| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 103,614 | A→T | 6.2% | K154* (AAG→TAG) ‡ | ftsQ → | cell division protein FtsQ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 103,614 | 0 | A | T | 6.2% | 540.0 / 14.5 | 169 | K154* (AAG→TAG) ‡ | ftsQ | cell division protein FtsQ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (78/80); new base T (7/4); total (85/84) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.35e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 180 total aligned reads displayed.
GTGGATTAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGTTCCTGGCAGTTGACGCTG > NC_000913/103466‑103763 | aaGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTg < 1:1111467/150‑1 (MQ=255) aaGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTg > 2:139799/1‑150 (MQ=255) aaGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTg > 2:148493/1‑150 (MQ=255) aGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGc > 2:910224/1‑150 (MQ=255) gTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCTGCTTGCTGGTGcgttct < 2:2012357/150‑6 (MQ=255) gTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCTGCTTGCTGGTGcgttct < 1:1750634/150‑6 (MQ=255) tCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGt > 1:2181761/1‑150 (MQ=255) cAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTa < 1:77219/150‑1 (MQ=255) aaaGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATgg > 1:29070/1‑150 (MQ=255) cAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCg > 1:863656/1‑150 (MQ=255) gCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAgg < 1:1940101/150‑1 (MQ=255) gCCTGAAGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATCTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACCCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCACAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCAGTATGGCCCGCAAgg > 2:162638/1‑150 (MQ=255) ccTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGc < 2:2203678/150‑1 (MQ=255) tgatgaATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAg > 2:1771217/1‑150 (MQ=255) gatgaATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAgc > 1:200106/1‑150 (MQ=255) atgaATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAgcg < 2:751129/150‑1 (MQ=255) atgaATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAgcg < 2:2352114/150‑1 (MQ=255) tgaATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAgcgc > 1:1072630/1‑150 (MQ=255) aaTTGAAGATTCAGCGGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAAGGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAACACCTTCAGCGTGCCGCCAGATCGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGcct < 2:793633/150‑2 (MQ=255) ttGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAAt < 1:18766/150‑1 (MQ=255) gAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGa > 1:1750345/1‑150 (MQ=255) gAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGa > 2:2221311/1‑150 (MQ=255) aaGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGaa < 2:1929418/150‑1 (MQ=255) cATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAATGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGTTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCAAATGAAGTTTTg < 2:2247554/150‑1 (MQ=255) cATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTg > 2:1772367/1‑150 (MQ=255) aTCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGc > 1:1501543/1‑150 (MQ=255) aTCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGc < 2:2387264/150‑1 (MQ=255) aTCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGc > 1:1492382/1‑150 (MQ=255) tCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCa > 2:833085/1‑150 (MQ=255) cTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAg > 1:178491/1‑150 (MQ=255) cTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAg < 2:689318/150‑1 (MQ=255) cTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAg < 2:2069854/150‑1 (MQ=255) ggTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAggg > 1:2455728/1‑150 (MQ=255) ggTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAggg > 2:2420398/1‑150 (MQ=255) tGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTa < 1:2201627/150‑1 (MQ=255) tGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGACAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTCTTGCAGGGCTa > 2:112229/1‑150 (MQ=255) atatGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATcg > 2:1536970/1‑150 (MQ=255) tgtgCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGa > 2:205775/1‑150 (MQ=255) gtgCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACTCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCAGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGaa > 2:454238/1‑150 (MQ=255) tgCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGaaa > 1:2109592/1‑150 (MQ=255) tgCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGaaa < 1:1865297/150‑1 (MQ=255) gCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAAt > 1:1558871/1‑150 (MQ=255) gCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAAt > 2:1725974/1‑150 (MQ=255) gCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAAt < 1:1612834/150‑1 (MQ=255) ccGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATg > 1:2032402/1‑150 (MQ=255) gATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATggg < 2:2116041/150‑1 (MQ=255) tGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCa < 1:139799/150‑1 (MQ=255) cgcgGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGa < 1:1149944/150‑1 (MQ=255) cgcgGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGa < 2:29070/150‑1 (MQ=255) cgcgGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGa < 1:2330472/150‑1 (MQ=255) cgGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATg < 1:1211952/150‑1 (MQ=255) ggAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTgg > 2:681692/1‑150 (MQ=255) ggAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTgg < 1:618473/150‑1 (MQ=255) gAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGc > 1:2153424/1‑150 (MQ=255) gATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAg > 2:216673/1‑150 (MQ=255) gATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAg < 1:947866/150‑1 (MQ=255) gATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAg < 2:1295549/150‑1 (MQ=255) gATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAg < 1:1772367/150‑1 (MQ=255) aTCAACATATGGTAGACGCGGTAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAgg < 1:406111/150‑1 (MQ=255) aTCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAgg < 1:684643/150‑1 (MQ=255) aTCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAgg < 1:1658929/150‑1 (MQ=255) tCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGa < 1:128154/150‑1 (MQ=255) aaCATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCAGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACa > 2:1050539/1‑150 (MQ=255) tatGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGAtt > 1:2280489/1‑150 (MQ=255) atGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGAttt > 2:10379/1‑150 (MQ=255) tGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTa > 2:672774/1‑150 (MQ=255) ggcggcaCGCTGAAGGTATTTCCTTCCGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTa > 2:2078990/7‑150 (MQ=255) ggTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTAc < 1:1775804/150‑1 (MQ=255) ggTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTAc > 1:1928654/1‑150 (MQ=255) ggTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTAc > 2:1210024/1‑150 (MQ=255) ggcaCGCTGAAGGTATTTCCTTCCGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCACCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTActc > 1:726728/4‑150 (MQ=255) aCGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTga < 2:2427905/150‑1 (MQ=255) gcgGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCTCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTgaag < 1:1679879/150‑1 (MQ=255) gcgGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTgaag < 1:2479616/150‑1 (MQ=255) ggaaATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAgcg < 2:1501543/150‑1 (MQ=255) ggaaATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAgcg < 2:1492382/150‑1 (MQ=255) acaCCTTCAGCGTGCCGCCAGATCGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCAGAAGGAAgcggccc < 2:1183025/148‑3 (MQ=255) aTACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGa < 1:1319649/150‑1 (MQ=255) aCCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATg < 1:205775/150‑1 (MQ=255) ccTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGa > 2:1875418/1‑150 (MQ=255) cGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACcgcgcg > 1:137586/1‑150 (MQ=255) gTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCgcgg < 1:1096225/150‑1 (MQ=255) gTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCgcgg < 2:1936482/150‑1 (MQ=255) gccgccAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCgcggcg < 2:863656/150‑1 (MQ=255) gccgccAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCgcggcg > 2:1661195/1‑150 (MQ=255) ccgccAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGt > 1:985235/1‑150 (MQ=255) attggaagCACCTGCTTGCTGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGTTcc > 1:73539/8‑150 (MQ=255) tggaagCACCTGCTTGCTGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGTTCCTg > 2:470647/6‑150 (MQ=255) ggaagCACCTGCTTGCTGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGTTCCTgg > 1:1619974/5‑150 (MQ=255) ggaagCACCTGCTTGCTGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGTTCCTgg > 2:1685534/5‑150 (MQ=255) gAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGCCCGCGCGGCGTTCCTgg > 2:1601555/1‑150 (MQ=255) gAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGTTCCTgg < 1:1725974/150‑1 (MQ=255) gaagCACCAGCTTGCTGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGGTCCTGGc > 2:344361/4‑150 (MQ=255) aaCGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGTTCCTGGc < 1:126279/150‑1 (MQ=255) cACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGTTCCTGGCAGtt > 2:1349848/1‑150 (MQ=255) agcaagcaGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGTTCCTGGCAGTTGACg < 1:287060/150‑1 (MQ=255) gcaagcaGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGTTCCTGGCAGTTGACGc > 1:1601145/1‑150 (MQ=255) gcaagcaGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGTTCCTGGCAGTTGACGc < 1:1536970/150‑1 (MQ=255) gcaagcaGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGTTCCTGGCAGTTGACGc < 2:40241/150‑1 (MQ=255) gcaagcaGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGTTCCTGGCAGTTGACGc < 1:910224/150‑1 (MQ=255) | GTGGATTAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGTTCCTGGCAGTTGACGCTG > NC_000913/103466‑103763 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |