| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 989,138 | 0 | T | C | 5.3% | 462.1 / 10.9 | 151 | intergenic (‑153/+16) | asnS/pncB | asparagine‑‑tRNA ligase/nicotinate phosphoribosyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (76/67); new base C (5/3); total (81/70) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.25e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
TTCTCTCTGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGCTGTCAGAAAGTTTCGCCACCGGTTTACCGTTACACTCTACCAACT > NC_000913/988990‑989287 | ttCTCTCTGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTa < 1:724324/150‑1 (MQ=255) tctGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACCCTTGTCCACCCGTAATTGGGGGGCTACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTcc > 2:1782932/1‑150 (MQ=255) tGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCt < 1:744033/150‑1 (MQ=255) 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aaaGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGCTGTCAGAAAGTTTCGCCACCGGTTTACCGTTa < 1:504785/150‑1 (MQ=255) aaaGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGCTGTCAGAAAGTTTCGCCACCGGTTTACCGTTa < 2:311972/150‑1 (MQ=255) aGGGAGCTAATCGGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGCTGTCAGAAAGTTTCGCCACCGGTTTACCGTTaca > 2:315061/1‑150 (MQ=255) gggAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGCTGTCAGAAAGTTTCGCCACCGGTTTACCGTTacac < 2:415615/150‑1 (MQ=255) ccGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGCTGTCAGAAAGTTTCGCCACCGGTTTACCGTTACACTCTAc > 1:574124/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |