| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 103,611 | A→T | 5.6% | S153C (AGC→TGC) | ftsQ → | cell division protein FtsQ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 103,611 | 0 | A | T | 5.6% | 537.7 / 12.4 | 169 | S153C (AGC→TGC) | ftsQ | cell division protein FtsQ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (79/80); new base T (6/4); total (85/84) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.46e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 178 total aligned reads displayed.
TGCCGTGGATTAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGTTCCTGGCAGTTGACG > NC_000913/103462‑103760 | tGCCGTGGATTAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCa > 2:128154/1‑150 (MQ=255) gCCGTGGATTAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCag > 1:1125843/1‑150 (MQ=255) gCCGTGGATTAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCag > 1:276047/1‑150 (MQ=255) gCCGTGGATTAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCac > 2:2222031/1‑149 (MQ=255) gTGGATTAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCagcaa > 2:1594023/1‑150 (MQ=255) gTGGATTAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCagcaa < 1:398642/150‑1 (MQ=255) ggATTAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCagcaagc > 1:1951420/1‑150 (MQ=255) ttAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAgg < 2:133837/150‑1 (MQ=255) ttAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAgg < 1:1550855/150‑1 (MQ=255) aaGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTg < 1:1111467/150‑1 (MQ=255) aaGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTg > 2:148493/1‑150 (MQ=255) aGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGc > 2:910224/1‑150 (MQ=255) aGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTc > 1:2116041/1‑150 (MQ=255) ggTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTcc < 1:2161817/150‑1 (MQ=255) ggTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGATTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTcc < 1:1740102/150‑1 (MQ=255) ggTGAGCGGCAGAAAGCAGAGGCCTGAGGACGAGAAGAGTCAGCTGGTTGAATATGTCCCGATTGCGCGGCGGACTGATCACCATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCTGCTTGCTGGTGcgttc < 2:2097021/150‑5 (MQ=255) gTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCTGCTTGCTGGTGcgttct < 1:1750634/150‑6 (MQ=255) gTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTg > 1:2427905/1‑150 (MQ=255) aaaGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATgg > 1:29070/1‑150 (MQ=255) gTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGa > 2:1014427/1‑150 (MQ=255) ggCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAg > 1:2298238/1‑150 (MQ=255) gCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAgg < 1:1940101/150‑1 (MQ=255) gCCTGAAGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATCTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACCCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCACAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCAGTATGGCCCGCAAgg > 2:162638/1‑150 (MQ=255) cTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCa > 1:1156438/1‑150 (MQ=255) cTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCa > 1:871683/1‑150 (MQ=255) tgatgaATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAg < 2:1517721/150‑1 (MQ=255) atgaATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAgcg < 2:2337572/150‑1 (MQ=255) atgaATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAgcg < 2:751129/150‑1 (MQ=255) atgaATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGAATGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAgcg < 2:1750442/150‑1 (MQ=255) tgaATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAgcgc > 1:1072630/1‑150 (MQ=255) tgaATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATAAACATATGGTAGAAGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAgcgc > 2:2419215/1‑150 (MQ=255) gaATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGcc < 2:1402030/150‑1 (MQ=255) aaTTGAAGATTCAGCGGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAAGGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAACACCTTCAGCGTGCCGCCAGATCGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGcct < 2:793633/150‑2 (MQ=255) aTTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCaa > 2:1493583/1‑150 (MQ=255) ttGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAAt < 1:18766/150‑1 (MQ=255) tGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATg > 2:2024987/1‑150 (MQ=255) tGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATg < 1:158434/150‑1 (MQ=255) gAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGa > 1:686520/1‑150 (MQ=255) gAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGa > 2:2221311/1‑150 (MQ=255) aaGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGaa < 2:1929418/150‑1 (MQ=255) cATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTg > 2:1772367/1‑150 (MQ=255) aTCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGc < 1:1777869/150‑1 (MQ=255) aTCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGc > 1:1501543/1‑150 (MQ=255) aTCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGc > 2:2124218/1‑150 (MQ=255) tCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCATAAGGTAACATCAATCTGGTTCTTCCTATTTTTTATGGCCAGTAATGTAGCGCCAATGAAGTGTTGCa < 2:346329/150‑1 (MQ=255) tCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCa > 2:833085/1‑150 (MQ=255) cTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAg < 2:2069854/150‑1 (MQ=255) cTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAg < 2:689318/150‑1 (MQ=255) ggTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAggg > 1:2455728/1‑150 (MQ=255) gTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGc < 1:833085/150‑1 (MQ=255) ttGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCt > 2:1932123/1‑150 (MQ=255) tGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTa < 1:2201627/150‑1 (MQ=255) tGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGACAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTCTTGCAGGGCTa > 2:112229/1‑150 (MQ=255) gtgCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACTCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCAGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGaa > 2:454238/1‑150 (MQ=255) tgCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGaaa > 1:2109592/1‑150 (MQ=255) gCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAAt > 2:1725974/1‑150 (MQ=255) ccGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATg < 1:736838/150‑1 (MQ=255) tGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCa < 1:139799/150‑1 (MQ=255) tGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCa < 1:148493/150‑1 (MQ=255) cgGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATg < 1:1211952/150‑1 (MQ=255) ggAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTgg < 1:2024987/150‑1 (MQ=255) ggAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTgg > 2:681692/1‑150 (MQ=255) gATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAg < 1:1772367/150‑1 (MQ=255) gATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAg < 1:947866/150‑1 (MQ=255) aTCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAgg > 2:287060/1‑150 (MQ=255) aTCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAgg < 1:1658929/150‑1 (MQ=255) aaCATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCAGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACa > 2:1050539/1‑150 (MQ=255) atGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGAttt > 2:10379/1‑150 (MQ=255) tGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTa > 2:672774/1‑150 (MQ=255) ggcggcaCGCTGAAGGTATTTCCTTCCGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTa > 2:2078990/7‑150 (MQ=255) ggTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTAc > 1:1928654/1‑150 (MQ=255) ggTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTAc < 1:1775804/150‑1 (MQ=255) ggTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTAc > 2:1210024/1‑150 (MQ=255) aCGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTga < 2:2427905/150‑1 (MQ=255) cgcgGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTgaa < 1:1612309/150‑1 (MQ=255) gcgGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCTCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTgaag < 1:1679879/150‑1 (MQ=255) gcgGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTgaag < 1:2479616/150‑1 (MQ=255) cgGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTgaagg < 2:337529/150‑1 (MQ=255) gaaATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAgcgg > 1:1848403/1‑150 (MQ=255) acaCCTTCAGCGTGCCGCCAGATCGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCAGAAGGAAgcggccc < 2:1183025/148‑3 (MQ=255) aCCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATg < 1:205775/150‑1 (MQ=255) ccTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGa > 2:1875418/1‑150 (MQ=255) cTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGAc < 1:504789/150‑1 (MQ=255) cGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACcgcgcg > 1:1374404/1‑150 (MQ=255) gTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGTCTATTGTGAAATTTGGGAGATGCTGGCAATTGAGAGATTTACTCTGAAGGAAGGGGCGATGACGGCtcgg < 2:1368403/150‑1 (MQ=255) gTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCgcgg < 1:1096225/150‑1 (MQ=255) tGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCgcggc > 2:2355623/1‑150 (MQ=255) gccgccAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCgcggcg > 2:1661195/1‑150 (MQ=255) gccgccAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCgcggcg < 2:863656/150‑1 (MQ=255) attggaagCACCTGCTTGCTGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGTTcc > 1:73539/8‑150 (MQ=255) tggaagCACCTGCTTGCTGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGTTCCTg > 2:470647/6‑150 (MQ=255) ggaagCACCTGCTTGCTGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGTTCCTgg > 2:1685534/5‑150 (MQ=255) ggaagCACCTGCTTGCTGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGTTCCTgg > 1:1619974/5‑150 (MQ=255) gAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGCCCGCGCGGCGTTCCTgg > 2:1601555/1‑150 (MQ=255) gAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGTTCCTgg < 1:1725974/150‑1 (MQ=255) gaagCACCTGCTTGCTGGTGCTTCCAATGATGTATGCCCCGGAAGGCAGCCCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAATGACAGATTTACTCTGAAGGAAGAGGAGAAGCACGCGCGGCGTTCCTGGc > 1:1310551/4‑150 (MQ=255) aaCGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGTTCCTGGc < 1:126279/150‑1 (MQ=255) aCGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGTTCCTGGCa < 2:2181761/150‑1 (MQ=255) cGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGTTCCTGGCAg > 2:1965269/1‑150 (MQ=255) gCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGTTCCTGGCAGt < 1:638289/150‑1 (MQ=255) | TGCCGTGGATTAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGTTCCTGGCAGTTGACG > NC_000913/103462‑103760 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |