Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 4,510,336 | A→C | 10.6% | intergenic (+203/+354) | yjhV → / ← fecE | KpLE2 phage‑like element; putative uncharacterized protein YjhV/ferric citrate ABC transporter ATP binding subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,510,336 | 0 | A | C | 10.6% | 344.7 / 35.0 | 132 | intergenic (+203/+354) | yjhV/fecE | KpLE2 phage‑like element; putative uncharacterized protein YjhV/ferric citrate ABC transporter ATP binding subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (60/58); new base C (4/10); total (64/68) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.59e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.87e-01 |
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
CACTTTTTAGAAAAATCGATGGTCAGAAACTGGATTAGCAATTCCGTTCCATGGTTGCTTTTGATTTACGTTGGCGTCTGATCATTGATTTATCCTCAAAAGCCCAACCTCATTGGTAATGAACCAGCTCCGTGAATGTCCGCTCTGGCACAGAGCGAAATTTTTTGATCTCCCCCCTGAAATCTAAACTTAGTCATGTCACGTTTTTGGGTTTCTAAAATTTTAACTTCGCGTTTTTCGTTGCCGTAAGGGTTATACAGAAATGTCCGTTAAGCAGAGTTCAAAATTGATTGCCGTG > NC_000913/4510187‑4510484 | cacTTTTTAGAAAAATCGATGGTCAGAAACTGGATTAGCAATTCCGTTCCATGGTTGCTTTTGATTTACGTTGGCGTCTGATCATTGATTTATCCTCAAAAGCCCAACCTCATTGGTAATGAACCAGCTCCGTGAATGTCCGCTCTGGca > 1:1336988/1‑150 (MQ=255) cTTTTTAGAAAAATCGATGGTCAGAAACTGGATTAGCAATTCCGTTCCATGGTTGCTTTTGATTTACGTTGGCGTCTGATCATTGATTTATCCTCAAAAGCCCAACCTCATTGGTAATGAACCAGCTCCGTGAATGTCCGCTCTGGcaca > 2:1143675/1‑150 (MQ=255) tttAGAAAAATCGATGGTCAGAAACTGGATTAGCAATTCCGTTCCATGGTTGCTTTTGATTTACGTTGGCGTCTGATCATTGATTTATCCTCAAAAGCCCAACCTCATTGGTAATGAACCAGCTCCGTGAATGTCCGCTCTGGCACagag < 2:561186/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |