Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 934,195 | T→A | 6.2% | A324A (GCT→GCA) | ftsK → | cell division DNA translocase FtsK |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 934,195 | 0 | T | A | 6.2% | 389.1 / 10.4 | 127 | A324A (GCT→GCA) | ftsK | cell division DNA translocase FtsK |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (50/69); new base A (5/3); total (55/72) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.91e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.56e-01 |
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
ACGAAGAGATTACCTACACTGCACGCGGTGTGGCTGCCGACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTACCGGGTCCACAAACGGGAGAGCCGGTTATTGC > NC_000913/934047‑934344 | aCGAAGAGATTACCTACACTGCACGCGGTGTGGCTGCCGACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAgctg > 2:1301471/1‑150 (MQ=255) cGAAGAGATTACCTACACTGCACGCGGTGTGGCTGCCGACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAgctgc > 2:1745373/1‑150 (MQ=255) cGAAGAGATTACCTACACTGCACGCGGTGTGGCTGCCGACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAgctgc > 1:1808809/1‑150 (MQ=255) cGAAGAGATT‑CCTACACTGCACGCGGTGTGGCTGCCGACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAgctgct > 1:968072/1‑150 (MQ=255) aaGAGATTACCTACACTGCACGCGGTGTGGCTGCCGACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAgctgctg > 2:1428377/1‑150 (MQ=255) gagaTTACCTACACTGCACGCGGTGTGGCTGCCGACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAgctgctgct < 2:1616379/150‑1 (MQ=255) agaTTACCTACACTGCACGCGGTGTGGCTGCCGACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTa > 1:1991700/1‑150 (MQ=255) aTTACCTACACTGCACGCGGTGTGGCTGCCGACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTAcc > 2:1819231/1‑150 (MQ=255) aTTACCTACACTGCACGCGGTGTGGCTGCCGACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTAcc < 1:1426028/150‑1 (MQ=255) ttACCTACACTGCACGCGGTGTGGCTGCCGACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCa > 1:2402796/1‑150 (MQ=255) tACCTACACTGCACTCGGTGTGGCTGCCGACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCAc < 2:1720513/150‑1 (MQ=255) tACCTACACTGCACGCGGTGTGGCTGCCGACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAACCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCAGCTGCTAcagc < 1:1013946/150‑4 (MQ=255) cTACACTGCACGCGGTGTGGCTGCCGACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGc < 2:1934411/150‑1 (MQ=255) cTACACTGCACGCGGTGTGGCTGCCGACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGc < 2:164305/150‑1 (MQ=255) tACACTGCACGCGGTGTGTCTGCCGACCCGGACGACGTCCTATTTTCTGGCATTCGTGAAACGCAGCCAGAATATGACGACTACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCATCTGCTGCTACAACGGCg < 2:1864902/150‑1 (MQ=255) tACACTGCACGCGGTGTGGCTGCCGACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCg < 1:1474874/150‑1 (MQ=255) acTGCACGCGGTGTGGCTGCCGACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGaca > 1:1192637/1‑150 (MQ=255) cTGCACGCGGTGTGGCTGCCGACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGacac > 1:1331431/1‑150 (MQ=255) 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aCCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTg < 1:114195/150‑1 (MQ=255) cccGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGc < 2:595430/123‑1 (MQ=255) ccGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGaa < 2:236857/150‑1 (MQ=255) cGGACGCCGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAAc > 1:227858/1‑150 (MQ=255) ggACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAAcc < 1:1958995/150‑1 (MQ=255) ggACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAAcc < 1:308027/150‑1 (MQ=255) cgacgTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCtgt < 1:1727213/150‑1 (MQ=255) gacgTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCtgtg < 2:620090/150‑1 (MQ=255) gacgTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCtgtg < 1:269393/150‑1 (MQ=255) cgTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGAc < 1:1730541/150‑1 (MQ=255) cgTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGAc < 1:653841/150‑1 (MQ=255) tCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTc < 1:1757556/150‑1 (MQ=255) tCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTc > 1:904847/1‑150 (MQ=255) cTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAg < 2:209138/150‑1 (MQ=255) ttttCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGAcg < 2:1864497/150‑1 (MQ=255) 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gcgcCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTa > 1:1487885/1‑150 (MQ=255) gcCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTAcc > 2:2275044/1‑150 (MQ=255) gcCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTAcc > 1:1796758/1‑150 (MQ=255) gcCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTAcc > 2:1628932/1‑150 (MQ=255) ccAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGTCTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTCGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTACCg < 2:1175585/150‑1 (MQ=255) aaTTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTACCggg < 1:53864/150‑1 (MQ=255) aaTTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGGTGAACCTGTGACTCAGCCGCCTCCTGTGGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGGTCCggg < 2:1077419/150‑1 (MQ=255) ttACCGAACCTGTTGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCACCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCAGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTACGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTACCggggc > 1:138957/1‑148 (MQ=255) ttACCGAACCTGTTGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCACCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCAGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTACGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTACCggggc > 1:130097/1‑148 (MQ=255) gctttgtGTCGCCGTGGTAGCAGCAGCTGCTACAGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTACCGGGTCcaca > 2:283217/7‑150 (MQ=38) cGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTACCGGGTCcaca < 1:1881453/150‑1 (MQ=255) cGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTACCGGGTCcaca < 1:1145241/150‑1 (MQ=255) tttgtGTCGCCGTGGTAGCAGCAGCTGCTACAGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTACCGGGTCCACaaa > 2:1792131/5‑150 (MQ=38) aCCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTACCGGGTCCACAAAc > 1:519655/1‑150 (MQ=255) tgtGTCGCCGTGGTAGCAGCAGCTGCTACAGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTACCGGGTCCACAAACg > 1:633192/3‑150 (MQ=38) tGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTACCGGGTCCACAAACggg > 2:1631272/1‑150 (MQ=255) cGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTACCGGGTCCACAAACGGgaga < 1:944882/150‑1 (MQ=255) tGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTACCGGGTCCACAAACGGGAGAGcc < 2:404452/150‑1 (MQ=255) gTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCGCTGTTGATGTTCCACCTGCGCACCCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTACCGGGTCCACAAACGGGAGAGCCg > 2:1694912/1‑150 (MQ=255) agcagcTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTACCGGGTCCACAAACGGGAGAGCCGGt < 1:1631272/150‑1 (MQ=255) gctgctgctACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTACCGGGTCCACAAACGGGAGAGCCGGTTAtt > 2:1346356/1‑150 (MQ=255) gctgctgctACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTACCGGGTCCACAAACGGGAGAGCCGGTTAtt < 2:1796758/150‑1 (MQ=255) | ACGAAGAGATTACCTACACTGCACGCGGTGTGGCTGCCGACCCGGACGACGTCCTATTTTCGGGCAATCGTGCAACGCAGCCAGAATATGACGAATACGATCCATTATTAAACGGTGCGCCAATTACCGAACCTGTCGCTGTAGCAGCTGCTGCTACCACGGCGACACAAAGCTGGGCTGCGCCGGTTGAACCTGTGACTCAGACGCCGCCTGTTGCCTCTGTTGATGTTCCACCTGCGCAACCTACAGTAGCCTGGCAGCCTGTACCGGGTCCACAAACGGGAGAGCCGGTTATTGC > NC_000913/934047‑934344 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |