Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 3,702,837 | G→C | 5.8% | P11R (CCG→CGG) | dppF ← | dipeptide ABC transporter ATP binding subunit DppF |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,702,837 | 0 | G | C | 5.8% | 526.7 / 16.3 | 156 | P11R (CCG→CGG) | dppF | dipeptide ABC transporter ATP binding subunit DppF |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (68/79); new base C (5/4); total (73/83) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.35e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.62e-01 |
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
CCGCAGCCAGATTCGCCCACTACTGCCAGCGTTTTGCCACGTTCAAGGTTAAACGAAACGCCATCCAGCGCTTTAACCAGACGTTCCGGCGCGAACATGCCTTTCTTCACCGGATAATGTTTTTTCAGGTCGATAGCCTGCAACAGCGGTTGTTGCAGGGTGGCCTCTTGCGTACTCATAGTGTCGGCCTCCCGGCATCATCAAGTGGGTAATGGCATTTGGACTGACGCCCGTCAGCGAGCATATTCAGCGCCGGTTCTTCAGCGCGACATCTGTCAGTGGCATAGGGGCAGCG > NC_000913/3702690‑3702984 | gCAGCCAGATTCGCCCACTACTGCCAGCGTTTTGCCACGTTCAAGGTTAAACGAAACGCCATCCAGCGCTTTAACCAGACGTTCCGGCGCGAACATGCCTTTCTTCACCGGATAATGTTTTTTCAGGTCGATAGCCTGCAACAGCGgttg > 1:655875/1‑150 (MQ=255) cAGCCAGATTCGCCCACTACTGCCAGCGTTTTGCCACGTTCAAGGTTAAACGAAACGCCATCCAGCGCTTTAACCAGACGTTCCGGCGCGAACATGCCTTTCTTCACCGGATAATGTTTTTTCAGGTCGATAGCCTGCAACAGCGgttgt < 1:2369953/150‑1 (MQ=255) cAGCCAGATTCGCCCACTACTGCCAGCGTTTTGCCACGTTCAAGGTTAAACGAAACGCCATCCAGCGCTTTAACCAGACGTTCCGGCGCGAACATGCCTTTCTTCACCGGATAATGTTTTTTCAGGTCGATAGCCTGCAACAGCGgttgt < 1:1724124/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |