| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,167,423 | T→A | 5.2% | intergenic (+34/‑176) | ndh → / → ycfJ | NADH:quinone oxidoreductase II/PF05433 family protein YcfJ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,167,423 | 0 | T | A | 5.2% | 557.8 / 12.9 | 171 | intergenic (+34/‑176) | ndh/ycfJ | NADH:quinone oxidoreductase II/PF05433 family protein YcfJ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (79/83); new base A (3/6); total (82/89) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.29e-01 | |||||||||||
Only 100 of 174 total aligned reads displayed.
ATATCTCGCTATACCGAATGCATCAGATTGCGCTGCATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGCATGATTGGC > NC_000913/1167274‑1167572 | tatCTCGCTATACCGAATGCATCAGATTGCGCTGCATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCTACGTAAACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCta > 1:219091/1‑149 (MQ=255) tatCTCGCTATACCGAATGCATCAGATTGCGCTGCATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTc > 1:1017776/1‑150 (MQ=255) tatCTCGCTATACCGAATGCATCAGATTGCGCTGCATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTc > 2:2273429/1‑150 (MQ=255) tatCTCGCTATACCGAATGCATCAGATTGCGCTGCATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTc > 2:1853265/1‑150 (MQ=255) tatCTCGCTATACCGAATGCATCAGATTGCGCTGCATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTc > 1:1825754/1‑150 (MQ=255) tctcGCTATACCGAATGCATCAGATTGCGCTGCATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCAt > 1:2237646/1‑150 (MQ=255) tctcGCTATACCGAATGCATCAGATTGCGCTGCATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCAt > 2:1897101/1‑150 (MQ=255) ctcGCTATACCGAATGCATCAGATTGCGCTGCATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATc < 1:2360194/150‑1 (MQ=255) tcccTATACCGAATGCATCAGATAGCGCTGCATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGAGGCGTTTATGCCACATcc < 2:2090533/147‑1 (MQ=255) cGCTATACCGAATGCATCAGATTGCGCTGCATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCg > 1:1601137/1‑150 (MQ=255) gCTATACCGAATGCATCAGATTGCGCTGCATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGc < 1:2135067/150‑1 (MQ=255) gCTATACCGAATGCATCAGATTGCGCTGCATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGAGGCGTTTATGCCACATCCGc < 1:1552810/150‑1 (MQ=255) gCTATACCGAATGCATCAGATTGCGCTGCATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATACTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGAGGCGTTTATGCCACATCCGc < 1:970557/150‑1 (MQ=255) tataCCGAATGCATCAGATTGCGCTGCATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGccc > 1:1215709/1‑150 (MQ=255) taCCGAATGCATCAGATTGCGCTGCATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCtt > 1:948618/1‑150 (MQ=255) aCCGAATGCATCAGATTGCGCTGCATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTg > 1:264896/1‑150 (MQ=255) aCCGAATGCATCAGATTGCGCTGCATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTg < 1:1725032/150‑1 (MQ=255) cGAATGCATCAGATTGCGGTGCATGGTTACTTTAAAACCGTATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGTCGTAGACTGGCGTTTGTGGAATAAACGGCTCATCCGGCCTTTAg < 2:2142055/150‑1 (MQ=255) cGAATGCATCAGATTGCGCTGCATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAg < 2:1720492/150‑1 (MQ=255) cGAATGCATCAGATTGCGCTGCATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAg < 2:699898/150‑1 (MQ=255) cGAATGCATCAGATTGCGCTGCATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAg < 2:2281721/150‑1 (MQ=255) gAATGCATCAGATTGCGCTGCATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAgg < 1:905264/150‑1 (MQ=255) tGCATCAGATTGCGCTGCATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAAc < 2:1375210/150‑1 (MQ=255) gCATCAGATTGCGCTGCATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACa > 1:1596383/1‑150 (MQ=255) cATCAGATTGCGCTGCATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAg > 2:1991651/1‑150 (MQ=255) cATCAGATTGCGCTGCATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAg > 2:2152132/1‑150 (MQ=255) cATCAGATTGCGATACATGGTTACTTTAAAACCGTATTAATGATGCTCGTGGAGAGTATTAAACGCGTTATCCGTACTCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAg > 2:944247/1‑150 (MQ=255) aTCAGATTGCGCTGCATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAgc > 2:410569/1‑150 (MQ=255) cAGATTGCGCTGCATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAgcgc < 2:1255306/150‑1 (MQ=255) aGATTGCGCTGCATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGcgcg > 2:147175/1‑150 (MQ=255) aGATTGCGCTGCATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGcgcg > 2:1798177/1‑150 (MQ=255) aGATTGCGCTGCATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGcgcg > 1:1466388/1‑150 (MQ=255) gATTGCGCTGCATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGa > 2:1149346/1‑150 (MQ=255) gcgcTGCATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCgg < 1:1324704/150‑1 (MQ=255) gcTGCATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCa > 1:1492676/1‑150 (MQ=255) ttACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTg < 1:1217923/150‑1 (MQ=255) ttACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTg < 2:2191174/150‑1 (MQ=255) ttACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTg < 2:916685/150‑1 (MQ=255) cTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACCGCGCGCTCGGCAGCCGCGTTGTAt > 2:2365910/1‑150 (MQ=255) cTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTAt > 1:1523778/1‑150 (MQ=255) aaaCCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGc > 1:1848704/1‑150 (MQ=255) aaaCCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGc < 2:783436/150‑1 (MQ=255) aaaCCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGc < 2:1861587/150‑1 (MQ=255) ccGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATc > 2:1590735/1‑150 (MQ=255) cGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATcc > 1:1868918/1‑150 (MQ=255) gATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCtt > 1:293362/1‑150 (MQ=255) ttAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATAGAAGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATACGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCttta > 2:206129/1‑149 (MQ=255) aaTGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAg < 2:279171/150‑1 (MQ=255) aaTGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAg > 1:1950053/1‑150 (MQ=255) atgatgCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGa < 2:1691990/150‑1 (MQ=255) atgatgCGGGTGGGGAGGATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGa < 2:834751/150‑1 (MQ=255) tgatgCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGGAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGAc > 1:960768/1‑150 (MQ=255) tgatgCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGAc > 1:445442/1‑150 (MQ=255) gatgCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGAct < 2:749605/150‑1 (MQ=255) tgCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGActcc > 2:1508012/1‑150 (MQ=255) tgCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGActcc < 1:6977/150‑1 (MQ=255) gCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGActcct < 2:1466388/150‑1 (MQ=255) cTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGActcctc > 2:1770678/1‑150 (MQ=255) gTATTAACCGCGTTATCCGTCCTCGTTTTAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTa < 2:2248824/150‑1 (MQ=255) gTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCcgcg > 2:481151/1‑112 (MQ=255) gTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCcgcg < 1:481151/112‑1 (MQ=255) aTTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAg < 2:328083/150‑1 (MQ=255) ttAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGt < 2:1017776/150‑1 (MQ=255) cgTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGCCGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCAGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTccc > 2:1570182/1‑149 (MQ=255) ttATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGc < 1:2466927/150‑1 (MQ=255) tATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGcc > 2:729338/1‑150 (MQ=255) tccgCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTccc < 1:1895037/150‑1 (MQ=255) ccgCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCcg < 1:788159/150‑1 (MQ=255) cgcgTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCcgc > 1:1228337/1‑150 (MQ=255) tGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCtttt > 2:16270/1‑150 (MQ=255) gAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTc < 2:42156/150‑1 (MQ=255) gTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCAtc < 1:1121543/150‑1 (MQ=255) tAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTtctgtc < 2:60153/150‑1 (MQ=255) cGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGAt > 1:1811551/1‑150 (MQ=255) aCGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAg < 1:87787/150‑1 (MQ=255) cGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAgc < 2:1330760/150‑1 (MQ=255) gTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAgct < 1:2152132/150‑1 (MQ=255) cctcaagggCGGATGAGGCGTTTATGCCACATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAgct > 2:2089152/8‑150 (MQ=38) acacTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAgctgc > 2:2007860/1‑150 (MQ=255) cacTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAgctgct > 2:1063002/1‑150 (MQ=255) cTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCttt > 2:974081/1‑150 (MQ=255) agggCGGATGAGGCGTTTATGCCACATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCttt > 1:849311/3‑150 (MQ=255) ggCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTtc < 2:881282/150‑1 (MQ=255) ggCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTtc > 1:242771/1‑150 (MQ=255) gCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTtct < 2:1969634/150‑1 (MQ=255) gCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTtct < 1:1935404/150‑1 (MQ=255) gCGGATGAGGCGTTTATGCCACATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTtct > 1:229516/1‑150 (MQ=255) ggATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTcc < 1:1063002/150‑1 (MQ=255) gtgGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCg > 2:1554667/1‑150 (MQ=255) tgGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGc < 2:264896/150‑1 (MQ=255) tgGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGc < 1:1693331/150‑1 (MQ=255) gCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCtt < 1:390411/150‑1 (MQ=255) tAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCGTTTCTCCTTCGCTGGCa > 2:1644810/1‑150 (MQ=255) aaaCGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGCAt < 2:1848704/150‑1 (MQ=255) aaaCGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTACAt < 1:756421/150‑1 (MQ=255) aaCGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGCATg > 2:2128178/1‑150 (MQ=255) gCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGCATGAtt > 1:442473/1‑150 (MQ=255) cTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGCATGATTgg < 2:1215709/150‑1 (MQ=255) cTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGCATGATTgg < 2:2464404/150‑1 (MQ=255) tCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGCATGATTGGc < 1:1794650/150‑1 (MQ=255) | ATATCTCGCTATACCGAATGCATCAGATTGCGCTGCATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGCATGATTGGC > NC_000913/1167274‑1167572 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |