Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,439,845 | 0 | T | A | 6.5% | 567.1 / 19.9 | 185 | intergenic (+52/+27) | ytfK/ytfL | DUF1107 domain‑containing protein YtfK/putative inner membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (84/89); new base A (9/3); total (93/92) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.33e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 188 total aligned reads displayed.
GTAAGATTCTTATCCCAAAAGTGAAGGATAAGCTGCATTTGTCAGTGATGTCCGAAGTTAACCGTCAGGTTATGCGTCTGCAAACAGAGATGGCTTAACCAAAGTGCTATGCAGTAAAAAGTGCTATGCAGTAATAAGACGGCTCCTGATTCAGGAGCCGTTGATGTTTCTGGGGGTTACGCGACGCTTTCTTCTTTATCTTTAGCGTCAGGCAGTTTTGGCGAAAGGGCGGTGGCCTTGCTGTCGATCCGGGTCACCAGCAGCTGGTCGATGCGGTAGTTATCGATATCCACCA > NC_000913/4439696‑4439990 | gTAAGATTCTTATCCCAAAAGTGAAGGATAAGCTGCATTTGTCAGTGATGTCCGAAGTTAACCGTCAGGTTATGCGTCTGCAAACAGAGATGGCTTAACCAAAGTGCTATGCAGTAAAAAGTGCTATGCAGTAATAAGACGGCTCCTGAt < 1:2425533/150‑1 (MQ=255) taTTCTTATCCCAAAAGTGAAGGATAAGCTGCATTTGTCAGTGATGTCCGAAGTTAACCGTCAGGTTATGCGTCTGCAAACAGAGATGGCTTAACCAAAGTGCTATGCAGTAAAAAGTGCTATGCAGTAATAAGACGGCTCCTGATTCAg < 1:1792673/149‑1 (MQ=255) aTTCTTATCCCAAAAGTGAAGGATAAGCTGCATTTGTCAGTGATGTCCGAAGTTAACCGTCAGGTTATGCGTCTGCAAACAGAGATGGCTTAACCAATGTGCTATGCAGTAAAAAGTGCTATGCAGTAATAAGACGGCTCCTGATTCAgg < 2:2011525/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |