Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 989,139 | 0 | A | G | 5.3% | 469.7 / 10.9 | 151 | intergenic (‑154/+15) | asnS/pncB | asparagine‑‑tRNA ligase/nicotinate phosphoribosyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (76/67); new base G (5/3); total (81/70) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.25e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.42e-01 |
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
TTCTCTCTGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGCTGTCAGAAAGTTTCGCCACCGGTTTACCGTTACACTCTACCAACTT > NC_000913/988990‑989288 | ttCTCTCTGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTa < 1:724324/150‑1 (MQ=255) ctctGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACACTTGTCCACCCGTAAATGGGGGGATACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTc > 2:288878/1‑150 (MQ=255) tctGTTAATAGTCGGAAAAAATAAACCCTTGTCCACCCGTAATTGGGGGGCTACCTATGTTACCTGGCATCTGCAATCAGACAAGCAGAATTCGCAAATGCAGCGAAAGATTTCGGAATTAAAGGTAAAAAAAGGGAGCCGATTAGCTcc > 2:1782932/1‑150 (MQ=255) 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aaaGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGCTGTCAGAAAGTTTCGCCACCGGTTTACCGTTa < 1:504785/150‑1 (MQ=255) aaaGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGCTGTCAGAAAGTTTCGCCACCGGTTTACCGTTa < 2:323241/150‑1 (MQ=255) aaGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGCTGTCAGAAAGTTTCGCCACCGGTTTACCGTTac < 1:912704/150‑1 (MQ=255) aaGGGAGCCGATTAGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGCTGTCAGAAAGTTTCGCCACCGGTTTACCGTTac < 1:1722563/150‑1 (MQ=255) aGGGAGCTAATCGGCTCCCTGATGATATTAACTGGCTTTTTTAATATGCGGAAGGTCGAACGCTTTGCGCAGCGCCCGAACAAACGCTTTATCATGGCAGATAGTTTTGCCAGGGCTGTCAGAAAGTTTCGCCACCGGTTTACCGTTaca > 2:315061/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |