| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,231,009 | G→C | 8.1% | G219A (GGG→GCG) | rluF → | 23S rRNA pseudouridine(2604) and tRNA(Tyr) pseudouridine(35) synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,231,009 | 0 | G | C | 8.1% | 463.7 / 26.0 | 148 | G219A (GGG→GCG) | rluF | 23S rRNA pseudouridine(2604) and tRNA(Tyr) pseudouridine(35) synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (60/76); new base C (5/7); total (65/83) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.02e-02 | |||||||||||
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
TAAAAAAGAAGCGCCGTTTGTCTTCCGCATTACCCTGGTGCAGGGGCTGAACCGTCAGATCCGGCGCATGTGCGAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCAAACCGAAAACAGCGGGCATCAAACGTCCAGTCGTTAAGATGGAAAAAACGGCGGAA > NC_000913/4230860‑4231157 | aaaaaaGAAGCGCCGTTTGTCTTCCGCATTACCCTGGTGCAGGGGCTGAACCGTCAGATCCGGCGCATGTGCGAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTgggg < 1:2022103/150‑1 (MQ=255) agCGCCGTTTGTCTTCCGCATTACCCTGGTGCAGGGGCTGAACCGTCAGATCCGGCGCATGTGCGAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGCCATTCCCCCAGCGGAATGccg < 2:1957533/150‑1 (MQ=255) agCGCCGTTTGTCTTCCGCATTACCCTGGTGCAGGGGCTGAACCGTCAGATCAGGCGCATGTGCGAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAATCTCGAACGCACGCGAATCATGAACGTTAGCTTAAGCGCCATTCCCCCAGCGGAATGccg < 2:2144538/150‑1 (MQ=255) gcgcCGTTTGTCTTCCGCATTACCCTGGTGCAGGGGCTGAACCGTCAGATCCGGCGCATGTGCGAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGgcgc < 2:733552/150‑1 (MQ=255) gcgcCGTTTGTCTTCCGCATTACCCTGGTGCAGGGGCTGAACCGTCAGATCCGGCGCATGTGCGAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGCCATTCCCCCAGCGGAATGccgc < 1:1402204/150‑1 (MQ=255) gcgcCGTTTGGCTTCCGCATTACCCTGGTGCAGGGGCTGAACCGTCAGATCCGGCGCATGTGCGAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGgcgc < 2:2485656/150‑1 (MQ=255) cgcCGTTTGTCTTCCGCATTACCCTGGTGCAGGGGCTGAACCGTCAGATCCGGCGCATGTGCGAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGCCATTCCCCCAGCGGAATGccgct < 2:797683/150‑2 (MQ=255) cgcCGGTTGTCTTCCGCATTACCCTGGTGCACGGGCTGAACCGTCAGATCCGGCGCATGGGCGAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGCCATTCCCCCAGCGGAATGccgct < 2:2013602/150‑2 (MQ=255) ccGTTTGTCTTCCGCATTACCCTGGTGCAGGGGCTGAACCGTCAGATCCGGCGCATGTGCGAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGAt < 1:240835/150‑1 (MQ=255) tttGTCTTCCGCATTACCCTGGTGCAGGGGCTGAACCGTCAGATCCGGCGCATGTGCGAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTa < 2:2165395/150‑1 (MQ=255) tGTCTTCCGCATTACCCTGGTGCAGGGGCTGAACCGTCAGATCCGGCGCATGTGCGAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAAc > 2:663814/1‑150 (MQ=255) tGTCTTCCGCATTACCCTGGTGCAGGGGCTGAACCGTCAGATCCGGCGCATGTGCGAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAAc > 1:1331240/1‑150 (MQ=255) gTCTTCCGCATTACCCTGGTTCAGTGTCTGAACCGTGTGATGCGGCGCATGTGCGAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGATCGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAAcc < 1:514251/150‑1 (MQ=255) gTCTTCCGCATTACCCTGGTGCAGGGGCTGAACCGTCAGATCCGGCGCATGTGCGAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAAcc < 2:1755664/150‑1 (MQ=255) tCTTCCGCATTACCCTGGTGCAGGGGCTGAACCGTCAGATCCGGCGCATGTGCGAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACcg < 1:1293644/150‑1 (MQ=255) ttCCGCATTACCCTGGTGCAGGGGCTGAACCGTCAGATCCGGCGCATGTGCGAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACcgac < 2:2328247/150‑1 (MQ=255) ttCCGCATTACCCTGGTGCAGGGGCTGAACCGTCAGATCCGGCGCATGTGCGAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACcgac < 1:96635/150‑1 (MQ=255) ttCCGCATTACCCTGGCGCAGGGGCTGAACCGTCCGATCCGGCGCATGTGCGAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTAAACcgac < 2:1352286/150‑1 (MQ=255) tCCGCATTACCCTGGTGCAGGGGCTGAACCGTCAGATCCGGCGCATGTGCGAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACcgacg < 1:973928/150‑1 (MQ=255) gCATTACCATGGTGCAGGGGCTGAACCGTCAGATCCGGCGCATGTGCGAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATg < 2:1439785/150‑1 (MQ=255) aTTACCCTGGTGCAGGGGCTGAACCGTCAGATCCGGCGCATGTGCGAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAg > 2:1225069/1‑150 (MQ=255) aTTACCCTGGTGCAGGGGCTGAACCGTCAGATCCGGCGCATGTGCGAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAg > 1:1005760/1‑150 (MQ=255) cccTGGTGCAGGGGCTGAACCGTCAGATCCGGCGCATGTGCGAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTaa > 1:1750244/1‑150 (MQ=255) cccTGGTGCAGGGGCTGAACCGTCAGATCCGGCGCATGTGCGAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTaa > 2:2016762/1‑150 (MQ=255) cTGGTGCAGGGGCTGAACCGTCAGATCCGGCGCATGTGCGAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATc < 2:2451681/150‑1 (MQ=255) tGGTGCAGGGGCTGAACCGTCAGATCCGGCGCATGTGCGAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCg < 1:1981878/150‑1 (MQ=255) tGCAGGGGCTGAACCGTCAGATCCGGCGCATGTGCGAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGAcc < 2:1878927/150‑1 (MQ=255) tGCAGGGGCTGAACCGTCAGATCCGGCGCATGTGCGAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGAcc < 2:2400497/150‑1 (MQ=255) gCAGGGGCTGAACCGTCAGATCCGGCGCATGTGCGAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACct > 1:1787858/1‑150 (MQ=255) ggggCTGAACCGTCAGATCCGGCGCATGTGCGAGCATTTCGGCTATGATGTGAATAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGTCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACGTCtt < 2:1532304/150‑1 (MQ=255) ggggCTGAACCGTCAGATCCGGCGCATGTGCGAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCTCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCtt < 2:541243/150‑1 (MQ=255) cTGAACCGTCAGATCCGGCGCATGTGCGAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAg > 1:277232/1‑150 (MQ=255) tGAACCGTCAGATCCGGCGCATGTTCGAGCATTTCGGCTATGAATTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGc < 2:2337555/150‑1 (MQ=255) aCCGTCAGATCCGGCGCATGTGCGAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCa < 1:1522709/150‑1 (MQ=255) cGTCAGATCCGGCGCATGTGCGAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCAtt < 2:1707659/150‑1 (MQ=255) cGTCAGATCCGGCGCATGTGCGAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCAtt > 1:439873/1‑150 (MQ=255) gTCAGATCCGGCGCATGTGCGAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTg < 1:1204757/150‑1 (MQ=255) cAGATCCGGCGCATGTGCGAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGaa > 1:523218/1‑150 (MQ=255) aGATCCGGCGCATGTGCGAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGaaa < 1:1144615/150‑1 (MQ=255) aGATCCGGCGCATGTGCGAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGaaa > 1:585436/1‑150 (MQ=255) gATCCGGCGCATGTGCGAGCATTTCCGCTATGAAGTCAAAAAGCTGCAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCGGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGaaaa < 2:1670446/150‑1 (MQ=255) aTCCGGCGCATGTGCGAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAAt > 1:1314866/1‑150 (MQ=255) gCGAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAgg < 1:246556/150‑1 (MQ=255) cGAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGt > 1:858668/1‑150 (MQ=255) cGAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCAGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCAtt > 1:1154894/1‑130 (MQ=255) gAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTa < 2:582261/150‑1 (MQ=255) aGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTaa > 2:543699/1‑150 (MQ=255) cATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTaaaa > 1:225283/1‑150 (MQ=255) tttCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAAcc < 1:1464790/150‑1 (MQ=255) cGGCTATGAAGTTAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTaa < 1:1268894/150‑1 (MQ=255) cTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGc < 1:858811/150‑1 (MQ=255) tGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACTAGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCTTTCCTGTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGCCGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGATGTAAAACCTAAAGCGaa < 2:1015252/150‑1 (MQ=255) gAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAg > 1:325780/1‑150 (MQ=255) gTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGcc > 1:600886/1‑150 (MQ=255) tGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCa > 1:1038622/1‑150 (MQ=255) tGAAAAAGCTGGAACGCACGAGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGGTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACATAAAGCGAAGGCCa > 2:821901/1‑150 (MQ=255) gAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCaa > 1:575847/1‑150 (MQ=255) gAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCaa > 1:1017184/1‑150 (MQ=255) aaaaGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCCGCATTCCGCTGGGGGAATCGCGCGATTTAACCGAAGATGAGTTAATCGACATCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCAAAc > 1:731538/1‑150 (MQ=255) aaaGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCAAAcc < 1:1775274/150‑1 (MQ=255) ggAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCAAACCGAAAAc > 2:951855/1‑150 (MQ=255) gcacgcGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCAAACCGAAAACAGCgg < 2:1331240/150‑1 (MQ=255) cacgcGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCAAACCGAAAACAGCggg > 2:595350/1‑150 (MQ=255) cacgcGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCAAACCGAAAACAGCggg < 1:2430786/150‑1 (MQ=255) cacgcGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCAAACCGAAAACAGCggg > 2:1476287/1‑150 (MQ=255) acgcGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCAAACCGAAAACAGCGGGc < 1:2411404/150‑1 (MQ=255) acgcGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCAAACCGAAAACAGCGGGc < 1:1599877/150‑1 (MQ=255) cgcATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCAAACCGAAAACAGCGGGCATc < 2:585436/150‑1 (MQ=255) cgcATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCAAACCGAAAACAGCGGGCATc < 1:2290537/150‑1 (MQ=255) tcatGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCAAACCGAAAACAGCGGGCATCAAAc > 1:2198896/1‑150 (MQ=255) catGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCAAACCGAAAACAGCGGGCATCAAACg < 2:1012361/150‑1 (MQ=255) catGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCAAACCGAAAACAGCGGGCATCAAACg < 1:257689/150‑1 (MQ=255) aCGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCAAACCGAAAACAGCGGGCATCAAACGTCCAg < 2:1822180/150‑1 (MQ=255) gTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCAAACCGAAAACAGCGGGCATCAAACGTCCAGTc < 2:1059897/150‑1 (MQ=255) gCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCAAACCGAAAACAGCGGGCATCAAACGTCCAGTCGTTa > 1:1681935/1‑150 (MQ=255) gCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCAAACCGAAAACAGCGGGCATCAAACGTCCAGTCGTTa > 1:698348/1‑150 (MQ=255) gCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCAAACCGAAAACAGCGGGCATCAAACGTCCAGTCGTTa > 2:762328/1‑150 (MQ=255) gCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCAAACCGAAAACAGCGGGCATCAAACGTCCAGTCGTTa > 2:1419234/1‑150 (MQ=255) cTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCAAACCGAAAACAGCGGGCATCAAACGTCCAGTCGTTaa > 2:1097641/1‑150 (MQ=255) aaatcgcgcCATTCCCCCAGCGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCGAAACCGAAAACAGCGGGCATCAAACGTCCAGTCGTTaa > 1:1599511/6‑150 (MQ=255) ttAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCAAACCGAAAACAGCGGGCATCAAACGTCCAGTCGTTAAg > 2:1707293/1‑150 (MQ=255) ttAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCAAACCGAAAACAGCGGGCATCAAACGTCCAGTCGTTAAg < 2:65024/150‑1 (MQ=255) aatcgcgcCATTCCCCCAGCGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCAAACCGAAAACAGCGGGCATCAAACGTCCAGTCGTTAAg > 1:391990/5‑150 (MQ=255) tcgcgcCATTCCCCCAGCGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCAAACCGAAAACAGCGGGCATCAAACGTCCAGTCGTTAAGAt > 2:1095690/3‑150 (MQ=255) gcgcCATTCCCCCAGCGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCAAACCGAAAACAGCGGGCATCAAACGTCCAGTCGTTAAGATgg > 2:2381331/1‑150 (MQ=255) cGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCAAACCGAAAACAGCGGGCATCAAACGTCCAGTCGTTAAGATGGa > 1:1538374/1‑150 (MQ=255) ggCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCAAACCGAAAACAGCGGGCATCAAACGTCCAGTCGTTAAGATGGaa < 1:352714/150‑1 (MQ=255) gCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCAAACCGAAAACAGCGGGCATCAAACGTCCAGTCGTTAAGATGGaaa > 1:1754819/1‑150 (MQ=255) gCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCAAACCGAAAACAGCGGGCATCAAACGTCCAGTCGTTAAGATGGaaa > 1:2363308/1‑150 (MQ=255) cGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCAAACCGAAATCAGCGGGCATCAAACGTCCAGTCGTTAAGATGGAAAAAAcgg < 1:1001702/150‑1 (MQ=255) cGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCAAACCGAAAACAGCGGGCATCAAACGTCCAGTCGTTAAGATGGAAAAAAcgg > 1:1069974/1‑150 (MQ=255) cGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCAAACCGAAAACAGCGGGCATCAAACGTCCAGTCGTTAAGAAGGAAAAAAcgg > 2:923113/1‑150 (MQ=255) gCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCAAACCGAAAACAGCGGGCATCAAACGTCCAGTCGTTAAGATGGAAAAAAcggc > 1:1251623/1‑150 (MQ=255) cTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCAAACCGAAAACAGCGGGCATCAAACGTCCAGTCGTTAAGATGGAAAAAAcggcg < 2:271177/150‑1 (MQ=255) cTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCAAACCGAAAACAGCGGGCATCAAACGTCCAGTCGTTAAGATGGAAAAAAcggcg < 1:685133/150‑1 (MQ=255) tGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCAAACCGAAAACAGCGGGCATCAAACGTCCAGTCGTTAAGATGGAAAAAAcggcgg < 1:1080028/150‑1 (MQ=255) tGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCAAACCGAAAACAGCGGGCATCAAACGTCCAGTCGTTAAGATGGAAAAAAcggcgg < 2:1251623/150‑1 (MQ=255) tGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCAAACCGAAAACAGCGGGCATCAAACGTCCAGTCGTTAAGATGGAAAAAAcggcgg < 2:600886/150‑1 (MQ=255) gggggAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCAAACCGAAAACAGCGGGCATCAAACGTCCAGTCGTTAAGATGGAAAAAACGGCGGa < 2:1787858/150‑1 (MQ=255) ggggAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCAAACCGAAAACAGCGGGCATCAAACGTCCAGTCGTTAAGATGGAAAAAACGGCGGaa < 1:1627633/150‑1 (MQ=255) | TAAAAAAGAAGCGCCGTTTGTCTTCCGCATTACCCTGGTGCAGGGGCTGAACCGTCAGATCCGGCGCATGTGCGAGCATTTCGGCTATGAAGTGAAAAAGCTGGAACGCACGCGCATCATGAACGTTAGCTTAAGCGGCATTCCGCTGGGGGAATGGCGCGATTTAACCGACGATGAGTTAATCGACCTCTTTAAGCTCATTGAAAATTCCTCTTCCGAGGTAAAACCTAAAGCGAAGGCCAAACCGAAAACAGCGGGCATCAAACGTCCAGTCGTTAAGATGGAAAAAACGGCGGAA > NC_000913/4230860‑4231157 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |