Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 4,261,358 | T→A | 8.3% | intergenic (+52/‑311) | yjbM → / → dusA | uncharacterized protein YjbM/tRNA‑dihydrouridine synthase A |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,261,358 | 0 | T | A | 8.3% | 501.5 / 26.6 | 168 | intergenic (+52/‑311) | yjbM/dusA | uncharacterized protein YjbM/tRNA‑dihydrouridine synthase A |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (71/83); new base A (5/9); total (76/92) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.79e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.33e-01 |
Only 100 of 174 total aligned reads displayed.
CGAAGTCGTTTGACCCAACCTCAAAGGAAGAGATTAAAATACTTACAGACACTTCTAAATTAATTTATGATTTGTTCGGGGTTAAATCGGAGAAATAATATGTGAAGTTCTTCGATAGTATGGAAGGCATTATATAAAAGGACCCAATATTTATTGGGTTCTTTTTTCTCTATCAATACTATTAGCAGGGAGATATATCACCAGAGTTTAATGTGTGATTTTTTATTTATCGTCGAACCTGGATTGTTTATCATTGGCCTTAACAAAGTTAACGGCTAATAAGATTATTTCCATCAC > NC_000913/4261209‑4261505 | cgAAGTCGTTTGACCCAACCTCAAAGGAAGAGATTAAAATACTTACAGCCACTTCTAAAATAATTTATGATTTGTTCGGGGTTAAATCGGAGAAATAATATGTGAAGTTCTTCGATAGTATGGAAGGCATTATATAAAAGGACCCAatat < 2:1287609/150‑1 (MQ=255) cgAAGTCGTTTGACCCAACCTCAAAGGAAGAGATTAAAATACTTACAGACACTTCTAAATTAATTTATGATTTGTTCGGGGTTAAATCGGAGAAATAATATGTGAAGTTCTTCGATAGTATGGAAGGCATTATATAAAAGGACCCAatat < 2:1985669/150‑1 (MQ=255) aaGTCGTTTGACCCAACCTCAAAGGAAGAGATTAAAATACTTACAGACACTTCTAAATTAATTTATGATTTGTTCGGGGTTAAATCGGAGAAATAATATGTGAAGTTCTTCGATAGTATGGAAGGCATTATATAAAAGGACCCAAtattt < 2:1393834/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |