| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,433,320 | 0 | T | C | 6.9% | 384.3 / 13.9 | 132 | G235G (GGA→GGG) | qorB | NAD(P)H:quinone oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (60/62); new base C (4/5); total (64/68) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.14e-01 | |||||||||||
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
TAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGCCTTCGTGACC > NC_000913/4433172‑4433469 | taACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGGGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTGTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTc < 1:2039313/150‑1 (MQ=255) ttAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATGCGCCAGTCCGTCGGGCAGTccgccg > 1:1580570/1‑150 (MQ=255) ttAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACg < 2:1770353/150‑1 (MQ=255) 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aGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGACTGCCCGACggactgg < 1:1265034/150‑7 (MQ=255) tACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCcgc > 2:1706862/1‑150 (MQ=255) tACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCcgc > 1:1461591/1‑150 (MQ=255) cTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCgcggcg < 1:714624/150‑1 (MQ=255) cTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCgcggcg < 1:933493/150‑1 (MQ=255) 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aGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAAcc < 1:1706862/150‑1 (MQ=255) gTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCt > 2:1182744/1‑150 (MQ=255) ccGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTg < 1:213598/150‑1 (MQ=255) ccGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCGCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTg < 2:2139371/150‑1 (MQ=255) cGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGc > 2:747784/1‑150 (MQ=255) gTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATATGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGGCCGCCAGTTCGTAAACCTTGcc < 2:1691016/150‑1 (MQ=255) gTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGcc > 1:2258457/1‑150 (MQ=255) ggCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGCCTTCg < 1:1951527/150‑1 (MQ=255) cAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGCCTTCGTg < 1:1680975/150‑1 (MQ=255) cAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGCCTTCGTg < 2:500833/150‑1 (MQ=255) cAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGCCTTCGTg < 1:1174632/150‑1 (MQ=255) | TAACATTAAAAAGATGGCTTACGCTTTCGGCTAACGTTGTCGTTGGGTGGCCAATCAATTTGCTAAGTGTTTTGCTGTCATCAAACAGACCGCCTTTCGATGCGCCAACGTCAGAATCCGCCAGCATATCCGCCAGTCCGTCGGGCAGTCCGACGCTTTTCAGTGCCGCGGCGAAATCGGCTTCGCTCAGATTTTGATAGGTAACCTGTTTGCCGCTCTGTTTGGTCAGCTCTGCCGCTAACTGTGTCAACGTCCAGGCACTATCGCCCGCCAGTTCGTAAACCTTGCCTTCGTGACC > NC_000913/4433172‑4433469 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |