Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 892,025 | A→C | 5.5% | E20A (GAA→GCA) | rimK → | ribosomal protein S6 modification protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 892,025 | 0 | A | C | 5.5% | 431.6 / 12.1 | 140 | E20A (GAA→GCA) | rimK | ribosomal protein S6 modification protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (70/62); new base C (4/4); total (74/66) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 141 total aligned reads displayed.
TTTGCACAAACAGGGTTGGGCGACGCGCTAAAACCGCCACGTCGATGTATGATACGCGGGCTTTTGACCAGGTCTGACAGAGAGGTGCAGGGTGAAAATTGCCATATTGTCCCGGGATGGAACGCTCTATTCGTGTAAGCGGCTGCGTGAAGCCGCTATACAGCGCGGTCACCTGGTTGAAATTCTTGATCCGCTTTCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCAT > NC_000913/891876‑892172 | tttGCACAAACAGGGTTGGGCGACGCGCTAAAACCGCCACGTCGATGTATGATACGCGGGCTTTTGACCAGGTCTGACAGAGAGGTGCAGGGTGAAAATTGCCATATTGTCCCGGGATGGAACGCTCTATTCGTGTAAGCGGCTGCGTGa > 1:1192363/1‑150 (MQ=255) tGCACAAACAGGGTTGGGCGACGCGCTAAAACCGCCACGTCGATGTATGATACGCGGGCTTTTGACCAGGTCTGACAGAGAGGTGCAGGGTGAAAATTGCCATATTGTCCCGGGATGGAACGCTCTATTCGTGTAAGCGGCTGCGTGAAg < 1:1734111/150‑1 (MQ=255) caAACAGGGTTGGGCGACGCGCTAAAACCGCCACGTCGATGTATGATACGCGGGCTTTTGACCAGGTCTGACAGAGAGGTGCAGGGTGAAAATTGCCATATTGTCCCGGGATGGAACGCTCTATTCGTGTAAGCGGCTGCGTGAAGCCGc > 1:1022140/1‑150 (MQ=255) caAACAGGGTTGGGCGACGCGCTAAAACCGCCACGTCGATGTATGATACGCGGGCTTTTGACCAGGTCTGACAGAGAGGTGCAGGGTGAAAATTGCCATATTGTCCCGGGATGGAACGCTCTATTCGTGTAAGCGGCTGCGTGAAGCCGc > 1:2474252/1‑150 (MQ=255) aaCAGGGTTGGGCGACGCGCTAAAACCGCCACGTCGATGTATGATACGCGGGCTTTTGACCAGGTCTGACAGAGAGGTGCAGGGTGAAAATTGCCATATTGTCCCGGGATGGAACGCTCTATTCGTGTAAGCGGCTTCACGCAGCCGCtt < 2:2314668/150‑2 (MQ=255) aaCAGGGTTGGGCGACGCGCTAAAACCGCCACGTCGATGTATGATACGCGGGCTTTTGACCAGGTCTGACAGAGAGGTGCAGGGTGAAAATTGCCATATTGTCCCGGGATGGAACGCTCTATTCGTGTAAGCGGCTTCACGCAGCCGCtt < 2:2383077/150‑2 (MQ=255) aaCAGGGTTGGGCGACGCGCTAAAACCGCCACGTCGATGTATGATACGCGGGCTTTTGACCAGGTCTGACAGAGAGGTGCAGGGTGAAAATTGCCATATTGTCCCGGGATGGAACGCTCTATTCGTGTAAGCGGCTGCGTGAAGCCGCta > 1:1382012/1‑150 (MQ=255) cAGGGTTGGGCGACGCGCTAAAACCGCCACGTCGATGTATGATACGCGGGCTTTTGACCAGGTCTGACAGAGAGGTGCAGGGTGAAAATTGCCATATTGTCCCGGGATGGAACGCTCTATTCGTGTAAGCGGCTGCGTGAAGCCGCtata > 2:719024/1‑150 (MQ=255) tGGGCGACGCGCTAAAACCGCCACGTCGATGTATGATACGCGGGCTTTTGACCAGGTCTGACAGAGAGGTGCAGGGTGAAAATTGCCATATTGTCCCGGGATGGAACGCTCTATTCGTGTAAGCGGCTGCGTGAAGCCGCTATACAgcgc < 1:207672/150‑1 (MQ=255) gggCGACGCGCTAAAACCGCCACGTCGATGTATGATACGCGGGCTTTTGACCAGGTCTGACAGAGAGGTGCAGGGTGAAAATTGCCATATTGTCCCGGGATGGAACGCTCTATTCGTGTAAGCGGCTGCGTGAAGCCGCTATACAGcgcg > 1:1293259/1‑150 (MQ=255) gggCGACGCGCTAAAACCGCCACGTCGATGTATGATACGCGGGCTTTTGACCAGGTCTGACAGAGAGGTGCAGGGTGAAAATTGCCATATTGTCCCGGGATGGAACGCTCTATTCGTGTAAGCGGCTGCGTGAAGCCGCTATACAGcgcg < 2:2065311/150‑1 (MQ=255) ggCGACGCGCTAAAACCGCCACGTCGATGTATGATACGCGGGCTTTTGACCAGGTCTGACAGAGAGGTGCAGGGTGAAAATTGCCATATTGTCCCGGGATGGAACGCTCTATTCGTGTAAGCGGCTGCGTGAAGCCGCTATACAGCGCgg < 2:930152/150‑1 (MQ=255) cGACGCGCTAAAACCGCCACGTCGATGTATGATACGCGGGCTTTTGACCAGGTCTGACAGAGAGGTGCAGGGTGAAAATTGCCATATTGTCCCGGGATGGAACGCTCTATTCGTGTAAGCGGCTGCGTGAAGCCGCTATACAGCGCGGTc > 2:343/1‑150 (MQ=255) cGACGCGCTAAAACCGCCACGTCGATGTATGATACGCGGGCTTTTGACCAGGTCTGACAGAGAGGTGCAGGGTGAAAATTGCCATATTGTCCCGGGATGGAACGCTCTATTCGTGTAAGCGGCTGCGTGAAGCCGCTATACAGCGCGGTc > 2:234474/1‑150 (MQ=255) gACGCGCTAAAACCGCCACGTCGATGTATGATACGCGGGCTTTTGACCAGGTCTGACAGAGAGGTGCAGGGTGAAAATTGCCATATTGTCCCGGGATGGAACGCTCTATTCGTGTAAGCGGCTGCGTGAAGCCGCTATACAGCGCGGTCa > 1:501198/1‑150 (MQ=255) gcTAAAACCGCCACGTCGATGTATGATACGCGGGCTTTTGACCAGGTCTGACAGAGAGGTGCAGGGTGAAAATTGCCATATTGTCCCGGGATGGAACGCTCTATTCGTGTAAGCGGCTGCGTGAAGCCGCTATACAGCGCGGTCACCTgg > 1:1037876/1‑150 (MQ=255) cTAAAACCGCCACGTCGATGTATGATACGCGGGCTTTTGACCAGGTCTGACAGAGAGGTGCAGGGTGAAAATTGCCATATTGTCCCGGGATGGAACGCTCTATTCGTGTAAGCGGCTGCGTGAAGCCGCTATACAGCGCGGTCACCTGGt < 2:1914620/150‑1 (MQ=255) cTAAAACCGCCACGTCGATGTATGATACGCGGGCTTTTGACCAGGTCTGACAGAGAGGTGCAGGGTGAAAATTGCCATATTGTCCCGGGATGGAACGCTCTATTCGTGTAAGCGGCTGCGTGAAGCCGCTATACAGCGCGGTCACCTGGt < 1:493879/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |