Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,194,653 | T→C | 8.1% | Q100R (CAG→CGG) | rluE ← | 23S rRNA pseudouridine(2457) synthase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,194,653 | 0 | T | C | 8.1% | 456.0 / 23.4 | 160 | Q100R (CAG→CGG) | rluE | 23S rRNA pseudouridine(2457) synthase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (69/78); new base C (5/8); total (74/86) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.73e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.20e-01 |
Only 100 of 160 total aligned reads displayed.
CCACGCGGGTTCGTCAACCAGCTCCGCGCCGGCGGGCAGGGTAGGGCCATCATTTAAGGTTACGCCATTGCGCAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCATAAACACCCTGAACCGGGATGAATTCTTTTAATGTTTTGCGTCCGGCTTCATCGGTGAACTGCGGAAG > NC_000913/1194505‑1194801 | ccACGCGGGTTCGTCAACCAGCTCCGCGCCGGCGGGCAGGGTAGGGCCATCATTTAAGGTTACGCCATTGCGCAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTg > 2:1786954/1‑150 (MQ=255) cACGCGGGTTCGTCAACCAGCTCCGCGCCGGCGGGCAGGGTAGGGCCATCATTTAAGGTTACGCCATTGCGCAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCCCCTGCACAAAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTgg > 2:2204064/1‑150 (MQ=255) cACGCGGGTTCGTCAACCAGCTCCGCGCCGGCGGGCAGGGTAGGGCCATCATTTAAGGTTACGCCATTGCGCAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTgg > 2:2195189/1‑150 (MQ=255) aCGCGGGTTCGTCTACCAGCTCCGCGCCGGCGGGCAGGGTAGGGCCATCATTTAAGGTTACGCCATTGCGCAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTggg < 1:2425625/150‑1 (MQ=255) aCGCGGGTTCGTCAACCAGCTCCGCGCCGGCGGGCAGGGTAGGGCCATCATTTAAGGTTACGCCATTGCGCAAGGCTTCAAGTGCGCCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTggg < 1:1220770/150‑1 (MQ=255) cgcgGGTTCGTCAACCAGCTCCGCGCCGGCGGGCAGGGTAGGGCCATCATTTAAGGTTACGCCATTGCGCAAGGCTGCTAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGt < 1:1178337/150‑1 (MQ=255) ggTTCGTCCACCAGCTCCGCGCCGGCGGGCAGGGTAGGGCCATCATTTAAGGGTACGCCATTGCGCAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTTGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTaaa < 1:1031929/150‑1 (MQ=255) gTTCGTCAACCAGCTCCGCGCCGGCGGGCAGGGTAGGGCCATCATTTAAGGTTACGCCATTGCGCAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAAc < 2:528050/150‑1 (MQ=255) tCGTCAACCAGCTCCGCGCCGGCGGGCAGGGTAGGGCCATCATTTAAGGTTACGCCATTGCGCAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAAcgc < 1:2315737/150‑1 (MQ=255) cGTCAACCAGCTCCGCGCCGGCGGGCAGGGTAGGGCCATCATTTAAGGTTACGCCATTGCGCAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAAcgcg > 1:1675951/1‑150 (MQ=255) gTCAACCAGCTCCGCGCCGGCGGGCAGGGTAGGGCCATCATTTAAGGTTACGCCATTGCGCAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTTAACCCAGCCGGG‑TAAAcgcac < 1:512077/150‑3 (MQ=255) gTCAACCAGCTCCGCGCCGGCGGGCAGGGTAGGGCCATCATTTAAGGTTACGCCATTGCGCAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACtcgc < 2:376999/150‑1 (MQ=255) gTCAACCACCTCCGCGCCGGCGGGCAGGGTAGGGCCATCATTTAAGGTTACGCCATTGCGCAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTCCGTTT‑AACACGCTGGGTTAAACtcgc > 2:1901433/1‑150 (MQ=255) tCAACCAGCTCCGCGCCGGCGGGCAGGGTAGGGCCATCATTTAAGGTTACGCCATTGCGCAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGcc < 2:155109/150‑1 (MQ=255) cAACCAGCTCCGCGCCGGCGGGCAGGGTAGGGCCATCATTTAAGGTTACGCCATTGCGCAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTTAACCCAGCCGGG‑TAAACGCAccg < 1:2280808/150‑2 (MQ=255) cAACCAGCTCCGCGCCGGCGGGCAGGGTAGGGCCATCATTTAAGGTTACGCCATTGCGCAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTTAACCCAGCCGGG‑TAAACGCAccg < 1:1502402/150‑2 (MQ=255) cAACCAGCTCCGCGCCGGCGGGCAGGGTAGGGCCATCATTTAAGGTTACGCCATTGCGCAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTTAACCCAGCCGGG‑TAAACGCAccg < 2:2343603/150‑2 (MQ=255) ccAGCTCCGCGCCGGCGGGCAGGGTAGGGCCATCATTTAAGGTTACGCCATTGCGCAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCa < 2:1064165/150‑1 (MQ=255) aGCTCCGCGCCGGCGGGCAGGGTAGGGCCATCATTTAAGGTTACGCCATTGCGCAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAAc < 2:114827/150‑1 (MQ=255) gCTCCGCGCCGGCGGGCAGGGTAGGGCCATCATTTAAGGTTACGCCATTGCGCAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAAcg > 2:862170/1‑150 (MQ=255) gCTCCGCGCCGGCGGGCAGGGTAGGGCCATCATTTAAGGTTACGCCATTGCGCAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑AAACGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAAcg > 2:2243452/1‑150 (MQ=255) gCTCCGCGCCGGCGGGCAGGGTAGGGCCATCATTTAAGGTTACGCCATAGCGCAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAAcg < 2:261634/150‑1 (MQ=255) ccGCGCCGGCGGGCAGGGTAGGGCCATCATTTAAGGTTACGCCATTGCGCAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACgcgc > 1:225843/1‑150 (MQ=255) gcCGGCGGGCAGGGTAGGGCCATCATTTAAGGTTACGCCATTGCGCAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGtt < 2:2139081/150‑1 (MQ=255) ggcggGCAGGGTAGGGCCATCATTTAAGGTTACGCCATTGCGCAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTAtt < 1:703350/150‑1 (MQ=255) cggGCAGGGTAGGGCCATCATTTAAGGTTACGCCATTGCGCAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTgg > 2:1150935/1‑150 (MQ=255) cggGCAGGGTAGGGCCATCATTTAAGGTTACGCCATTGCGCAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTgg < 2:756374/150‑1 (MQ=255) ggCAGGGTAGGGCCATCATTTAAGGTTACGCCATTGCGCAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTc > 2:942727/1‑150 (MQ=255) cAGGGTAGGGCCATCATTTAAGGTTACGCCATTGCGCAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAg > 2:1865705/1‑150 (MQ=255) tAGGGCCATCATTTAAGGTTACGCCATTGCGCAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCa > 1:636822/1‑150 (MQ=255) aGGGCCATCAGTTAAGGTTACGCCATTGCGCAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAg < 1:926994/150‑1 (MQ=255) ggCCATCATTTAAGGTTACGCCATTGCGCAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCa > 1:2490140/1‑150 (MQ=255) ccATCATTTAAGGTTACGCCATTGCGCAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAAc > 1:1751/1‑150 (MQ=255) catTTAAGGTTACGCCATTGCGCAATGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCtt > 2:1700101/1‑150 (MQ=255) ttAAGGTTACGCCATTGCGCAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGc < 2:1491733/150‑1 (MQ=255) ttAAGGTTACGCCATTGCGCAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGc < 2:420302/150‑1 (MQ=255) tAAGGTTACGCCATTGCGCAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCt > 2:1887340/1‑150 (MQ=255) tACGCCATTGCGCAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATcgcg > 2:168005/1‑150 (MQ=255) cGCCATTGCGCAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGt > 2:204005/1‑150 (MQ=255) gCCATTGCGCAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTc < 1:201263/150‑1 (MQ=255) ccATTGCGCAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCa > 2:1290623/1‑150 (MQ=255) ccATTGCGCAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCa > 1:2165999/1‑150 (MQ=255) ttGCGCAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAgg < 2:2430221/150‑1 (MQ=255) gcgcAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGAACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCg > 2:2180617/1‑150 (MQ=255) gcgcAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGAAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATAGCGGTCAAGGCg > 2:1102906/1‑150 (MQ=255) cgcAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGa > 2:1553869/1‑150 (MQ=255) gcAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGAc < 2:1473221/150‑1 (MQ=255) cAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGAcc > 1:2052376/1‑150 (MQ=255) ggCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACctgc < 2:59897/150‑1 (MQ=255) ggCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACctgc < 1:139010/150‑1 (MQ=255) cTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACctgctg < 1:1990329/150‑1 (MQ=255) cTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACctgctg < 2:246632/150‑1 (MQ=255) ttCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCtgctgc < 2:5690/150‑1 (MQ=255) cAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCAt > 1:489587/1‑150 (MQ=255) aGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCATaa > 1:2070393/1‑150 (MQ=255) aGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCATaa > 2:240106/1‑150 (MQ=255) aGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCATaa < 1:129044/150‑1 (MQ=255) aGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCATaa < 2:431384/150‑1 (MQ=255) aGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCATaa > 2:862031/1‑150 (MQ=255) gCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCATAAaca > 1:1168694/1‑150 (MQ=255) tCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCATAAACAccc > 1:1248388/1‑150 (MQ=255) tCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCATAAACAccc < 1:1150935/150‑1 (MQ=255) gtgGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCATAAACACCCTGAAcc > 2:2116289/1‑150 (MQ=255) gAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCATAAACACCCTGAACCGGGa < 1:942727/150‑1 (MQ=255) aaTACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCATAAACACCCTGAACCGGGAt > 1:1912038/1‑150 (MQ=255) aTACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCATCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACGTGCTGCATAAACACCCTGAACCGGGATg < 2:1509531/150‑1 (MQ=255) aTACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCATAAACACCCTGAACCGGGATg < 2:1406223/150‑1 (MQ=255) cTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCATAAACACCCTGAACCGGGATGAAtt > 2:197184/1‑150 (MQ=255) tCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCATAAACACCCTGAACCGGGATGAATTCt > 1:1701965/1‑150 (MQ=255) cACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCATAAACACCCTGAACCGGGATGAATTCttt > 2:1946894/1‑150 (MQ=255) aCCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCATAAACACCCTGAACCGGGATGAATTCtttt < 1:2234020/150‑1 (MQ=255) ccTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCATAAACACCCTGAACCGGGATGAATTCTTTTa < 2:2052376/150‑1 (MQ=255) ccTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCATAAACACCCTGAACCGGGATGAATTCTTTTa > 1:242379/1‑150 (MQ=255) cTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCATAAACACCCTGAACCGGGATGAATTCTTTTaa > 1:226873/1‑150 (MQ=255) tGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCATAAACACCCTGAACCGGGATGAATTCTTTTAAt > 1:1686163/1‑150 (MQ=255) caTAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCATAAACACCCTGAACCGGGATGAATTCTTTTAATGttt < 1:2157009/150‑1 (MQ=255) ataataGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCATAAACACCCTGAACCGGGATGAATTCTTTTAATGtttt > 1:1815438/1‑150 (MQ=255) taataGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCATAAACACCCTGAACCGGGATGAATTCTTTTAATGTTTTg < 2:1248388/150‑1 (MQ=255) taataGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCATAAACACCCTGAACCGGGATGAATTCTTTTAATGTTTTg < 2:1751/150‑1 (MQ=255) aataGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCATAAACACCCTGAACCGGGATGAATTCTTTTAATGTTTTGc < 2:2396306/150‑1 (MQ=255) ataGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCATAAACACCCTGAACCGGGATGAATTCTTTTAATGTTTTGCg < 1:2488050/150‑1 (MQ=255) taGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCATAAACACCCTGAACCGGGATGAATTCTTTTAATGTTTTGCGt < 1:166688/150‑1 (MQ=255) aGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCATAAACACCCTGAACCGGGATGAATTCTTTTAATGTTTTGCGTc > 2:843594/1‑150 (MQ=255) aGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCATAAACACCCTGAACCGGGATGAATTCTTTTAATGTTTTGCGTc > 1:338086/1‑150 (MQ=255) gATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGATCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCATAAACACCCTGAACCGGGATGAATTCTTTTAATGTTTTGCGTcc > 2:2206208/1‑150 (MQ=255) ccGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCATAAACACCCTGAACCGGGATGAATTCTTTTAATGTTTTGCGTCCGGCTTCa > 1:564648/1‑150 (MQ=255) ccGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCATAAACACCCTGAACCGGGATGAATTCTTTTAATGTTTTGCGTCCGGCTTCa > 1:1511147/1‑150 (MQ=255) ccGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCATAAACACCCTGAACCGGGATGAATTCTTTTAATGTTTTGCGTCCGGCTTCa > 1:1254215/1‑150 (MQ=255) gttGCGTTT‑AACCGGCTGTGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAAGCCTTCGCTATCGCGGTCAAGTCGACCTGCTGCTTAAACACCCTGAACCGGGATGAATTCTTTTAATGTTTTGCGTCCGGCTTCATc < 2:80423/148‑1 (MQ=255) gTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCATAAACACCCTGAACCGGGATGAATTCTTTTAATGTTTTGCGTCCGGCTTCATcc < 2:207666/150‑2 (MQ=255) gTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCATAAACACCCTGAACCGGGATGAATTCTTTTAATGTTTTGCGTCCGGCTTCATCg > 1:606477/1‑150 (MQ=255) tGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCATAAACACCCTGAACCGGGATGAATTCTTTTAATGTTTTGCGTCCGGCTTGATCgg < 2:2172920/150‑1 (MQ=255) gCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGTCGACCTGCTGCATAAACACCCTGAACCGGGATGAATTCTTTTAATGTTTTGCGTCCGGCTTCATCTGt < 2:225843/150‑1 (MQ=255) cGTTTAACCCAGCCGGG‑TAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCATCGCTATCGCGGACAAGGCGACCTGCTGCATAAACACCCTGCACCGGGAAGAATTCTTTTAATGTTTTGCGTCCGGCTTCATCGGTg > 2:416033/1‑150 (MQ=255) gTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGGCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCATAAACACCCTGAACCGGGATGAATTCTTTTAATGTTTTGCGTCCGGCTTCATCGGTGa < 1:2204064/150‑1 (MQ=255) gTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCATAAACACCCTGAACCGGGATGAATTCTTTTAATGTTTTGCGTCCGGCTTCATCGGTGa > 2:650237/1‑150 (MQ=255) ccGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACTCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCATAAACACCCTGAACCGGGATGAATTCTTTTAATGTTTTGCGTCCGGCTTCATCGGTGAACTGCg > 2:834920/1‑150 (MQ=255) ccGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCATAAACACCCTGAACCGGGATGAATTCTTTTAATGTTTTGCGTCCTGCTTCATCGGTGAACTGCg < 2:1006796/150‑1 (MQ=255) gCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCATAAACACCCTGAACCGGGATGAATTCTTTTAATGTTTTGCGTCCGGCTTCATCGGTGAACTGCGgaa < 2:1675951/150‑1 (MQ=255) cTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCATAAACACCCTGAACCGGGATGAATTCTTTTAATGTTTTGCGTCCGGCTTCATCGGTGAACTGCGgaag < 1:818379/150‑1 (MQ=255) | CCACGCGGGTTCGTCAACCAGCTCCGCGCCGGCGGGCAGGGTAGGGCCATCATTTAAGGTTACGCCATTGCGCAAGGCTTCAAGTGCGTCTTGTGTGGGAATACCTTCCACCTGCACATAATAGATTTTTCCGGTGCGTTT‑ACCCGGCTGGGTTAAACGCGCCTGCAACGCGCCGTTATTGGTCAGCACCAGCAACCCTTCGCTATCGCGGTCAAGGCGACCTGCTGCATAAACACCCTGAACCGGGATGAATTCTTTTAATGTTTTGCGTCCGGCTTCATCGGTGAACTGCGGAAG > NC_000913/1194505‑1194801 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |