) tATCGACAAAGTGGTGAAGATGCCTGGCGTGAGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACgatgat > 1:1945731/1‑150 (MQ=255) tCGTCATAGTGGTGAAGATGCCTGGCGTGAGTGCTGACTTTCAGCGCCTGTTGAAGAAACTTAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGTGTATGCACCGGTGTGTATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGTTtg < 1:882438/150‑1 (MQ=255) cGACAAAGTGGTGAAGATGCCTGGCGTGAGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATtgg > 1:2429804/1‑150 (MQ=255) gACAAAGTGGTGAAGATGCCTGGCGTCAGTGCTGACGATCAGCGGCTGTTGAAGCAACTGAAGTCCGACATGCTTCGCCCCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGGTtggg > 2:519635/1‑149 (MQ=255) cAAAGTGGTGAAGATGCCTGGCGTGAGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATtggctg < 1:1687643/150‑1 (MQ=255) aaaGTGGTGAAGATGCCTGGCGTGAGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATtggctgg < 1:614217/150‑1 (MQ=255) ggtgAAGATGCCTGGCGTGAGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCg > 2:2066238/1‑150 (MQ=255) gtgAAGATGCCTGGCGTGAGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCgt < 2:117417/150‑1 (MQ=255) aGATGCCTGGCGTGAGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCTGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTgg < 1:2101236/150‑1 (MQ=255) aGATGCCTGGCGTGAGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTgg < 2:128290/150‑1 (MQ=255) gATGCCTGGCGTGAGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGc < 1:820321/150‑1 (MQ=255) gATGCCTGGCGTGAGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGc < 1:14139/150‑1 (MQ=255) tGCCTGGCGTGAGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCaa > 2:1391526/1‑150 (MQ=255) gCCTGGCGTGAGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAAc < 2:93198/150‑1 (MQ=255) ccTGGCGTGAGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACg < 2:1793600/150‑1 (MQ=255) ccTGGCGTGAGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACg < 1:1879791/150‑1 (MQ=255) tGGCGTGAGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGAc > 2:221804/1‑150 (MQ=255) tGGCGTGAGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGAc < 1:311262/150‑1 (MQ=255) aGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACg < 1:109647/141‑1 (MQ=255) gTGCTGAGGATCAGCGCCTGTTGAAGCAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATCGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTg > 1:325678/1‑150 (MQ=255) gTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGATGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACGATCGTGTATGCACCGGTGTGGATCATCATTGCGGTCGCGCTGTCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGAGTATCGGTg < 2:2182432/150‑1 (MQ=255) gTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTg < 2:2234724/150‑1 (MQ=255) gCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTgag > 2:738784/1‑150 (MQ=255) cTGCCGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTgaga > 1:670082/1‑150 (MQ=255) aTCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCg < 1:2404381/150‑1 (MQ=255) tCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCgg < 2:2229096/150‑1 (MQ=255) cAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGt < 1:2421509/150‑1 (MQ=255) cAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGt < 1:2457100/150‑1 (MQ=255) cAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCAGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTAGATCAACATGGACGTCGAGATGTAAAAAAATAAAGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGt > 2:763213/1‑150 (MQ=255) aGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTa > 1:1655610/1‑150 (MQ=255) aGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTa < 1:191511/150‑1 (MQ=255) aGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTAGATCAACATGGACGACGAAAAATAAATAAATAACGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTa > 2:1246002/1‑150 (MQ=255) cgcCTGTTGAAGAAACTGAACTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGGATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGTCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAg < 2:1862932/150‑1 (MQ=255) tGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTAGATCAACATGGACGACGAAAAATAAAAAAAAAAAGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAAAGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAg > 2:1825980/1‑150 (MQ=255) tGTTCAACAAAATGAAATCCAACATACTTAGCACAATCTAGAATTCACCGGAGTATATCTAAATAAAAATCGAACAAGAGTTAAGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGGGAGAAAATCGGTAAGAAAg > 2:1626400/1‑150 (MQ=255) gTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTTTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAgg > 1:1093141/1‑150 (MQ=255) tGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCa > 1:2008453/1‑150 (MQ=255) gaagaaACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCgg > 1:492725/1‑138 (MQ=255) gaagaaACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCgg < 2:492725/138‑1 (MQ=255) agaaACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGa < 1:2434820/150‑1 (MQ=255) gaaACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGAc < 2:2429804/150‑1 (MQ=255) aaaCTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGAcc < 2:687553/150‑1 (MQ=255) aaCTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGAGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCt > 2:117749/1‑150 (MQ=255) aCTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTa < 2:836000/150‑1 (MQ=255) tGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACg < 1:1391526/150‑1 (MQ=255) aGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTc < 1:695863/150‑1 (MQ=255) ccGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGCCTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAgg > 1:1820266/1‑150 (MQ=255) ccGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAgg > 1:1263792/1‑150 (MQ=255) ccGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAgg > 2:707294/1‑150 (MQ=255) cGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAggg > 1:1158390/1‑150 (MQ=255) cGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAggg < 1:221804/150‑1 (MQ=255) cGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTAGATCAACATGGACGACGAAAAATAAAAAAAAAAAAGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTATGAAAGCCATGACATACGGGCAggg > 2:1750790/1‑150 (MQ=255) gACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCACCGGCTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGCCCTACGCTCAgggg > 1:2282488/1‑150 (MQ=255) gCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTc < 1:1708372/150‑1 (MQ=255) gCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTAGATCAACATGGACGACGAAAAATAAAAAAAAAAAGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGTATGACCTACGCTCAGGGGATGTc > 2:1721985/1‑150 (MQ=255) gCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTAGATCAACATGGACGACGAAAAATAAAAAAAAAAAAGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTc > 2:360174/1‑150 (MQ=255) tAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGc < 1:2187240/150‑1 (MQ=255) cACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCa < 2:1659908/150‑1 (MQ=255) cACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCa < 2:1480045/150‑1 (MQ=255) cACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCa < 2:493068/150‑1 (MQ=255) aaaaTCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATTGAAGTAGATCAAGCTATAAGTATATGTACTATGATTGTCTTGCTCCTTGTGGCAAAGACTATAGGTTAGAAAATCGGTAAGAAAGTAATGAACTACTATCAGGTGATTTCTGCACAg > 2:1846178/4‑150 (MQ=255) ccATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGa > 2:2148601/1‑150 (MQ=255) aTCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATg < 2:2010302/150‑1 (MQ=255) aTCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATg > 1:858406/1‑150 (MQ=255) aGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGAcgg > 1:446746/1‑150 (MQ=255) tATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTAAGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGAcggcg > 1:1311193/1‑150 (MQ=255) tGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACggcggc < 1:71911/150‑1 (MQ=255) tGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACggcggc > 2:632965/1‑150 (MQ=255) tGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACggcggc < 2:577375/150‑1 (MQ=255) tGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACggcggc > 2:1558184/1‑150 (MQ=255) ccGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCTGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAgtg < 1:1293849/150‑1 (MQ=255) ccGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGGATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAgtg < 2:383851/150‑1 (MQ=255) ggTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTc > 1:1892090/1‑150 (MQ=255) ggATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCg > 1:1584428/1‑150 (MQ=255) ggATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCg > 1:240119/1‑150 (MQ=255) gATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCgg > 2:1333305/1‑150 (MQ=255) tcatcaTGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGcc < 2:2151263/150‑1 (MQ=255) atGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTTGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCg > 2:1600744/1‑150 (MQ=255) atGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCg > 1:331703/1‑150 (MQ=255) tGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGa > 1:2147160/1‑150 (MQ=255) gCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACTCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGt < 2:1945731/150‑1 (MQ=255) gCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGt < 2:1259194/150‑1 (MQ=255) gCGGTCGCGCTGGCGTTAGGCATCGGTACGATGACTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGGGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACCCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGt < 2:2295883/150‑1 (MQ=255) ggTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGAGTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGTta < 1:1909563/150‑1 (MQ=255) cTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCggg < 1:1302470/150‑1 (MQ=255) tGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCGGGa < 2:1919024/150‑1 (MQ=255) tGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCGGGa < 2:1158390/150‑1 (MQ=255) | ATGCTGTGCGTTTCTGACACTATCGACAAAGTGGTGAAGATGCCTGGCGTGAGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAGAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAATCGGTAAGAAAGGCATGACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCGGGA > NC_000913/3638671‑3638965 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |