| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 3,885,300 | T→G | 5.5% | R75R (CGT→CGG) ‡ | yidC → | membrane protein insertase YidC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,885,300 | 0 | T | G | 5.5% | 418.5 / 13.0 | 141 | R75R (CGT→CGG) ‡ | yidC | membrane protein insertase YidC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (58/75); new base G (6/2); total (64/77) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.41e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.26e-01 | |||||||||||
Only 100 of 150 total aligned reads displayed.
GATAAAAACCCGCAACCTCAGGCCCAACAGACCACGCAGACAACGACCACCGCAGCGGGTAGCGCCGCCGACCAGGGCGTACCGGCCAGTGGCCAGGGGAAACTGATCTCGGTTAAGACCGACGTGCTTGATCTGACCATCAACACCCGTGGTGGTGATGTTGAGCAAGCTCTGCTGCCTGCTTACCCGAAAGAGCTGAACTCTACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGATAACCCGGCTAA > NC_000913/3885151‑3885449 | gATAAAAACCCGCAACCTCAGGCCCAACAGACCACGCAGACAACGACCACCGCAGCGGGTAGCGCCGCCGACCAGGGCGTACCGGCCAGTGGCCAGGGGAAACTGATCTCGGTTAAGACCGACGTGCTTGATCTGACCATCAACACCCgt < 2:930863/150‑1 (MQ=255) aTAAAAACCCGCAACCTCAGGCCCAACAGACCACGCAGACAACGACCACCGCAGTGGGTAGCGCCGCCGACCAGGGCGTACCGGCCAGTGGCCAGGGGAAACTGATCTCGGTTAAGACCGACGTGCTTGATCTGACCATCAACACCCgtg < 1:1975617/150‑1 (MQ=255) tAAAAACCCGCAACCTCAGGCCCAACAGACCACGCAGACAACGACCACCGCAGCGGGTAGCGCCGCCGACCAGGGCGTACCGGCCAGTGGCCAGGGGAAACTGATCTCGGTTAAGACCGACGTGCTTGATCTGACCATCAACACCCgtgg > 2:2131106/1‑150 (MQ=255) 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cccGTGGAGGTGATGTTGAGCAAGCTCTGCTGCCTGCTTACCCGAAAGAGCTGAACTCTACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGATAACCCgg > 2:2220819/1‑150 (MQ=255) ccGTGGTGGTGATGTTGAGCAAGCTCTGCTGCCTGCTTACCCGAAAGAGCTGAACTCTACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGATAACCCGGc < 1:1400148/150‑1 (MQ=255) | GATAAAAACCCGCAACCTCAGGCCCAACAGACCACGCAGACAACGACCACCGCAGCGGGTAGCGCCGCCGACCAGGGCGTACCGGCCAGTGGCCAGGGGAAACTGATCTCGGTTAAGACCGACGTGCTTGATCTGACCATCAACACCCGTGGTGGTGATGTTGAGCAAGCTCTGCTGCCTGCTTACCCGAAAGAGCTGAACTCTACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGATAACCCGGCTAA > NC_000913/3885151‑3885449 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |