Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 4,002,259 | G→A | 5.7% | M278I (ATG→ATA) | corA → | Ni(2(+))/Co(2(+))/Mg(2(+)) transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,002,259 | 0 | G | A | 5.7% | 557.1 / 13.8 | 176 | M278I (ATG→ATA) | corA | Ni(2(+))/Co(2(+))/Mg(2(+)) transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (84/81); new base A (4/6); total (88/88) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.35e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.68e-01 |
Only 100 of 178 total aligned reads displayed.
CATAACGAATCCCTGTTCCAGAAGGTGAACTTCCTGATGCAGGCGGCAATGGGTTTTATCAACATCGAGCAGAACCGCATCATCAAAATCTTCTCGGTGGTATCCGTGGTATTCCTGCCGCCGACGCTCGTTGCTTCCAGCTATGGCATGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAG > NC_000913/4002110‑4002407 | tAACGAATCCCTGTTCCAGAAGGTGAACTTCCTGATGCAGGCGGCAATGGGTTTTATCAACATCGAGCAGAACCGCATCATCAAAATCTTCTCGGTGGTATCCGTGGTATTCCTGCCGCCGACGCTCGTTGCTTCCAGCTATGGCATGaa > 2:1259664/1‑150 (MQ=255) aCGAATCCCTGTTCCAGAAGGTGAACTTCCTGATGCAGGCGGCAATGGGTTTTATCAACATCGAGCAGAACCGCATCATCAAAATCTTCTCGGTGGTATCCGTGGTATTCCTGCCGCCGACGCTCGTTGCTTCCAGCTATGGCATGAACt < 2:27977/150‑1 (MQ=255) gAATCCCTGTTCCAGAAGGTGAACTTCCTGATGCAGGCGGCAATGGTTTTTATCAACATCGAGCAGAACCGCATCATCAAAATCTTCTCGGTGGTATCCGTGGTATTCCTGCCGCCGACGCTCGTTGCTTCCAGCTATGGCATGAACttt < 1:928694/150‑1 (MQ=255) 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ggcAATGGGTTTTATCAACATCGAGCAGAACCGCATCATCAAAATCTTCTCGGTGGTATCCGTGGTATTCCTGCCGCCGACGCTCGTTGCTTCCAGCTATGGCATGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTAccc > 2:1737076/1‑150 (MQ=255) aaTGGGTTTTATCAACATCGAGCAGAACCGCATCATCAAAATCTTCTCGGTGGTATCCGTGGTATTCCTGCCGCCGACGCTCGTTGCTTCCAGCTATGGCATGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTgg < 1:735569/150‑1 (MQ=255) tGGGTTTTATCAACATCGAGCAGAACCGCATCATCAAAATCTTCTCGGTGGTATCCGTGGTATTCCTGCCGCCGACGCTCGTTGCTTCCAGCTATGGCATGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGgcg < 1:846591/150‑1 (MQ=255) gggTTTTATCAACATCGAGCAGAACCGCATCATCAAAATCTTCTCGGTGGTATCCGTGGTATTCCTGCCGCCGACGCTCGTTGCTTCCAGCTATGGCATGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGgcgc > 1:1134213/1‑150 (MQ=255) gggTTTTATCAACATCGAGCAGAACCGCATCATCAAAATCTTCTCGGTGGTATCCGTGGTATTCCTGCCGCCGACGCTCGTTGCTTCCAGCTATGGCATGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGgcgc < 1:1733538/150‑1 (MQ=255) 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ttCCAGCTATGGCATGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGc > 1:1045662/1‑150 (MQ=255) tCCAGCTATGGCATGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCt > 2:169174/1‑150 (MQ=255) tCCAGCTATGGCATGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCt > 1:1920901/1‑150 (MQ=255) tCCAGCTATGGCATGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCt > 2:636770/1‑150 (MQ=255) tCCAGCTATGGCATGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCt > 1:926739/1‑150 (MQ=255) ccAGCTATGGCCTCACCTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTCGAGCTTCTGCTACCCTCGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCtt < 1:424999/150‑1 (MQ=255) agttctGGCATAAACTCAAAGTTCATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAg > 1:2091037/6‑150 (MQ=255) gttctGGCATAAACTCAAAGTTCAAGACAGAACTTAAATGCACATTCGGCTACCCTCCCGAGATTAACATAATGATCCACGCGGGCCTGGCACCGTATCTGAACAAAAAGACGAAGCAAAGGTTGTAAAAAAATAGAGCTGTGGCTTact > 2:1401374/5‑148 (MQ=255) cTATGGCATGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTc < 2:2019909/150‑1 (MQ=255) cTATGGCATGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTc > 2:795655/1‑150 (MQ=255) aTGGCATGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTg < 1:2438181/150‑1 (MQ=255) tGGCATAAACTCAAAGTTCATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTgg > 2:319994/1‑150 (MQ=255) ggCATGAACTTTGAGTTTATGCCATAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACGCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGc < 1:1048017/150‑1 (MQ=255) ggCATGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCTGCTACCCTGGCGAGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGc < 1:1819303/150‑1 (MQ=255) ggCATGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTggg > 1:2433783/1‑149 (MQ=255) cATGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTa > 2:2165352/1‑150 (MQ=255) tGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAg < 1:1363791/150‑1 (MQ=255) | CATAACGAATCCCTGTTCCAGAAGGTGAACTTCCTGATGCAGGCGGCAATGGGTTTTATCAACATCGAGCAGAACCGCATCATCAAAATCTTCTCGGTGGTATCCGTGGTATTCCTGCCGCCGACGCTCGTTGCTTCCAGCTATGGCATGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAG > NC_000913/4002110‑4002407 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |