Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,517,556 | 0 | T | G | 5.9% | 552.4 / 20.2 | 182 | E54D (GAA→GAC) ‡ | fecR | regulator for fec operon, periplasmic |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (84/87); new base G (4/7); total (88/94) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.39e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 190 total aligned reads displayed.
CCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGACGGCGGGTGAGGCGGGTATCGTGCAACGCCCGGCTGGCAACGTCGCCAGGCACACCGCCAAGCTGGTTGCGCAGGTTTTCAACCTGCTGCCAGGCCCACTGGTTATCCTGATCCTGTTCATACCACTGTTGCCAGCGCGCTTCCTGTTGTGGGCTGACGCGCTCGCCGCTTAGCACGGCATACCAGTGGGAAGCTGAACGCAGCGCCTGACGGCGGGAATCGGTTAA > NC_000913/4517407‑4517705 | gTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGACGGCGGGTGAGGCGGGTATCGTGCAACGCCCGGCTGGCAACGTCGCCAGGCACACCGCCAAGCTGGTTGCGCAGGTTTTCa < 1:908700/150‑1 (MQ=255) tttCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGACGGCGGGTGAGGCGGGTATCGTGCAACGCCCGGCTGGCAACGTCGCCAGGCACACCGCCAAGCTGGTTGCGCAGGTTTTCaa < 1:1219696/150‑1 (MQ=255) ttCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGACGGCGGGTGAGGCGGGTATCGTGCAACGCCCGGCTGGCAACGTCGCCAGGCACACCGCCAAGCTGGTTGCGCAGGTTTTCAAc < 2:1280125/150‑1 (MQ=255) 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tGCGCAGGTTTTCAACCTGCTGCCAGGCCCACTGGTTATCCTGATCCTGTTCATACCACTGTTGCCAGCGCGCTTCCTGTTGTGGGCTGACGCGCTCGCCGCTTAGCACGGCATACCAGTGGGAAGCTGAACGCAGCGCCTGACGGCggg < 1:49958/150‑1 (MQ=255) tGCGCAGGTTTTCAACCTGCTGCCAGGCCCACTGGTTATCCTGATCCTGTTCATACCACTGTTGCCAGCGCGCTTCCTGTTGTGGGCTGACGCGCTCGCCGCTTAGCACGGCATACCAGTGGGAAGCTGAACGCAGCGCCTGACGGCggg < 1:1956294/150‑1 (MQ=255) gcagcAGGTTGAAAACCTGCTGCCAGGCCCACTGGTTATCCTGATCCTGTTCATACCACTGTTGCCAGCGCGCTTCCTGTTGTGGGCTGACGCGCTCGCCGCTTAGCACGGCATACCAGTGGGAAGCTGAACGCAGCGCCTGACGGCggg > 1:1608628/4‑150 (MQ=255) cagcAGGTTGAAAACCTGCTGCCAGGCCCACTGGTTATCCTGATCCTGTTCATACCACTGTTGCCAGCGCGCTTCCTGTTGTGGGCTGACGCGCTCGCCGCTTAGCACGGCATACCAGTGGGAAGCTGAACGCAGCGCCTGACGGCGGGa > 2:2093149/3‑150 (MQ=255) cgcAGGTTTTCAACCTGCTGCCAGGCCCACTGGTTATCCTGATCCTGTTCATACCACTGTTGCCAGCGCGCTTCCTGTTGTGGGCTGACGCGCTCGCCGCTTAGCACGGCATACCAGTGGGAAGCGGCACGCAGCGCCTGACGGCGGGaa > 1:1050496/1‑150 (MQ=255) gcAGGTTTTCAACCTGCTGCCAGGCCCACTGGTTATCCTGATCCTGTTCATACCACTGTTGCCAGCGCGCTTCCTGTTGTGGGCTGACGCGCTCGCCGCTTAGCACGGCATACCAGTGGGAAGCTGAACGCAGCGCCTGACGGCGGGAAt > 1:411218/1‑150 (MQ=255) cAGGTTTTCAACCTGCTGCCAGGCCCACTGGTTATCCTGATCCTGTTCATACCACTGTTGCCAGCGCGCTTCCTGTTGTGGGCTGACGCGCTCGCCGCTTAGCACGGCATACCAGTGGGAAGCTGAACGCAGCGCCTGACGGCGGGAATc > 2:807075/1‑150 (MQ=255) ggTTTTCAACCTGCTGCCAGGCCCACTGGTTATCCTGATCCTGTTCATACCACTGTTGCCAGCGCGCTTCCTGTTGTGGGCTGACGCGCTCGCCGCTTAGCACGGCATACCAGTGGGAAGCTGAACGCAGCGCCTGACGGCGGGAATCgg < 2:173092/150‑1 (MQ=255) tttCAACCTGCTGCCAGGCCCACTGGTTATCCTGATCCTGTTCATACCACTGTTGCCAGCGCGCTTCCTGTTGTGGGCTGACGCGCTCGCCGCTTAGCACGGCATACCAGTGGGAAGCTGAACGCAGCGCCTGACGGCGGGAATc > 1:1585221/1‑145 (MQ=255) tttCAACCTGCTGCCAGGCCCACTGGTTATCCTGATCCTGTTCATACCACTGTTGCCAGCGCGCTTCCTGTTGTGGGCTGACGCGCTCGCCGCTTAGCACGGCATACCAGTGGGAAGCTGAACGCAGCGCCTGACGGCGGGAATc < 2:1585221/145‑1 (MQ=255) tttCAACCTGCTGCCAGGCCCACTGGTTATCCTGATCCTGTTCATACCACTGTTGCCAGCGCGCTTCCTGTTGTGGGCTGACGCGCTCGCCGCTTAGCACGGCATACCAGTGGGAAGCTGAACGCAGCGCCTGACGGCGGGAATCGGTTa > 2:381210/1‑150 (MQ=255) ttCAACCTGCTGCCAGGCCCACTGGTTATCCTGATCCTGTTCATACCACTGTTGCCAGCGCGCTTCCTGTTGTGGGCTGACGCGCTCGCCGCTTAGCACGGCATACCAGTGGGAAGCTGAACGCAGCGCCTGACGGCGGGAATCGGTTaa < 2:1807857/150‑1 (MQ=255) | CCGGTTTCCGACTGCCAGAGCTGCCAGCCTCCGCCAGCGCCGAGCAACAGCAGTAATCCTTTCATCACGTGACGGCGGGTGAGGCGGGTATCGTGCAACGCCCGGCTGGCAACGTCGCCAGGCACACCGCCAAGCTGGTTGCGCAGGTTTTCAACCTGCTGCCAGGCCCACTGGTTATCCTGATCCTGTTCATACCACTGTTGCCAGCGCGCTTCCTGTTGTGGGCTGACGCGCTCGCCGCTTAGCACGGCATACCAGTGGGAAGCTGAACGCAGCGCCTGACGGCGGGAATCGGTTAA > NC_000913/4517407‑4517705 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |