| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,554,531 | 0 | C | T | 5.8% | 541.0 / 13.4 | 172 | intergenic (+170/‑45) | uxuB/uxuR | D‑mannonate oxidoreductase/DNA‑binding transcriptional repressor UxuR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (77/84); new base T (4/6); total (81/91) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.50e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 177 total aligned reads displayed.
CTTACTGGTCAATCAAACTGATATTTGGTTGACCAGTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTGCGCAAAGACCTTACCAGGAAGTCGGGGCGATGATCCGCGATCTGATCATAAAGACGCCGTACAATCCTGGCGAACGGCTGCCGCC > NC_000913/4554382‑4554679 | cTTACTGGTCAATCAAACTGATATTTGGTTGACCAGTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCAcgccgc > 1:1719933/1‑150 (MQ=255)cTTACTGGTCAATCAAACTGATATTTGGTTGACCAGTTTTAGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCAcgccgc > 2:1009408/1‑150 (MQ=255) aCTGCTCAATCAAACTGATATTTGGTTGACCAGTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATc < 1:1159807/150‑1 (MQ=255) 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cgccgcATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTGCGCAAAGACCTTACCAGGAAGTCGGGGCGATGATCCGCGATCTGATCATAAAGACGCCGTACAATCCTGGCGAACGGCTgc > 1:2457623/1‑150 (MQ=255) gccgcATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTGCGCAAAGACCTTACCAGGAAGTCGGGGCGATGATCCGCGATCTGATCATAAAGACGCCGTACAATCCTGGCGAACGGCTgcc > 2:1137694/1‑150 (MQ=255) | CTTACTGGTCAATCAAACTGATATTTGGTTGACCAGTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAAAATTTGATTAACCGCACCTAACGGACACAACACCATGAAATCTGCCACCTCTGCGCAAAGACCTTACCAGGAAGTCGGGGCGATGATCCGCGATCTGATCATAAAGACGCCGTACAATCCTGGCGAACGGCTGCCGCC > NC_000913/4554382‑4554679 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |