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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,597,125 | 0 | A | G | 6.5% | 422.4 / 13.6 | 140 | intergenic (+113/+25) | lgoD/opgB | L‑galactonate oxidoreductase/phosphoglycerol transferase I |
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Only 100 of 141 total aligned reads displayed.
TCGTGAGTTAATTAAAGGCGTAATTACTTTCTGATAAGGCGAGATTATTAAAGTTGCCATGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTACCAGTGTGTCGG > NC_000913/4596979‑4597274 | cGTGAGTTAATTAAAGGCGTAATTACTTTCTGATAAGGCGAGATTATTAAAGTTGCCATGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCg < 2:1216791/150‑1 (MQ=255) tGAGTTAATTACAGGCGGAATTAGTTTCTGATAAGGCGCGATTATTAAAGTTGCCATGCAGCGGCCGGGGAAGGGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTTGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGAc < 2:2251709/150‑1 (MQ=255) ggAGTTAATTAAAGGCGTAATTACTTTCTGATAAGGCGAGATTATTAAAGTTGCCATGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGTTCGCACCCTATGCGAc < 1:406904/149‑1 (MQ=255) 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ttaattaaAGGCGTAATTACTTTCTGATAAGGCGAGATTATTAAAGTTGCCATGCAGCGTCCGGGGAAGTGGTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTac < 1:1701757/150‑1 (MQ=255) aattaaAGGCGTAATTACTTTCTGATAAGGCGAGATTATTAAAGTTGCCATGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTacac > 1:27717/1‑150 (MQ=255) attaaAGGCGTAATTACTTTCTGATAAGGCGAGATTATTAAAGTTGCCATGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCATAGGGTGCGACCTacacg < 1:1828089/150‑2 (MQ=255) ttaaAGGCGTAGTTACTTTCTGATAAGGCGAGATTATTAAAGTTGCCATGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCATAGGGTGCGACCTacacgc < 2:35810/150‑3 (MQ=255) taaAGGCGTAATTACTTTCTGATAAGGCGAGATTATTAAAGTTGCCATGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACAtc < 2:774697/150‑1 (MQ=255) 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gtAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAAt < 1:431683/150‑1 (MQ=255) tAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAAtt > 1:2449850/1‑150 (MQ=255) tAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAAtt > 1:1664744/1‑150 (MQ=255) tAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAAtt > 1:2343748/1‑150 (MQ=255) aGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTTATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTa < 1:1322359/150‑1 (MQ=255) aGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTa > 1:1742544/1‑150 (MQ=255) aGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTa > 2:174857/1‑150 (MQ=255) ggTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTAc > 2:769402/1‑150 (MQ=255) gTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTAcc < 1:472098/150‑1 (MQ=255) tCGCACCCTATGCGGCCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTACCa < 2:1287249/150‑1 (MQ=255) tATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTACCAGTGTGTCg > 2:2473014/1‑150 (MQ=255) aTGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTACCAGTGTGTCgg < 2:1154781/150‑1 (MQ=255) | TCGTGAGTTAATTAAAGGCGTAATTACTTTCTGATAAGGCGAGATTATTAAAGTTGCCATGCAGCGTCCGGGGAAGTGTTGGGCGCTGTTTTTTTTGTTTCTTAATAATGTGTTGTAAGCCGTAGAAGGCGTGTAGGTCGCACCCTATGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTACCAGTGTGTCGG > NC_000913/4596979‑4597274 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |