Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 989,135 | G→A | 5.3% | intergenic (‑150/+19) | asnS ← / ← pncB | asparagine‑‑tRNA ligase/nicotinate phosphoribosyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 989,135 | 0 | G | A | 5.3% | 479.3 / 8.9 | 150 | intergenic (‑150/+19) | asnS/pncB | asparagine‑‑tRNA ligase/nicotinate phosphoribosyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (74/66); new base A (5/3); total (80/70) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.24e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.33e-01 |
Only 100 of 151 total aligned reads displayed.
TTCTCTCTGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGCTGTCAGAAAGTTTCGCCACCGGTTTACCGTTACACTCTACCA > NC_000913/988990‑989284 | ttCTCTCTGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTa < 1:724324/150‑1 (MQ=255) tctctcTGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAg < 2:2160216/150‑1 (MQ=255) ctctGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTc > 2:288878/1‑150 (MQ=255) tctGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACCCTTGTCCACCCGTAATTGGGGGGCTACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTcc > 2:1782932/1‑150 (MQ=255) tGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCt > 2:526879/1‑150 (MQ=255) tGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCt > 2:1975642/1‑150 (MQ=255) gTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCTAATCGGCTCCCtt < 1:476878/150‑2 (MQ=255) tAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCtgat < 2:976642/150‑1 (MQ=255) aaTAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGATACGTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCTAATCGGCTCCCttttt < 2:1187938/150‑5 (MQ=255) aTAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCtgatga > 2:1722563/1‑150 (MQ=255) tAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCTAATCGGCTCCCttttttt < 2:919789/150‑7 (MQ=255) cGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCACAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTa < 2:1212687/150‑1 (MQ=255) aaaaaTAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTg < 1:1006925/150‑1 (MQ=255) aaaaTAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCATAATTCGCAAATGGAGCGAAATATTTCGGAATTAAATGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTgg < 2:1125331/150‑1 (MQ=255) aaCACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCttttt < 1:1458823/150‑1 (MQ=255) cacTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTa < 1:1728910/150‑1 (MQ=255) cacTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTa > 2:447961/1‑150 (MQ=255) cacTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGATACCTATGTTACCTGGAATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGAGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAAGTGGCTTTTTTa > 2:1801137/1‑150 (MQ=255) acTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTaa > 1:236445/1‑150 (MQ=255) ttGTCCACCCGTAAATGGGGTGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAata < 1:1591838/150‑1 (MQ=255) ttGTCCACCCGTAAATGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAata < 1:1600272/150‑1 (MQ=255) ttGTCCACCCGTAAATGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAata < 2:148736/150‑1 (MQ=255) tGTCCACCCGTAAATGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAatat > 1:877691/1‑150 (MQ=255) tCCACCCGTAAATGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGCCAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGc > 1:1353351/1‑150 (MQ=255) cACCCGTAAATGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCgg > 1:821297/1‑150 (MQ=255) cACCCGTAAATGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCgg > 1:885642/1‑150 (MQ=255) aCCCGTAAATGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGa < 1:1881229/150‑1 (MQ=255) ccGTAAATGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAg > 2:912704/1‑150 (MQ=255) cGTAAATGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAgg < 2:2272703/150‑1 (MQ=255) cGTAAATGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAgg > 2:1423588/1‑150 (MQ=255) gTAAATGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGt > 2:1377429/1‑150 (MQ=255) tGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAAc > 2:782592/1‑150 (MQ=255) tGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAAc > 1:892953/1‑150 (MQ=255) gggggATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGc > 2:2452812/1‑150 (MQ=255) ggggATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCt > 1:1625609/1‑150 (MQ=255) gATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTg > 2:1974987/1‑150 (MQ=255) gATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTg < 2:890586/150‑1 (MQ=255) tACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTgcg > 1:1638957/1‑150 (MQ=255) gTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGcc < 1:2292271/150‑1 (MQ=255) cTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTAGCGCAGCGCCCGAAc > 1:764441/1‑150 (MQ=255) gCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGACGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACaaa < 2:1527095/150‑1 (MQ=255) cATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAAc > 1:497942/1‑150 (MQ=255) cATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAAc > 2:1989435/1‑150 (MQ=255) tCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGc > 2:2037108/1‑150 (MQ=255) tGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTGCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGACCGAACAAACGCtt > 2:1271439/1‑150 (MQ=255) tGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCtt < 1:1392726/150‑1 (MQ=255) gCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAg < 2:842681/132‑1 (MQ=255) cAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTa > 2:1923753/1‑150 (MQ=255) cAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTa > 1:506718/1‑150 (MQ=255) aTCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATc > 1:1968658/1‑150 (MQ=255) cAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCAt > 1:2456901/1‑150 (MQ=255) aGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGT‑AAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATgg > 1:2194861/1‑150 (MQ=255) cAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCa < 1:283387/150‑1 (MQ=255) aGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGa < 2:469376/150‑1 (MQ=255) aGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGa > 1:1411853/1‑150 (MQ=255) gCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGAt < 2:1257846/150‑1 (MQ=255) gCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGAt > 2:1854067/1‑150 (MQ=255) gAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGt > 2:1474007/1‑150 (MQ=255) tCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTg < 1:1291263/150‑1 (MQ=255) gCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTTATGCTATTAACTGTCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGcc > 2:1007139/1‑150 (MQ=255) gCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGcc < 1:782592/150‑1 (MQ=255) gCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGcc > 2:264504/1‑150 (MQ=255) gCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGcc > 1:311972/1‑150 (MQ=255) cAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCa > 1:1385732/1‑150 (MQ=255) aaaTGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAg < 1:1854067/150‑1 (MQ=255) aaTGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAgg > 2:1522398/1‑150 (MQ=255) tGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGc < 1:316084/150‑1 (MQ=255) tGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGc > 2:795194/1‑150 (MQ=255) tGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGc < 2:236445/150‑1 (MQ=255) tGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTAGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGc < 2:1322701/150‑1 (MQ=255) gCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAACTGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGCt < 2:215799/150‑1 (MQ=255) cAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGCTg > 2:1838392/1‑150 (MQ=255) cAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGCTg < 1:447961/150‑1 (MQ=255) gCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGCTGTc < 2:1625609/150‑1 (MQ=255) gCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGCTGTc > 1:1576599/1‑150 (MQ=255) cGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGCTGTCa < 2:1968658/150‑1 (MQ=255) aGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCGGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGCTGTCAGaaa > 2:659519/1‑150 (MQ=255) taTTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCTATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGCTGTCAGAAAg < 2:1052724/149‑1 (MQ=255) tCGGAATTAAAGGTAAAAAATGGGAGCCGATTAGCTCGCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGCAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACATACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGCTGTCAGAAAGTTTc < 1:1038770/150‑1 (MQ=255) tCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGCTGTCAGAAAGTTTc > 1:325032/1‑150 (MQ=255) tCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGCTGTCAGAAAGTTTc > 2:639469/1‑150 (MQ=255) cGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGCTGTCAGAAAGTTTCg < 1:577704/150‑1 (MQ=255) ttAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGCTGTCAGAAAGTTTCGCCAcc > 2:1324280/1‑150 (MQ=255) ggTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGCTGTCAGAAAGTTTCGCCACCGGttt < 1:1574646/150‑1 (MQ=255) ggTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGCTGTCAGAAAGTTTCGCCACCGGttt > 1:803815/1‑150 (MQ=255) aaaaaaGGGAGCCCAGTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGGTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACACCCGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGCTGTAAGAAAGTTTCGCCACCGGATTACCg > 2:568869/1‑150 (MQ=255) catcaGGGAGCTAATCGGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGCTGTCAGAAAGTTTCGCCACCGGTTTACCGt > 2:855065/5‑150 (MQ=255) aaaaaGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGCTGTCAGAAAGTTTCGCCACCGGTTTACCGt > 2:882936/1‑150 (MQ=255) aaaaaGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGCTGTCAGAAAGTTTCGCCACCGGTTTACCGt > 2:669034/1‑150 (MQ=255) tcaGGGAGCTAATCGGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGCTGTCAGAAAGTTTCGCCACCGGTTTACCGTTa > 1:2371575/3‑150 (MQ=255) tcaGGGAGCTAATCGGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGCTGTCAGAAAGTTTCGCCACCGGTTTACCGTTa > 1:2070373/3‑150 (MQ=255) tcaGGGAGCTAATCGGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGCTGTCAGAAAGTTTCGCCACCGGTTTACCGTTa > 2:511865/3‑150 (MQ=255) aaaGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGCTGTCAGAAAGTTTCGCCACCGGTTTACCGTTa < 2:323241/150‑1 (MQ=255) aaaGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGCTGTCAGAAAGTTTCGCCACCGGTTTACCGTTa < 2:311972/150‑1 (MQ=255) aaGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGCTGTCAGAAAGTTTCGCCACCGGTTTACCGTTac < 1:912704/150‑1 (MQ=255) gggAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGCTGTCAGAAAGTTTCGCCACCGGTTTACCGTTacac < 1:526879/150‑1 (MQ=255) gggAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGCTGTCAGAAAGTTTCGCCACCGGTTTACCGTTacac < 2:415615/150‑1 (MQ=255) ggAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGCTGTCAGAAAGTTTCGCCACCGGTTTACCGTTACAct > 1:731398/1‑150 (MQ=255) ccGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGCTGTCAGAAAGTTTCGCCACCGGTTTACCGTTACACTCTAc > 1:574124/1‑150 (MQ=255) gATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGCTGTCAGAAAGTTTCGCCACCGGTTTACCGTTACACTCTACCa > 1:230111/1‑150 (MQ=255) | TTCTCTCTGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGCTGTCAGAAAGTTTCGCCACCGGTTTACCGTTACACTCTACCA > NC_000913/988990‑989284 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |