| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 585,866 | G→A | 5.5% | intergenic (‑233/+281) | ompT ← / ← envY | outer membrane protease VII (outer membrane protein 3b)/DNA‑binding transcriptional activator EnvY |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 585,866 | 0 | G | A | 5.5% | 584.2 / 13.7 | 181 | intergenic (‑233/+281) | ompT/envY | outer membrane protease VII (outer membrane protein 3b)/DNA‑binding transcriptional activator EnvY |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (95/76); new base A (4/6); total (99/82) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.52e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.37e-01 | |||||||||||
Only 100 of 192 total aligned reads displayed.
GTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAGGTAGTGGGACGTGTGAGCGCAGAG > NC_000913/585718‑586015 | gTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTaga > 2:1395358/1‑150 (MQ=255)gTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTaga < 1:1292522/150‑1 (MQ=255) tttATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTagag > 1:211510/1‑150 (MQ=255) tttATATTTTGTTTAGTATTGAATGAGTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTagag < 2:2174319/150‑1 (MQ=255) atatTTTGTTTAGTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCa < 1:1246143/150‑1 (MQ=255) atatTTTGTTTAGTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCa < 2:155353/150‑1 (MQ=255) atTTTGTTTAGTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCata > 2:1140634/1‑150 (MQ=255) tttGTTTAGTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTCTAAAGGCatggc < 2:1993388/150‑4 (MQ=255) ttGTTTAGTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTCTAAAGGCatggca < 1:1931537/150‑5 (MQ=255) gTTTAGTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTTTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTCTAAAGGCatggcact < 2:2426322/150‑7 (MQ=255) gTTTAGTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGc < 1:14687/150‑1 (MQ=255) tttAGTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCg < 1:1563319/150‑1 (MQ=255) ttAGTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGa > 1:1710876/1‑150 (MQ=255) tATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAAt < 1:2320363/150‑1 (MQ=255) aTTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATa < 1:2074112/150‑1 (MQ=255) tGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGc < 2:89286/150‑1 (MQ=255) gAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCa > 2:199482/1‑150 (MQ=255) gAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCa > 1:1905825/1‑150 (MQ=255) aaTGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCAt < 1:1360391/150‑1 (MQ=255) tGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGa > 2:206402/1‑150 (MQ=255) tATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGtt < 1:2394463/150‑1 (MQ=255) aTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGttt > 1:2457908/1‑150 (MQ=255) aTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGttt > 1:1072877/1‑150 (MQ=255) tCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATTTAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTa > 2:1415733/1‑150 (MQ=255) tCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATATATTTAATTGCAATGCATTTAGAGGAATATAAGCGAAAATAGCATGAGGtttt > 1:1026988/1‑149 (MQ=255) acaATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATc > 2:1513325/1‑150 (MQ=255) acaATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATc > 2:811177/1‑150 (MQ=255) caATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATcc < 2:77198/150‑1 (MQ=255) aTGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTc < 2:65797/150‑1 (MQ=255) gcgcTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCaa > 2:944546/1‑150 (MQ=255) cTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTa > 1:2184426/1‑150 (MQ=255) cTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTa > 1:2048150/1‑150 (MQ=255) aTCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATc < 1:1218373/140‑1 (MQ=255) aTCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATc > 2:1218373/1‑140 (MQ=255) tCTGTTTTTGTTTTAATTATCTGTTTTTGTTTCATATTTCGGCTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTa < 1:1194258/150‑1 (MQ=255) tGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGtttttt < 1:1485274/150‑1 (MQ=255) ggTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTa > 2:684723/1‑150 (MQ=255) gTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAg < 2:311267/150‑1 (MQ=255) ttAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTa > 1:167658/1‑150 (MQ=255) tAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTAc < 2:526911/150‑1 (MQ=255) aaTTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACa > 1:1282385/1‑150 (MQ=255) aaTTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACa < 2:167658/150‑1 (MQ=255) tATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACaaaa > 1:670592/1‑150 (MQ=255) aTCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACaaaaa > 1:1643102/1‑150 (MQ=255) aTCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACaaaaa < 2:325843/150‑1 (MQ=255) aTCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACaaaaa > 1:331447/1‑150 (MQ=255) cTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAag > 2:1596296/1‑150 (MQ=255) tGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAaga > 1:1810389/1‑150 (MQ=255) gTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCACGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAagag < 2:1736304/150‑1 (MQ=255) tATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAggg < 2:193570/150‑1 (MQ=255) aTTGTTTCATATTTAGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGa > 2:1175769/1‑150 (MQ=255) ttCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACaaaa > 1:1826294/1‑150 (MQ=255) cATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACt > 2:2014512/1‑150 (MQ=255) cATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACt > 2:1321128/1‑150 (MQ=255) atTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTgag < 2:108625/150‑1 (MQ=255) tttCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGAGAAAACTgaga > 2:407664/1‑150 (MQ=255) tttCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTgaga > 2:636573/1‑150 (MQ=255) ttCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGac < 1:560840/150‑1 (MQ=255) cGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGacac > 1:595006/1‑150 (MQ=255) cGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGacac > 2:1872150/1‑150 (MQ=255) ggTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGAcaca < 2:1282385/150‑1 (MQ=255) tttACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATaa > 1:1958102/1‑150 (MQ=255) tgGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCa > 1:871190/1‑150 (MQ=255) ttttttATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATgg < 2:1722741/150‑1 (MQ=255) tATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGc > 1:1768283/1‑150 (MQ=255) aTGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCa > 1:235219/1‑150 (MQ=255) tGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCaa > 2:1046374/1‑150 (MQ=255) gCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAg < 2:1755752/150‑1 (MQ=255) cTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGACTTTAGAGGCATATAAGAGAAAATAGCATGAGGATTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGTTACAAAACTCAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAgg > 2:863409/1‑150 (MQ=255) ttttGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGc < 1:375822/150‑1 (MQ=255) ttttGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGCTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGc < 2:271845/150‑1 (MQ=255) gtggtgCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTa > 1:1172050/1‑150 (MQ=255) tggtgCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTAc < 1:1083272/150‑1 (MQ=255) gtgCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACAt > 1:65363/1‑150 (MQ=255) gtgCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACAt > 2:568418/1‑150 (MQ=255) tgCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATg > 1:259663/1‑150 (MQ=255) tgCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATg > 2:2407579/1‑150 (MQ=255) cTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGtt > 2:1600356/1‑150 (MQ=255) cTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGtt < 2:1788588/150‑1 (MQ=255) aTCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAg > 1:1432054/1‑150 (MQ=255) aTCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAg < 1:521189/150‑1 (MQ=255) aTCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAg < 1:1611397/150‑1 (MQ=255) tCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAgg > 2:2002654/1‑150 (MQ=255) tCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAgg < 1:1158619/150‑1 (MQ=255) cTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAGGt < 1:2014512/150‑1 (MQ=255) aTTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAGGTAg > 1:1944777/1‑150 (MQ=255) aTTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAGGTAg > 1:435984/1‑150 (MQ=255) tttAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAGGTAGt > 2:1204842/1‑150 (MQ=255) ttAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAGGTAGTg < 2:1094337/150‑1 (MQ=255) ttAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAGGTAGTg < 1:2249148/150‑1 (MQ=255) tAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAGGTAGTgg > 1:938546/1‑150 (MQ=255) gcttataTGCCTCTAAAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAGGTAGTGGGa > 2:2220797/7‑150 (MQ=255) gcttataTGCCTCTAAAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATG‑TTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAGGTAGTGGGAc > 2:1361471/7‑150 (MQ=255) ccATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAGGTAGTGGGACgtg < 1:944546/150‑1 (MQ=255) cATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACGAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAGGTAGTGGGACgtgt > 1:343505/1‑150 (MQ=255) cATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAGGTAGTGGGACgtgt > 1:2473558/1‑150 (MQ=255) tGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAGGTAGTGGGACGTGTGa > 2:2387879/1‑150 (MQ=255) tAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAGGTAGTGGGACGTGTGAGCGCag < 1:1188045/150‑1 (MQ=255) gagGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAGGTAGTGGGACgtg > 1:2196892/1‑139 (MQ=255) gagGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAGGTAGTGGGACgtg < 2:2196892/139‑1 (MQ=255) | GTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAGGTAGTGGGACGTGTGAGCGCAGAG > NC_000913/585718‑586015 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |