| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 121,004 | T→C | 5.5% | Q183R (CAG→CGG) | aroP ← | aromatic amino acid:H(+) symporter AroP |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 121,004 | 0 | T | C | 5.5% | 502.6 / 12.2 | 161 | Q183R (CAG→CGG) | aroP | aromatic amino acid:H(+) symporter AroP |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (79/73); new base C (6/3); total (85/76) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.02e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
CTTTGCTCCGGGTTATCAGCTTCTGCTGCGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACGAGAACATGATAATCGCCATCATCATCACCAGCCCGGTGAAGCCGTGCGGCAGGAAACCACCCTGATCCCACAGGTTGCTAACGGTCGCCTGCGGGCCGCCGTTGCCACTGAATAGCAGCCAGCCGCCGAAGATGATCATCGCTACCACCGCGATAACTTTGATAATGGCAAACCAGAACTCCATCTCGCCAAACACTTTAACGTTGGTCAGGTTGATGGCGTTAATCACCACAAAGAAT > NC_000913/120854‑121153 | cTTTGCTCCGGGTTATCAGCTTCTGCTGCGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACGAGAACATGATAATCGCCATCATCATCACCAGCCCGGTGAAGCCGTGCGGCAGGAAACCA‑CCTGATCCCACAGGTTGCTAACGGTCGCCt > 1:921141/1‑150 (MQ=255) gCTCCGGGTTATCAGCTTCTGCTGCGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACGAGAACATGATAATCGCCATCATCATCACCAGCCCGGTGAAGCCGTGCGGCAGGAAACCACCCTGATCCCACAGGTTGCTAACGGTCGCCTGCg > 1:1145828/1‑150 (MQ=255) cTCCGGGTTATCAGCTTCTGCTGCGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACGAGAACATGATAATCGCCATCATCATCACCAGCCCGGTGAAGCCGTGCGGCAGGAAACCACCCTGATCCCACAGGTTGCTAACGGTCGCCTGCgg < 1:2243075/150‑1 (MQ=255) cTCCGGGTTATCAGCTTCTGCTGCGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACGAGAACATGATAATCGCCATCATCATCACCAGCCCGGTGAAGCCGTGCGGCAGGAAACCACCCTGATCCCACAGGTTGCTAACGGTCGCCTGCgg > 1:1287419/1‑150 (MQ=255) tCCGGGTTATCAGCTTCTGCTGCGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACGAGAACATGATAATCGCCATCATCATCACCAGCCCGGTGACGCCGTGCGGCAGGAAACCACCCTGATCCCACAGGTTGCTAACGGTCGCCTGCggg > 1:696001/1‑150 (MQ=255) ccGGGTTATCAGCTTCTGCTGCGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACGAGAACATGATAATCGCCATCATCATCACCAGCCCGGTGAAGCCGTGCGGCAGGAAACCACCCTGATCCCACAGGTTGCTAACGGTCGCCTGCGGgc > 2:65264/1‑150 (MQ=255) gTTATCAGCTTCTGCTGCGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACGAGAACATGATAATCGCCATCATCATCACCAGCCCGGTGAAGCCGTGCGGCAGGAAACCACCCTGATCCCACAGGTTGCTAACGGTCGCCTGCGGgccgcc < 1:937177/150‑1 (MQ=255) aTCAGCTTCTGCTGCGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGCACGAGAACATGATAATCGCCATCCTCATCACCAGCCCGGTGAAGCCGTGCGGCAGGAAACCACCCTGATCCCACAGGTTGCTAACGGTCGCCTGCGGGCCGCCGtg > 1:1749094/1‑149 (MQ=255) aTCAGCTTCTGCTGCGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACGAGAACATGATAATCGCCATCATCATCACCAGCCCGGTGAAGCCGTGCGGCAGGAAACCACCCTGATCCCACAGGTTGCTAACGGTCGCCTGCGGGCCGCCGtt > 1:2107326/1‑150 (MQ=255) tCAGCTTCTGCTGCGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACGAGAACATGATAATCGCCATCATCATCACCAGCCCGGTGAAGCCGTGCGGCAGGAAACCACCCTGATCCCACAGGTTGCTAACGGTCGCCTGCGGGCCGCCGTTg > 2:1626266/1‑150 (MQ=255) cAGCTTCTGCTGCGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACGAGAACATGATAATCGCCATCATCATCACCAGCCCGGTGAAGCCGTGCGGCAGGAAACCACCCTGATCCCACAGGTTGCTAACGGTCGCCTGCGGGCCGCCGTTGc < 1:981624/150‑1 (MQ=255) aGCTTCTGCTGCGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACGAGAACATGATAATCGCCATCATCATCACCAGCCCGGTGAAGCCGTGCGGCAGGAAACCACCCTGATCCCACAGGTTGCTAACGGTCGCCTGCGGGCCGCCGTTGcc < 2:2221932/150‑1 (MQ=255) aGCTTCTGCTGCGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACGAGAACATGATAATCGCCATCATCATCACCAGCCCGGTGAAGCCGTGCGGCAGGAAACCACCCTGATCCCACAGGTTGCTAACGGCGGCCCGCAGGCGACCGttagc < 2:2261328/150‑4 (MQ=255) gCTTCTGCTGCGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACGAGAACATGATAATCGCCATCATCATCACCAGCCCGGTGAAGCCGTGCGGCAGGAAACCCCCCTGATCCCACAGGTTGCTAACGGTCGCCTGCGGGCCGCCGTTGCCa > 2:2221419/1‑150 (MQ=255) cTTCTGCTGCGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACGAGAACATGATAATCGCCATCATCATCACCAGCCCGGTGAAGCCGTGCGGCAGGAAACCACCCTGATCCCACAGGTTGCTAACGGTCGCCTGCGGGCCGCCGTTGCCAc > 2:8582/1‑150 (MQ=255) tgctgcGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACGAGAACATGATAATCGCCATCATCATCACCAGCCCGGTGAAGCCGTGCGGCAGGAAACCACCCTGATCCCACAGGTTGCTAACGGTCGCCTGCGGGCCGCCGTTGCCAc < 2:1558855/146‑1 (MQ=255) tgctgcGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACGAGAACATGATAATCGCCATCATCATCACCAGCCCGGTGAAGCCGTGCGGCAGGAAACCACCCTGATCCCACAGGTTGCTAACGGTCGCCTGCGGGCCGCCGTTGCCAc > 1:1558855/1‑146 (MQ=255) tgctgcGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACGAGAACATGATAATCGCCATCATCATCACCAGCCCGGTGAAGCCGTGCGGCAGGAAACCACCCTGATCCCACAGGTTGCTAACGGTCGCCTGCGGGCCGCCGTTGCCACTGaa < 2:1194450/150‑1 (MQ=255) 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tAACGGTCGCCTGCGGGCCGCCGTTGCCACTGAATAGCAGCCAGCCGCCGAAGATGATCATCGCTACCACCGCGATAACTTTGATAATGGCAAACCAGAACTCCATCTCGCCAAACACTTTAACGTTGGTCAGGTTGATGGCGTTAATca > 1:1484636/1‑150 (MQ=255) aaCGGTCGCCTGCGGGCCGCCGTTGCCACTGAATAGCAGCCAGCCGCCGAAGATGATCATCGCTACCACCGCGATAACTTTGATAATGGCAAACCAGAACTCCATCTCGCCAAACACTTTAACGTTGGTCAGGTTGATGGCGTTAATcac > 1:2104645/1‑150 (MQ=255) aaCGGCGGCCCGCAGGCGACCGTTGCCACTGAATAGCAGCCAGCCGCCGAAGATGATCATCGCTACCACCGCGATAACTTTGATAATGGCAAACCAGAACTCCATCTCGCCAAACACTTTAACGTTGGTCAGGTTGATGGCGTTAATcac > 1:1445443/1‑150 (MQ=255) aaCGGCGGCCCGCAGGCGACCGTTGCCACTGAATAGCAGCCAGCCGCCGAAGATGATCATCGCTACCACCGCGATAACTTTGATAATGGCAAACCAGAACTCCATCTCGCCAAACACTTTAACGTTGGTCAGGTTGATGGCGTTAATcac > 1:1455153/1‑150 (MQ=255) aCGGTCGCCTGCGGGCCGCCGTTGCCACTGAATAGCAGCCAGCCGCCGAAGATGATCATCGCTACCACCGCGATAACTTTGATAATGGCAAACCAGAACTCCATCTCGCCAAACACTTTAACGTTGGTCAGGTTGATGGCGTTAATcacc < 1:150235/150‑1 (MQ=255) 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tGCGGGCCGCCGTTGCCACTGAATAGCAGCCAGCCGCCGAAGATGATCATCGCTACCACCGCGATAACTTTGATAATGGCAAACCAGAACTCCATCTCGCCAAACACTTTAACGTTGGTCAGGTTGATGGCGTTAATCACCACAAAGAAt > 1:1370049/1‑150 (MQ=255) tGCGGGCCGCCGTTGCCACTGAATAGCAGCCAGCCGCCGAAGATGATCATCGCTACCACCGCGATAACTTTGATAATGGCAAACCAGAACTCCATCTCGCCAAACACTTTAACGTTGGTCAGGTTGATGGCGTTAATCACCACAAAGAAt < 2:1262038/150‑1 (MQ=255) | CTTTGCTCCGGGTTATCAGCTTCTGCTGCGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACGAGAACATGATAATCGCCATCATCATCACCAGCCCGGTGAAGCCGTGCGGCAGGAAACCACCCTGATCCCACAGGTTGCTAACGGTCGCCTGCGGGCCGCCGTTGCCACTGAATAGCAGCCAGCCGCCGAAGATGATCATCGCTACCACCGCGATAACTTTGATAATGGCAAACCAGAACTCCATCTCGCCAAACACTTTAACGTTGGTCAGGTTGATGGCGTTAATCACCACAAAGAAT > NC_000913/120854‑121153 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |